研究成果　公募研究班・研究成果

「公募研究班・研究成果（2016～2017年度）」はこちら

*Corresponding author, #These authors contributed equally to this work.
実線下線は研究代表者、点線下線は研究分担者

　
有村班 打田班 遠藤班 川崎班
木羽班 木村班 西條班 清水班
寿崎班 関班 高野班 高橋班
竹澤班 玉田班 豊田班 千葉班
野田口班 藤井班 松下班 山口班

有村班

  • -2019年-
    原著論文
    Iida, J., Desaki, Y., Hata, K., Uemura, T., Yasuno, A., Islam, M., Maffei, M. E., Ozawa, R., Nakajima, T., Galis, I., and *Arimura, G. (2019) Tetranins: new putative spider mite elicitors of host plant defense. New Phytol., 224, 875-885. [プレスリリース][新聞ネット記事]
    https://nph.onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/nph.15813
    Miyamoto, T., Uemura, T., Nemoto, K., Daito, M., Nozawa, A., Sawasaki, T., and *Arimura, G. (2019) Tyrosine kinase-dependent defense responses against herbivory in Arabidopsis. Front. Plant Sci., 10, 776 (9 pages).
    https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpls.2019.00776/full
    Rim, H., Sekiguchi, S., Ozawa, R., Kainoh, Y., and *Arimura, G. (2019) Diurnal rhythm of volatile emissions from damaged Brachypodium distachyon affects the temporal preferences of tritrophic interactions. J. Plant Interact., 14, 143-150.
    https://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/17429145.2019.1602888
    Sukegawa, S. and *Arimura, G. (2019) Two arrays of defense strategies of Brassicaceae plants that eavesdrop on mint volatiles. J. Plant Interact., 14, 164-166.
    https://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/17429145.2019.1605004
    Ali, M. R. M., Uemura, T., Ramadan, A., Adachi, K., Nemoto, K., Nozawa, A., Hoshino, R., Abe, H., Sawasaki, T., and *Arimura, G. (2019) The ring-type E3 ubiquitin ligase JUL1 targets the VQ-motif protein JAV1 to coordinate jasmonate signaling. Plant Physiol., 179, 1273-1284.
    http://www.plantphysiol.org/content/179/4/1273
    Hamachi, A., Nisihara, M., Saito, S., Rim, H., Takahashi, H., Islam, M., Uemura, T., Ohnishi, T., Ozawa, R., Maffei, M. E., and *Arimura, G. (2019) Overexpression of geraniol synthase induces heat stress susceptibility in Nicotiana tabacum. Planta, 249, 235-249.
    https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs00425-018-3054-z
    Togashi, K., Goto, M., Rim, H., Hattori, S., Ozawa, R., and *Arimura, G. (2019) Mint companion plants attract the predatory mite Phytoseiulus persimilis. Sci. Rep., 9, 1704 (8 pages).
    https://www.nature.com/articles/s41598-018-38098-x
    総説論文
    Uemura, T. and *Arimura, G. (2019) Current opinions about herbivore-associated molecular patterns and plant intracellular signaling. Plant Signal. Behav., 14, e1633887.
    https://www.tandfonline.com/doi/abs/10.1080/15592324.2019.1633887
    日本語著書・解説
    有村源一郎（2019）植物の匂いを介した生態系コミュニケーションを新しい栽培技術に、バイオサイエンスとインダストリー、77、240-241.
    有村源一郎、上村卓矢、八代拓也（2019）植物アロマ成分を用いた有機栽培システムの開発とヒト健康増進効果への応用、化学と生物、57、428-432.
    有村源一郎（2019）ミントをコンパニオンプランツとして害虫防除に応用、Aroma Res.、78、130-131.
    有村源一郎（2019）植物の匂いが織りなす生き物の相互作用、青淵、4、12-14.
    有村源一郎（2019）生態系コミュニケーションを介した植物の防御応答、アグリバイオ（北隆館）、3、360-364.
    有村源一郎（2019）植物から放出される香りの機能と害虫防除への活用、Green Age、2、4-6.
    プレスリリース
    難防除害虫ナミハダニが分泌する新規エリシターの同定 ～植物と害虫の共進化の謎を紐解く～ (2019年3月25日)
    https://www.tus.ac.jp/today/20190325002.pdf
    新聞ネット記事・テレビ報道
    化学工業日報 (2019年4月28日) ハダニ分泌物に新規分子　植物の防御応答誘導
  • -2018年-
    原著論文
    Sukegawa, S., Shiojiri, K., Higami, T., Suzuki, S., and *Arimura, G. (2018) Pest management using mint volatiles to elicit resistance in soy: mechanism and application potential. Plant J., 96, 910-920. [プレスリリース][新聞ネット記事]
    https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/tpj.14077
    Nakayasu, M., Shioya, N., Shikata, M., Thagun, C., Abdelkareem, A., Okabe, Y., Ariizumi, T., Arimura, G., Mizutani, M., Ezura, H., Hashimoto, T., and *Shoji, T. (2018) JRE4 is a master transcriptional regulator of defense-related steroidal glycoalkaloids in tomato. Plant J., 94, 975-990.
    https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/tpj.13911
    Uemura, T., Yashiro, T., Oda, R., Shioya, N., Nakajima, T., Hachisu, M., Kobayashi, S., Nishiyama, C., and *Arimura, G. (2018) Intestinal anti-inflammatory activity of perillaldehyde. J. Agri. Food Chem., 66, 3443-3448. [プレスリリース][新聞ネット記事]
    https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jafc.8b00353
    日本語著書・解説
    有村源一郎、杉山暁史（2018）15章 生物間相互作用、基礎から学ぶ植物代謝生化学（水谷正治、士反伸和、杉山暁史編）、羊土社、261-269.
    有村源一郎、西原昌宏（2018）植物のたくらみ ― 香りと色の植物学、ペレ出版、159.
    上村卓矢、有村源一郎（2018）シソの香り成分「ペリルアルデヒド」の腸炎緩和機能、Aroma Research、19、221-222.
    プレスリリース
    ミントを用いた有機栽培システムの開発 ～植物間コミュニケーションを新しい栽培技術に～ (2018年9月3日)
    https://www.tus.ac.jp/today/20180903005.pdf
    シソの香りによる腸炎の緩和 ～シソを食することで腸内環境を改善～ (2018年3月26日)
    https://www.tus.ac.jp/today/20180326001.pdf
    新聞ネット記事・テレビ報道
    AEAJ No.90 (2018年12月25日) ミントの香りの忌避作用に注目　新たな栽培技術に期待
    農業共済新聞（東京） (2018年12月1日) 大豆やコマツナ　ミントの香りで防御能力が向上
    日刊県民福井 (2018年10月22日) ミント使い　害虫に強く　新しい減農薬栽培
    中日新聞 (2018年10月18日) ミント使い　害虫に強く　新しい減農薬栽培　
    東京新聞 (2018年10月15日) ミントの香り　害虫に強く　新しい減農薬栽培　
    毎日新聞 (2018年10月12日) ミントの香り　植物に害虫への防御力　東京理科大学
    日本農業新聞 (2018年9月20日) 作物の1メートル内ミント混栽　食害が大幅減　減農薬栽培への道筋
    科学新聞 (2018年9月14日) ミントを用いた有機栽培　ダイズ・コマツナで害虫防御
    NEWS SALT (2018年9月8日) ミントの香りで害虫予防と防御力アップ　新しい無農薬・減農薬栽培
    技術
    https://www.newssalt.com/26881
    化学工業日報 (2018年9月5日) ミント混栽で害虫対策　理科大　龍谷大　植物間で“脅威”伝達
    日本農業新聞 (2018年5月8日) シソ香り成分に腸炎緩和の効果　東京理科大など発見
    東京ビジネスアイ (2018年4月24日) シソ香り成分で腸炎を緩和
    日本種苗新聞 (2018年4月21日) 利用範囲が広い「匂い」　ミントと混栽で抵抗性獲得
    科学新聞 (2018年4月13日) シソの香りで腸炎緩和　理科大と東大　マウス実験で判明
    化学工業日報 (2018年4月10日) シソ香気　腸内炎症を緩和　東京理科大、トクホ開発へ
  • -2017年-
    原著論文
    Nemoto, K., Ramadan, A., Arimura, G., Imai, K., Tomii, K., Shinozaki, K., and *Sawasaki, T. (2017) Tyrosine phosphorylation of the GARU E3 ubiquitin ligase promotes gibberellin signalling by preventing GID1 degradation. Nature Commun., 8, 1004 (15 pages). [プレスリリース]
    [新聞ネット記事]
    https://www.nature.com/articles/s41467-017-01005-5
    Ozawa, R., Endo, H., Iijima, M., Sugimoto, K., Takabayashi, J., Gotoh, T., and *Arimura, G. (2017) Intraspecific variation among Tetranychid mites for ability to detoxify and to induce plant defenses. Sci. Rep., 7, 43200 (11 pages).
    https://www.nature.com/articles/srep43200
    総説論文
    *Yazaki, K., Arimura, G., and Ohnishi, T. (2017) 'Hidden' terpenoids in plants: their biosynthesis, localization and ecological roles. Plant Cell Physiol., 58, 1615-1621.
    https://academic.oup.com/pcp/article/58/10/1615/4096626
    英語著書
    Arimura, G. and Pearse, I. (2017) From the lab bench to the forest: ecology and defence mechanisms of volatile-mediated "talking trees." In "Advances in Botanical Research vol. 82. Communication between Plants, and between Plants and Other Organisms" edited by Becard, G. Elsevier, 3-17.
    https://doi.org/10.1016/bs.abr.2016.08.001
    プレスリリース
    チロシンリン酸化によるジベレリン応答の新しい制御機構を発見 - 高塩濃度環境下で植物種子が発芽できない機構が明らかに - (2017年10月13日)
    https://www.ehime-u.ac.jp/wp-content/uploads/2017/10/45cda28f9ffe80203ff5ce56b2cb6528.pdf
    新聞ネット記事・テレビ報道
    愛媛新聞 (2017年10月20日) 植物の発芽抑制タンパク質発見
    フジサンケイビジネスアイ (2017年6月21日) 植物の香りを介した植物間コミュニケーション
    BSフジ「ガリレオX」(2017年6月11、18日) 植物が会話する！？　匂いで伝えるコミュニケーション
  • -2016年-
    日本語著書・解説
    *有村源一郎、林鎬俊、助川聖 (2016) 植物の香りと生態系ネットワーク、香料　272, 37-43.
    英語著書
    Arimura, G. and Maffei, M. E. (2016) Plant specialized metabolism: genomics, biochemistry, and biological functions. CRC Press, Boca Raton, FL, USA, 376.
    Arimura, G. and Maffei, M. E. (2016) Introduction to plant specialized metabolism. In "Plant Specialized Metabolism: Genomics, Biochemistry, and Biological Functions" edited by Arimrua, G. and Maffei, M. E. CRC Press, 1-7.
    Arimura, G., Matsui, K., Koeduka, T., and Holopainen, J. K. (2016) Biosynthesis and regulation of plant volatiles, and their functional roles in ecosystem interactions and global environmental changes. In "Plant Specialized Metabolism: Genomics, Biochemistry, and Biological Functions" edited by Arimrua, G. and Maffei, M. E. CRC Press, 185-237.

打田班

  • -2019年-
    原著論文
    *Hirakawa, Y., Uchida, N. Yamaguchi, Y. L., Tabata, R., Ishida, S., Ishizaki, K., Nishihama, R., Kohchi, T., *Sawa, S., and *Bowman, J. L. (2019) Control of proliferation in the haploid meristem by CLE peptide signaling in Marchantia polymorpha. PLOS Genet., 15, e1007997 (20 pages).
    https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1007997
    総説論文
    *Uchida, N. and Torii, K. U. (2019) Stem cells within the shoot apical meristem: identity, arrangement and communication. Cell. Mol. Life Sci., 76, 1067-1080.
    https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs00018-018-2980-z
    日本語著書・解説
    高橋宏二、萩原伸也、鳥居啓子、*打田 直行（2019）オーキシン応答の自在操作を実現する人工ホルモン・受容体ペアの創成 ～植物ホルモン応答の自在操作に向けた新展開～、化学と生物、57、80-87.

川崎班

  • -2019年-
    原著論文
    Yamaguchi, K., Mine, A., Desaki, Y., Fujio, K., Takeda, A., and *Kawasaki, T. (2019) Variable dependencies of PBL27 and MAPKKK5 in chitin-induced MAPK activation in Arabidopsis: Types of chitin and plant growth conditions matter. Plant Cell, Supplemental comment (4 pages).
    http://bit.ly/31XKE3S
  • -2018年-
    原著論文
    *Yamaguchi, K., Yoshimura, Y., Nakagawa, S., Mezaki, H., Yoshimura, S., and *Kawasaki, T. (2018) OsDRE2 contributes to chitin-triggered response through its interaction with OsRLCK185. Biosci. Biotechnol. Biochem., 83, 281-290.
    https://doi.org/10.1080/09168451.2018.1543012
  • -2016年-
    原著論文
    #Yamada, K., #Yamaguchi, K., Shirakawa, T., Nakagami, H., Mine, A., Ishikawa, K., Fujiwara, M., Narusaka, M., Narusaka, Y., Ichimura, K., Kobayashi, Y., Matsui, H., Nomura, Y., Nomoto, M., Tada, Y., Fukao, Y., Fukamizo, T., Tsuda, K., Shirasu, K., Shibuya, N., and *Kawasaki, T. (2016) The Arabidopsis CERK1-associated kinase PBL27 connects chitin perception to MAPK activation. EMBO J., 35, 2468-2483. [プレスリリース]
    http://emboj.embopress.org/content/35/22/2468
    プレスリリース
    農学部バイオサイエンス学科教授　川﨑努らの研究チーム　植物が病原菌感染を検知し、防御遺伝子群を活性化する仕組みを世界で初めて解明 (2016年9月27日)
    http://www.news2u.net/releases/148813
    新聞ネット記事・テレビ報道
    読売新聞 (2016年9月29日)朝刊　植物病原菌 撃退たんぱく質　近大チーム特定 免疫反応で情報伝達
    産経新聞 (2016年9月28日)夕刊　植物の病気防止 仕組みを解明　近大チーム エコな農薬に期待
    産経WEST (2016年9月27日) 近大研究チーム、植物が病気防ぐ仕組み解明　欧州科学誌に発表
    http://www.sankei.com/west/news/160927/wst1609270081-n1.html

木羽班

  • -2019年-
    原著論文
    Yoshida, S., Kim, S., Wafula, E. K., Tanskanen, J., Kim, Y. M., Honaas, L., Yang, Z., Spallek, T., Conn, C. E., Ichihashi, Y., Cheong, K., Cui, S., Der, J. P., Gundlach, H., Jiao, Y., Hori, C., Ishida, J. K., Kasahara, H., Kiba, T., Kim, M. S., Koo, N., Laohavisit, A., Lee, Y. H., Lumba, S., McCourt, P., Mortimer, J. C., Mutuku, J. M., Nomura, T., Sekimoto, Y. S., Seto, Y., Wang, Y., Wakatake, T., Sakakibara, H., Demura, T., Yamaguchi, S., Yoneyama, K., Manabe, R., Nelson, D. C., Schulman, A. H., Timko, M. P., dePamphilis, C. W., Choi, D., and *Shirasu, K. (2019) Genome sequence of Striga asiatica provides insight into the evolution of plant parasitism. Curr. Biol., 29, 3041-3052.
    https://doi.org/10.1016/j.cub.2019.07.086
    *Kiba, T., Takebayashi, Y., Kojima, M., and *Sakakibara, H. (2019) Sugar-induced de novo cytokinin biosynthesis contributes to Arabidopsis growth under elevated CO2. Sci. Rep., 9, 7765 (15 pages).
    https://www.nature.com/articles/s41598-019-44185-4
    *Toda, E., Koiso, N., Takebayashi, A., Ichikawa, M., Kiba, T., Osakabe, K., Osakabe, Y., Sakakibara, H., Kato, N., and *Okamoto, T. (2019) An efficient DNA- and selectable-marker-free genome-editing system using zygotes in rice. Nature Plants, 5, 363-368.
    [プレスリリース]https://www.nature.com/articles/s41477-019-0386-z
    総説論文
    Okamoto, Y., Suzuki, T., Sugiura, D., Kiba, T., Sakakibara, H., and *Hachiya, T. (2019) Shoot nitrate underlies a perception of nitrogen satiety to trigger local and systemic signaling cascades in Arabidopsis thaliana. Soil Sci. Plant Nutr., 65, 56-64.
    https://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/00380768.2018.1537643
    プレスリリース
    植物受精卵でのゲノム編集に成功 - 増収、耐病性、品質改良など、イネ科作物への応用に期待 - (2019年3月26日)
    http://www.riken.jp/pr/press/2019/20190326_2/
  • -2018年-
    原著論文
    Yamaguchi, N., Huang, J., Tatsumi, Y., Abe, M., Sugano, S. S., Kojima, M., Takebayashi, Y., Kiba, T., Yokoyama, R., Nishitani, K., Sakakibara, H., and *Ito, T. (2018) Chromatin-mediated feed-forward auxin biosynthesis in floral meristem determinacy. Nature Commun., 9, 5290 (15 pages).
    https://www.nature.com/articles/s41467-018-07763-0
    Xu, Y., Prunet, N., Gan, E.-S., Wang, Y., Stewart, D., Wellmer, F., Huang, J., Yamaguchi, N., Tatsumi, Y., Kojima, M., Kiba, T., Sakakibara, H., Jack, T. P., Meyerowitz, E. M., and *Ito, T. (2018) SUPERMAN regulates floral whorl boundaries through control of auxin biosynthesis. EMBO J., 37, e97499 (14 pages).
    https://www.embopress.org/doi/10.15252/embj.201797499
    *Kiba, T., Inaba, J., Kudo, T., Ueda, N., Konishi, M., Mitsuda, N, Takiguchi, Y., Kondou, Y., Yoshizumi, T., Ohme-Takagi, M., Matsui, M., Yano, K., Yanagisawa, S., and Sakakibara, H. (2018) Repression of nitrogen-starvation responses by members of the Arabidopsis GARP-type transcription factor NIGT1/HRS1 subfamily. Plant Cell, 30, 925-945.
    http://www.plantcell.org/content/30/4/925
    #Maeda, Y., #Konishi, M., Kiba, T., Sakuraba, Y., Sawaki, N., Kurai, T., Ueda, Y., Sakakibara, H., and *Yanagisawa, S. (2018) A NIGT1-centred transcriptional cascade regulates nitrate signalling and incorporates phosphorus starvation signals in Arabidopsis. Nature Commun., 9, 1376 (14 pages).
    https://www.nature.com/articles/s41467-018-03832-6
    総説論文
    *Kiba, T. (2018) International symposium on long-distance signaling in plants. Plant Cell Physiol., 59, 1697-1699.
    https://academic.oup.com/pcp/article/59/9/1697/5060944
  • -2017年-
    原著論文
    Pudasaini, A., Shim, J. S., Song, Y. H., Shi, H., Kiba, T., Somers, D. E., Imaizumi, T., and *Zoltowski, B. D. (2017) Kinetics of the LOV domain of ZEITLUPE determine its circadian function in Arabidopsis. eLIFE, 6, e21646 (27 pages).
    https://elifesciences.org/articles/21646
    Osugi, A., Kojima, M., Takebayashi, Y., Ueda, N., Kiba, T., and *Sakakibara, H. (2017) Systemic transport of trans-zeatin and its precursor have differing roles in Arabidopsis shoots. Nature Plants, 3 , 17112. [プレスリリース]
    https://www.nature.com/articles/nplants2017112
    #Spallek, T., #Melnyk, C. W., Wakatake, T., Zhang, J., Sakamoto, Y., Kiba, T., Yoshida, S., Matsunaga, S., Sakakibara, H., and *Shirasu, K. (2017) Interspecies hormonal control of host root morphology by parasitic plants. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 114, 5283-5288.
    http://www.pnas.org/content/114/20/5283
    プレスリリース
    サイトカイニン輸送による植物成長促進制御の新たなしくみを発見 (2017年7月25日)
    http://www.nagoya-u.ac.jp/about-nu/public-relations/researchinfo/upload_images/20170725_agr_2.pdf
  • -2016年-
    原著論文
    *Kiba, T. and Henriques, R. (2016) Assessing protein stability under different light and circadian conditions. Methods Mol. Biol., 1398, 141-152.
    https://link.springer.com/protocol/10.1007%2F978-1-4939-3356-3_13
    *Nakamichi, N., Takao, S., Kudo, T., Kiba, T., Wang, Y., Kinoshita, T., and Sakakibara, H. (2016) Improvement of Arabidopsis biomass and cold, drought, and salinity stress tolerance by modified circadian clock-associated PSEUDO-RESPONSE REGULATORs. Plant Cell Physiol., 57, 1085-1097.
    http://pcp.oxfordjournals.org/content/57/5/1085
    総説論文
    *Kiba, T. and *Krapp, A. (2016) Plant nitrogen acquisition under low availability: regulation of uptake and root architecture. Plant Cell Physiol., 57, 707-714.
    https://academic.oup.com/pcp/article/57/4/707/2461115
    日本語著書・解説
    榊原均、木羽隆敏（2016）C4モデル植物Staria viridisの研究ツールの整備、植物科学の最前線、BSJ Review　7, 42-46.
    木羽隆敏、榊原均（2016）サイトカイニンの生合成と輸送、植物の生長調節　51, 24-29.

木村班

  • -2020年-
    原著論文
    　　　　　　　　
    Hirano, T., Kimura, S., Sakamoto, T., Okamoto, A., Nakayama, T., Matsuura, T., Ikeda, Y., Takeda, S., Suzuki, Y., Ohshima, I., and *Sato, M. H. (2020) Reprograming of the developmental program of Rhus javanica during initial stage of gall induction by Schlechtendalia chinensis. Front. Plant Sci., 11, 471 (13pages).
    https://www.frontiersin.org/article/10.3389/fpls.2020.00471
    *Ishida, T., Suzuki, R., Nakagami, S., Kuroha, T., Sakamoto, S., Nakata, M. T., Yokoyama, R., Kimura, S., Mitsuda, N., Nishitani, K., and Sawa, S. (2020) Root-knot nematodes modulate cell walls during root-knot formation in Arabidopsis roots. J. Plant Res., 133, 419-428.
    https://link.springer.com/article/10.1007/s10265-020-01186-z
    Yoshiyama, K. O., Aoshima, N., Takahashi, N., Sakamoto, T., Hiruma, K., Saijo, Y., Hidema, J., Umeda, M., and *Kimura, S. (2020) SUPPRESSOR OF GAMMA RESPONSE1 acts as a regulator coordinating crosstalk between DNA damage response and immune response in Arabidopsis thaliana. Plant Mol. Biol., 103, 321-340.
    https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs11103-020-00994-0
    Li, G., Hu, S., Yang, J., Zhao, X., Kimura, S., Schultz, E. A. and *Hou, H. (2020) Establishment of an Agrobacterium mediated transformation protocol for the detection of cytokinin in the heterophyllous plant Hygrophila difformis (Acanthaceae). Plant Cell Rep., 39, 737-750.
    https://link.springer.com/article/10.1007/s00299-020-02527-x
    Yamamoto, M., Uji, S., Sugiyama, T., Sakamoto, T., Kimura, S., Endo, T. and *Nishikawa, S. I. (2020) ERdj3B-mediated quality control maintains anther development at high temperatures. Plant Physiol., 182, 1979-1990.
    http://www.plantphysiol.org/content/182/4/1979.long
    Hanamata, S., Sawada, J., Ono, S., Ogawa, K., Fukunaga, T., Nonomura, K. I., Kimura, S., *Kurusu T., and *Kuchitsu, K. (2020) Impact of autophagy on gene expression and tapetal programmed cell death during pollen development in rice. Front. Plant Sci., 11, 172 (19 pages).
    https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpls.2020.00172/full
    Amano, R., Nakayama, H., Momoi, R., Omata, E., Gunji, S., Takebayashi, Y., Kojima, M., Ikematsu, S., Ikeuchi, M., Iwase, A., Sakamoto, T., Kasahara, H., Sakakibara, H., Ferjani, A., and *Kimura, S. (2020) Molecular Basis for Natural Vegetative Propagation via Regeneration in North American Lake Cress, Rorippa aquatica (Brassicaceae). Plant Cell Physiol. , 61, 353-369.
    https://academic.oup.com/pcp/article/61/2/353/5607307
    *Gohari, G., Mohammadi, A., *Akbari, A., Panahirad, S., Dadpour, M. R., Fotopoulos, V., and Kimura, S. (2020) Titanium dioxide nanoparticles (TiO2 NPs) promote growth and ameliorate salinity stress effects on essential oil profile and biochemical attributes of Dracocephalum moldavica. Sci. Rep., 10, 912 (14pages).
    https://www.nature.com/articles/s41598-020-57794-1
  • -2018年-
    原著論文
    Yoshiyama, K. O. and *Kimura, S. (2018) Ser-Gln sites of SOG1 are rapidly hyperphosphorylated in response to DNA double-strand breaks. Plant Signal. Behav., e1477904.
    https://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/15592324.2018.1477904
    Nakayama, H., Sakamoto, T., Okegawa, Y., Kaminoyama, K., Fujie, M., Ichihashi, Y., Kurata, T., Motohashi, K., Al-Shehbaz, I., Sinha, N., and *Kimura, S. (2018) Comparative transcriptomics with self-organizing map reveals cryptic photosynthetic differences between two accessions in North American Lake cress. Sci. Rep., 8, 3302.
    https://www.nature.com/articles/s41598-018-21646-w
    #Uchida, N., #Takahashi, K., Iwasaki, R., Yamada, R., Yoshimura, M., Endo, T. A., Kimura, S., Zhang, H., Nomoto, M., Tada, Y., Kinoshita, T., Itami, K., *Hagihara, S., and *Torii, K. U. (2018) Chemical hijacking of auxin signaling with an engineered auxin-TIR1 pair. Nature Chem. Biol., 14, 299-305.
    https://www.nature.com/articles/nchembio.2555
    総説論文
    *Sakamoto, T. and *Kimura, S. (2018) Plant temperature sensors. Sensors, 18 , 4365 (11 pages).
    https://www.mdpi.com/1424-8220/18/12/4365/htm
    新聞ネット記事・テレビ報道
    京都新聞（2018年2月21日）夕刊　植物のDNA修復解明
  • -2016年-
    日本語著書・解説
    坂本智昭、*木村成介（2016）Rorippa aquatica遺伝子情報データベースの構築、京都産業大学総合学術研究所報　11, 105-113.
    天野瑠美、坂本智昭、*木村成介（2016）アブラナ科植物Rorippa aquaticaにみられる葉断面からの栄養繁殖条件の検討、京都産業大学総合学術研究所報　11, 115-121.

西條班

  • -2019年-
    総説論文
    *Saijo, Y. and Loo, E. P. (2019) Plant immunity in signal integration between biotic and abiotic stress responses. New Phytol., 225, 87-104.
    https://doi.org/10.1111/nph.15989
    英語著書
    #Tajima, Y., #Loo, E. P., and *Saijo, Y. (2019) Plant physiological and molecular mechanisms in cross-regulation of biotic-abiotic stress responses. In “Priming-Mediated Stress and Cross-Stress Tolerance in Crop Plants” edited by Hossain, M. A., et al. Elsevier, 21-34.
  • -2018年-
    原著論文
    Shinya, T., Yasuda, S., Hyodo, K., Tani, R., Hojo, Y., Fujiwara, Y., Hiruma, K., Ishizaki, T., Fujita, Y., *Saijo, Y., and *Galis, I. (2018) Integration of danger peptide signals with herbivore‐associated molecular pattern signaling amplifies anti‐herbivore defense responses in rice. Plant J., 94, 626-637.
    https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/tpj.13883
    Ogita, N., Okushima, Y., Tokizawa, M., Yamamoto, Y. Y., Tanaka, M., Seki, M., Makita, Y., Matsui, M., Okamoto-Yoshiyama, K., Sakamoto, T., Kurata, T., Hiruma, K., Saijo, Y., Takahashi, N., and Umeda, M. (2018) Identifying the target genes of SUPPRESSOR OF GAMMA RESPONSE 1, a master transcription factor controlling DNA damage response in Arabidopsis. Plant J., 94, 439-453. [プレスリリース]
    https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/tpj.13866
    *Saijo, Y., Loo, E. P., and Yasuda, S. (2018) Pattern recognition receptors and signaling in plant-microbe interactions. Plant J., 93, 592-613.
    https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/tpj.13808
    総説論文
    *Saijo, Y., Loo, E. P., and Yasuda, S. (2018) Pattern recognition receptors and signaling in plant-microbe interactions. Plant J., 93, 592-613.
    https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/tpj.13808
    日本語著書・解説
    藤雅子、清水幸子、西條雄介（2018）植物によるDAMP の認識と免疫制御、アグリバイオ（北隆館）、2 (9) 73-75.
    藤雅子、西條雄介（2018） パターン認識受容体を活用した高持続性の植物防御技術の開発に向けて、植物の生長調節、53 (1) 43-52.
    田島由理、西條雄介（2018）植物免疫プライミングのエピジェネティックな制御、アグリバイオ（北隆館）、2 (2) 90-92.
    プレスリリース
    DNAに傷が入った時に働く植物独自の遺伝子群を解明 ～ 病原菌の感染など環境のストレスに強い農作物の作出に期待 ～ (2018年2月21日)
    http://bsw3.naist.jp/research/index.php?id=1620

清水班

  • -2018年-
    原著論文
    *#Song, Y. H., #Kubota, A., Kwon, M. S., Covington, M. F., Lee, N., Taagen, E. R., Cintron, D. L., Hwang, D. Y., Akiyama, R., Hodge, S. K., Huang, H., Nguyen, N. H., Nusinow, D. A., Millar, A. J., Shimizu, K. K., and *Imaizumi, T. (2018) Molecular basis of flowering under natural long-day conditions in Arabidopsis. Nature Plants, 4, 824-835.
    https://www.nature.com/articles/s41477-018-0253-3
    プレスリリース
    野外環境における植物の開花メカニズムを解明～作物のより正確な開花・収穫時期の制御へ前進～(2018年9月25日)
    https://www.yokohama-cu.ac.jp/news/2018/201809shimizu_np.html

寿崎班

  • -2018年-
    原著論文
    *Yoro, E., Nishida, H., Ogawa-Ohnishi, M., Yoshida, C., Suzaki, T., Matsubayashi, Y., and *Kawaguchi, M. (2018) PLENTY, a hydroxyproline O-arabinosyltransferase, negatively regulates root nodule symbiosis in Lotus japonicus. J. Exp. Bot., 70, 507-517.
    https://academic.oup.com/jxb/article/70/2/507/5142751
    Ohta, M., Sato, A., Renhu, N., Yamamoto, T., Oka, N., Zhu, J. K., Tada, Y., Suzaki, T., and *Miura, K. (2018) MYC-type transcription factors, MYC67 and MYC70, interact with ICE1 and negatively regulate cold tolerance in Arabidopsis. Sci. Rep., 8, 11622 (12 pages).
    https://www.nature.com/articles/s41598-018-29722-x
    Mori, K., Renhu, N., Naito, M., Nakamura, A., Shiba, H., Yamamoto, T., Suzaki, T., *Iida H., and *Miura, K. (2018) Ca2+-permeable mechanosensitive channels MCA1 and MCA2 mediate cold-induced cytosolic Ca2+ increase and cold tolerance in Arabidopsis. Sci. Rep., 8, 550 (10 pages).
    https://www.nature.com/articles/s41598-017-17483-y
    Nishida, H., Tanaka, S., Handa, Y., Ito, M., Sakamoto, Y., Matsunaga, S., Betsuyaku, S., Miura, K., Soyano, T., Kawaguchi, M., and *Suzaki, T. (2018) A NIN-LIKE PROTEIN mediates nitrate-induced control of root nodule symbiosis in Lotus japonicus. Nature Commun., 9, 499 (14 pages). [プレスリリース] [新聞ネット記事]
    https://www.nature.com/articles/s41467-018-02831-x
    総説論文
    Nishida, H. and *Suzaki, T. (2018) Two negative regulatory systems of root nodule symbiosis: how are symbiotic benefits and costs balanced? Plant Cell Physiol., 59, 1733-1738.
    https://academic.oup.com/pcp/advance-article/doi/10.1093/pcp/pcy102/5025671
    Nishida, H. and *Suzaki, T. (2018) Nitrate-mediated control of root nodule symbiosis. Curr. Opin. Plant Biol., 44, 129-136.
    https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1369526618300104
    プレスリリース
    根粒菌との共生にかけるマメ科植物のエネルギー節約術 ～窒素栄養に応じて根粒共生を制御する仕組みの発見～ (2018年2月5日)
    https://www.jst.go.jp/pr/announce/20180205-2/index.html
    新聞ネット記事・テレビ報道
    科学新聞（2018年2月16日）窒素栄養有無に応じて根粒菌との共生を制御 ～マメ科植物が生き抜く術
    解明～
  • -2016年-
    原著論文
    Nishida, H., Handa, Y., Tanaka, S., *Suzaki, T., and *Kawaguchi, M. (2016) Expression of the CLE-RS3 gene suppresses root nodulation in Lotus japonicus. J. Plant Res., 129, 909-919.
    http://link.springer.com/article/10.1007%2Fs10265-016-0842-z
    Pfeiffer, A., Janocha, D., Dong, Y., Medzihradszky, A., Schöne, S., Daum, G., Suzaki, T., Forner, J., Langenecker, T., Rempel, E., Schmid, M., Wirtz, M., Hell, R., and *Lohmann, J. U. (2016) Integration of light and metabolic signals for stem cell activation at the shoot apical meristem. eLife, 5, e17023 (21 pages).
    https://elifesciences.org/content/5/e17023
    日本語著書・解説
    寿崎拓哉、西田帆那 (2016) 根粒形成における負の制御系、BSJ Review 7E, 230-240.

関班

  • -2019年-
    原著論文
    *Rymen, B., Kawamura, A., Lambolez, A., Inagaki, S., Takebayashi, A., Iwase, A., Sakamoto, Y., Sako, K., Favero, D. S., Ikeuchi, M., Suzuki, T., Seki, M., Kakutani, T., Roudier, F., and *Sugimoto, K. (2019) Histone acetylation orchestrates wound-induced transcriptional activation and cellular reprogramming in Arabidopsis. Commun. Biol., 2, 404 (15 pages).
    https://www.nature.com/articles/s42003-019-0646-5
    Ueda, M., Matsui, A., Watanabe, S., Kobayashi, M., Saito, K., Tanaka, M., Ishida, J., Kusano, M., Seo, M., and *Seki, M. (2019) Transcriptome analysis of the hierarchical response of HDAC proteins that respond in an antagonistic manner to salinity stress. Front. Plant Sci., 10, 1323 (11 pages).
    https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpls.2019.01323/full
    Akter, A., Takahashi, S., Deng, W., Shea, D.J., Taylor, J. M., Shimizu, M., Miyaji, N., Osabe, K., Nishida, N., Suzuki, Y., Helliwell, C. A., Seki, M., Peacock, W. J., Dennis, E. S., and *Fujimoto, R. (2019) The histone modification H3 lysine 27 tri-methylation has conserved gene regulatory roles in the triplicated genome of Brassica rapa L. DNA Res., 26, 433-443.
    https://academic.oup.com/dnaresearch/article/26/5/433/5588861
    #Kurita, K., #Sakamoto, Y., Naruse, S., Matsunaga, T. M., Arata, H., Higashiyama, T., Habu, Y., Utsumi, Y., Utsumi, C., Tanaka, M., Takahashi, S., Kim, J. M., Seki, M., Sakamoto, T., and *Matsunaga, S. (2019) Intracellular localization of histone deacetylase HDA6 in plants. J. Plant Res., 132, 629-640.
    https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs10265-019-01124-8
    #Shea, D. J., #Nishida, N., Takada, S., Itabashi, E., Takahashi, S., Akter, A., Miyaji, N., Osabe, K., Mehraj, H., Shimizu, M., Seki, M., Kakizaki, T., Okazaki, K., Dennis, E. S., and *Fujimoto, R. (2019) Long noncoding RNAs in Brassica rapa L. following vernalization. Sci. Rep., 9, 9302 (11 pages).
    https://www.nature.com/articles/s41598-019-45650-w
    *Sakamoto, K., Ogiwara, N., Kaji, T., Sugimoto, Y., Ueno, M., Sonoda, M., Matsui, A., Ishida, J., Tanaka, M., Totoki, Y., Shinozaki, K., and Seki, M. (2019) Transcriptome analysis of soybean (Glycine max) root genes differentially expressed in rhizobial, arbuscular mycorrhizal, and dual symbiosis. J. Plant Res., 132, 541-568.
    https://link.springer.com/article/10.1007/s10265-019-01117-7
    Utsumi, Y., Utsumi, C., Tanaka, M., Ha, C. V., Takahashi, S., Matsui, A., Matsunaga, T. M., Matsunaga, S., Kanno, Y., Seo, M., Okamoto, Y., Moriya, E., and *Seki, M. (2019) Acetic acid treatment enhances the drought avoidance in cassava (Manihot esculenta Crantz). Front. Plant Sci., 10, 521 (12 pages).
    https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpls.2019.00521/full
    Takahashi, N., Ogita, N., Takahashi, T., Taniguchi, S., Tanaka, M., Seki, M., and *Umeda, M. (2019) A regulatory module controlling stress-induced cell cycle arrest in Arabidopsis. eLife, 8, e43944 (27 pages).
    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6449083/
    #Ishihara, H., *#Sugimoto, K., Tarr, P. T., Temman, H., Kadokura, S., Inui, Y., Sakamoto, T., Sasaki, T., Aida, M., Suzuki, T., Inagaki, S., Morohashi, K., Seki, M., Kakutani, T., Meyerowitz, E. M., and *Matsunaga, S. (2019) Primed histone demethylation regulates shoot regenerative competency. Nature Commun., 10, 1786 (15 pages).
    https://www.nature.com/articles/s41467-019-09386-5
    Patanun, O., Viboonjun, U., Punyasuk, N., Thitamadee, S., Seki, M., and *Narangajavana, J. (2019) Cassava microRNAs and storage root development. Biologia Plantarum, 63, 193-199.
    https://bp.ueb.cas.cz/artkey/bpl-201901-0022_cassava-micrornas-and-storage-root-development.php
    総説論文
    Ueda, M. and *Seki, M. (2019) Histone modifications form epigenetic regulatory networks to regulate abiotic stress response. Plant Physiol., in press. https://doi.org/10.1104/pp.19.00988
    Bashir, K., Matsui, A., Rasheed, S., and *Seki, M. (2019) Recent advances in the characterization of plant transcriptomes in response to drought, salinity, heat and cold stress. F1000 Faculty Reviews, in press.
    https://f1000research.com/articles/8-658/v1
    *Ohtani, M., Kurihara, Y., Seki, M., and Crespi, M. (2019) RNA-mediated plant behavior. Plant Cell Physiol., 60, 1893-1896.
    https://doi.org/10.1093/pcp/pcz168
    Matsui, A., Nakaminami, K., and *Seki, M. (2019) Biological function of changes in RNA metabolism in plant adaptation to abiotic stress. Plant Cell Physiol., 60, 1897-1905.
    https://academic.oup.com/pcp/advance-article-abstract/doi/10.1093/pcp/pcz068/5486301?redirectedFrom=fulltext
    *Seki, M. (2019) Editorial. Plant Mol. Biol., 100, 1-2.
    https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs11103-019-00858-2
    *Matsui, A. and *Seki, M. (2019) The involvement of long noncoding RNAs in response to plant stress. Methods Mol. Biol., 1933, 151-171.
    https://link.springer.com/protocol/10.1007%2F978-1-4939-9045-0_8
    日本語著書・解説
    *磯貝彰、堤伸浩、浅見忠男、関原明、西條雄介、内藤健、南澤究（2019）植物科学は農業生産へいかに貢献するか～植物科学のこれから～　特集記事　ワークショップ報告、育種学研究、21 (1) 49-54.
    https://doi.org/10.1270/jsbbr.21.W01
    *浅見忠男、安藤康雄、森川正章、Rahul Jog、三輪京子、池田成志、松井章浩、佐古香織、上田実、Khurram Bashir、砂押裕司、Sultana Rasheed、田中真帆、石田順子、金鍾明、Huong Mai Nguyen、吉田稔、土生芳樹、関原明、*野尻秀昭、*妹尾啓史（2019）2018年神奈川大会　シンポジウムの概要．日本農芸化学会との合同企画シンポジウム「植物・微生物機能の解析・制御と食糧・バイオマス生産への応用展開」、土壌肥料学会和文誌、90 (1) 82-87.
  • -2018年-
    原著論文
    Sako, K., Sunaoshi, Y., Tanaka, M., Matsui, A., and *Seki, M. (2018) The duration of high-salinity stress tolerance in Arabidopsis thaliana. Plant Signal. Behav., 13, e1500065 (3 pages).
    https://doi.org/10.1080/15592324.2018.1500065
    Ueda, M., Matsui, A., Nakamura, T., Abe, T., Sunaoshi, Y., Shimada, H., and *Seki, M. (2018) Versatility of HDA19-deficiency in increasing the tolerance of Arabidopsis to different environmental stresses. Plant Signal. Behav., 13, e1475808 (4 pages).
    https://doi.org/10.1080/15592324.2018.1475808
    Nakaminami, K., Okamoto, M., Higuchi-Takeuchi, M., Yoshizumi, T., Yamaguchi, Y., Fukao, Y., Shimizu, M., Ohashi, C., Tanaka, M., Matsui, M., Shinozaki, K., *Seki, M., and *Hanada, K.(2018) AtPep3 is a hormone-like peptide that plays a role in salinity stress tolerance of plants. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 115, 5810-5815. [プレスリリース]
    http://www.pnas.org/content/115/22/5810
    #Rasheed, S., #Bashir, K., Kim, J. M., Ando, M., Tanaka, M., and *Seki, M. (2018) The modulation of acetic acid pathway genes in Arabidopsis improves survival under drought stress. Sci. Rep., 8, 7831 (15 pages).
    https://www.nature.com/articles/s41598-018-26103-2
    Ogita, N., Okushima, Y., Tokizawa, M., Yamamoto, Y. Y., Tanaka, M., Seki, M., Makita, Y., Matsui, M., Okamoto-Yoshiyama, K., Sakamoto, T., Kurata, T., Hiruma, K., Saijo, Y., Takahashi, N., and Umeda, M. (2018) Identifying the target genes of SUPPRESSOR OF GAMMA RESPONSE 1, a master transcription factor controlling DNA damage response in Arabidopsis. Plant J., 94, 439-453.
    https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/tpj.13866
    Nguyen, H. M., Sako, K., Matsui, A., Ueda, M., Tanaka, M., Ito, A., Nishino, N., Yoshida, M., and *Seki, M. (2018) Transcriptomic analysis of Arabidopsis thaliana plants treated with the Ky-9 and Ky-72 histone deacetylase inhibitors. Plant Signal. Behav., 13, e1448333 .
    https://www.tandfonline.com/doi/abs/10.1080/15592324.2018.1448333
    英語著書
    Ueda, M., Sako, K., and *Seki, M. (2018) Epigenetic regulations and modifications for enhanced salinity stress tolerance in plants. In "Salinity Responses and Tolerance in Plants, Volume 2: Exploring RNAi, Genome Editing and Systems Biology" edited by Kumar, V., Wani, S. H., Suprasanna, P., and Tran, L.-S. P. Springer, 77-91.
    *Nakaminami, K., and Seki, M. (2018) RNA regulation in plant cold stress response. In "Survival Strategies in Extreme Cold and Desiccation: Adaptation Mechanisms and their Application" edited by Drs. Iwaya-Inoue, M., Uemura, M. and Sakurai, M. Springer Japan, 1081, 23-44.
    Bashir, K., Rasheed, S., Matsui, A., Iida, K., Tanaka, M., and *Seki, M. (2018) Monitoring transcriptomic changes in soil-grown roots and shoots of Arabidopsis thaliana subjected to a progressive drought stress, In "Methods in Molecular Biology - Root Development" edited by Barbez, E. and Ristova, D. Humana Press, 1761, 223-230.
    日本語著書・解説
    上田実、佐古香織、伊藤昭博、吉田稔、*関原明（2018）ヒストン脱アセチル化酵素が担う植物の環境ストレス応答制御　－植物をストレスに強くする標的タンパク質の発見－、化学と生物、56 (12) 797-803.
    プレスリリース
    塩耐性を強化する植物ペプチドの発見 －人工合成のペプチド添加で塩耐性を強化することに成功－(2018年5月17日)
    http://www.riken.jp/pr/press/2018/20180517_1/

高野班

  • -2019年-
    原著論文
    Pastorczyk, M., Kosaka, A., Pi?lewska-Bednarek, M., Lopez, G., Frerigmann, H., Ku?ak, K., Glawischnig, E., Molina, A., Takano, Y., and *Bednarek, P. (2019) The role of CYP71A12 monooxygenase in pathogen-triggered tryptophan metabolism and Arabidopsis immunity. New Phytol, 225, 400-412.
    https://doi.org/10.1111/nph.16118
    #Isozumi, N., #Inoue, Y., #Imamura, T., *Mori, M., *Takano, Y., and *Ohki, S. (2019) Ca2+-dependent interaction between calmodulin and CoDN3, an effector of Colletotrichum orbiculare. Biochem. Biophys. Res. Commun., 514, 803-808.
    https://doi.org/10.1016/j.bbrc.2019.05.007
    Irieda, H., Inoue, Y., Mori, M., Yamada, K., Oshikawa, Y., Saitoh, H., Uemura, A., Terauchi, R., Kitakura, S., Kosaka, K., Singkaravanit-Ogawa, S., and *Takano, Y. (2019) Conserved fungal effector suppresses PAMP-triggered immunity by targeting plant immune kinases. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 116, 496-505. [プレスリリース] [新聞ネット記事]
    https://www.pnas.org/content/116/2/496
    プレスリリース
    広範囲の植物病原糸状菌が分泌する感染因子の機能を解明 －エフェクターNIS1は植物の病原体認識システムの中枢を攻撃する－(2019年1月8日)
    http://www.kyoto-u.ac.jp/ja/research/research_results/2018/181224_1.html
  • -2018年-
    総説論文
    Kosaka, A. and *Takano, Y. (2018) Nonhost resistance of Arabidopsis thaliana against Colletotrichum species. J. Gen. Plant Pathol., 84, 305-311.
    https://link.springer.com/article/10.1007/s10327-018-0799-y
    新聞ネット記事・テレビ報道
    京都新聞（2018年12月31日）22面　カビ分泌タンパク質　農作物の免疫阻害　京大グループ仕組み解明

高橋班

  • -2019年-
    原著論文
    Ishikawa, S., Barrero, J. M., Takahashi, F., Nakagami, H., Peck, S. C., Gubler, F., Shinozaki, K., and *Umezawa, T. (2019) Comparative phosphoproteomic analysis reveals a decay of ABA signaling in barley embryos during after-ripening. Plant Cell Physiol., 60, 2758?2768.
    https://doi.org/10.1093/pcp/pcz163
    Sato, H., Suzuki, T., Takahashi, F., Shinozaki, K., and *Yamaguchi-Shinozaki, K. (2019) NF-YB2 and NF-YB3 have functionally diverged and differentially induce drought and heat stress-specific genes. Plant Physiol., 180, 1677-1690.
    https://doi.org/10.1104/pp.19.00391
    #Shinozawa, A., #Otake, R., Takezawa, D., Umezawa, T., Komatsu, K., Tanaka, K., Amagai, A., Ishikawa, S., Hara, Y., Kamisugi, Y., Cuming, A. C., Hori, K., Ohta, H., Takahashi, F., Shinozaki, K., Hayashi, T., Taji, T., and *Sakata, Y. (2019) SnRK2 protein kinases represent an ancient system in plants for adaptation to a terrestrial environment. Commun. Biol., 2, 30 (13 pages).
    https://www.nature.com/articles/s42003-019-0281-1
    Ishikawa, S., Barrero, J., Takahashi, F., Peck, S., Gubler, F., Shinozaki, K., and *Umezawa, T. (2019) Comparative phosphoproteomic analysis of barley embryos with different dormancy during imbibition. Int. J. Mol. Sci., 20, 451 (15 pages).
    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6359383/
    Mizoi, J., Kanazawa, N., Kidokoro, S., Takahashi, F., Qin, F., Morimoto, K., Shinozaki, K., and *Yamaguchi-Shinozaki, K. (2019) Heat-induced inhibition of phosphorylation of the stress-protective transcription factor DREB2A promotes thermotolerance of Arabidopsis thaliana. J. Biol. Chem., 294, 902-917.
    http://www.jbc.org/content/294/3/902
    総説論文
    *Takahashi, F., Hanada, K., Kondo, T., and Shinozaki, K. (2019) Hormone-like peptides and small coding genes in plant stress signaling and development. Curr. Opin. Plant Biol., 51, 88-95.
    https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1369526619300287
    *Takahashi, F. and *Shinozaki, K. (2019) Long-distance signaling in plant stress response. Curr. Opin. Plant Biol., 47, 106-111.
    https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S136952661830075X
    英語著書
    *Todaka, D., Takahashi, F., Yamaguchi-Shinozaki, K., and Shinozaki, K. (2019) Chapter Three - ABA-responsive gene expression in response to drought stress: cellular regulation and long-distance signaling. In "Advances in Botanical Research vol. 92" edited by Marion-Poll, A. and Seo, M. ELSEVIER, 83-113.
    https://doi.org/10.1016/bs.abr.2019.05.001
  • -2018年-
    原著論文
    Sato, H., Takasaki, H., Takahashi, F., Suzuki, T., Iuchi, S., Mitsuda, N., Ohme-Takagi, M., Ikeda, M., Seo, M., Yamaguchi-Shinozaki, K., and *Shinozaki, K. (2018) Arabidopsis thaliana NGATHA1 transcription factor induces ABA biosynthesis by activating NCED3 gene during dehydration stress. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 115, E11178-E11187. [プレスリリース]
    http://www.pnas.org/content/115/47/E11178.full
    *Takahashi, F., Suzuki, T., Osakabe, Y., Betsuyaku, S., Kondo, Y., Dohmae, N., Fukuda, H., Yamaguchi-Shinozaki, K., and *Shinozaki, K. (2018) A small peptide modulates stomatal control via abscisic acid in long-distance signaling. Nature, 556, 235-238.
    [プレスリリース]［新聞ネット記事］
    https://www.nature.com/articles/s41586-018-0009-2
    英語著書
    *Takahashi, F., Kuromori, T., Sato, H., and *Shinozaki, K. (2018) Regulatory gene networks in drought stress responses and resistance in plants. In "Survival strategies in extreme cold and desiccation: Adaptation mechanisms and their application" edited by Iwaya-Inoue, M., Sakurai, M., and Uemura, M. Springer, Chapter 12, 189-214.
    日本語著書・解説
    *高橋史憲、篠崎一雄（2018）ペプチドによる長距離シグナルを介した環境ストレス応答の制御、植物の生長調節　53 (2) 109-115.
    *高橋史憲、*篠崎一雄（2018）乾燥ストレス応答における長距離シグナル伝達に関わる植物ペプチド、バイオサイエンスとインダストリー　76 (6) 457-461.
    *高橋史憲、*篠崎一雄（2018）植物が乾燥を防ごうとするしくみを解明！　Newton 7月号　12.
    *高橋史憲、*篠崎一雄（2018）乾燥ストレス応答において根から葉への長距離のシグナル伝達にかかわるペプチドはアブシジン酸を介して気孔の開閉を制御する、ライフサイエンス新着論文レビュー
    http://first.lifesciencedb.jp/archives/18132
    プレスリリース
    乾燥に適応するためのホルモン制御 －乾燥ストレス応答に関わる植物ホルモン合成の制御因子の発見－(2018年11月6日)
    http://www.riken.jp/pr/press/2018/20181106_1/
    乾燥に強くなる植物ペプチドを発見 －植物の乾燥ストレス応答を紐解く新展開－(2018年4月5日)
    http://www.riken.jp/pr/press/2018/20180405_1/
    新聞ネット記事・テレビ報道
    科学新聞（2018年4月13日）根で発生→葉に移動　乾燥に強くなる植物ペプチド
    日本経済新聞（2018年4月5日）乾燥防ぐたんぱく質発見　理研、農作物開発に応用も
    日経産業新聞（2018年4月5日）乾燥防ぐ新たんぱく　理研　植物の根で作り葉に効果
    日刊工業新聞（2018年4月5日）理研、耐性ペプチド発見　植物の乾燥ストレス　品種改良など期待
    化学工業新聞（2018年4月5日）環境ストレス伝達情報伝達　植物の移動性ペプチドホルモン
    徳島新聞（2018年4月5日）植物の根　水分不足を検知　葉に知らせる仕組み解明　乾燥耐性作物開発に期待
  • -2017年-
    原著論文
    #Morimoto, K., #Ohama. N., Kidokoro, S., Mizoi, J., Takahashi, F., Todaka, D., Mogami, J., Sato, H., Qin, F., Kim, J. S., Fukao, Y., Fujiwara, M., Shinozaki, K., and *Yamaguchi-Shinozaki, K. (2017) BPM-CUL3 E3 ligase modulates thermotolerance by facilitating negative regulatory domain-mediated degradation of DREB2A in Arabidopsis. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 114, E8528-E8536.
    http://www.pnas.org/content/114/40/E8528.full
    Kidokoro, S., Yoneda, K., Takasaki, H., Takahashi, F., Shinozaki, K., and *Yamaguchi-Shinozaki, K. (2017) Different cold-signaling pathways function in the responses to rapid and gradual decreases in temperature. Plant Cell, 29, 760-774.
    http://www.plantcell.org/content/29/4/760
    #Soma, F., #Mogami, J., Yoshida, T., Abekura, M., Takahashi, F., Kidokoro, S., Mizoi, J., Shinozaki, K., and *Yamaguchi-Shinozaki, K. (2017) ABA-unresponsive SnRK2 protein kinases regulate mRNA decay under osmotic stress in plants. Nature Plants, 3, 16204.
    https://www.nature.com/articles/nplants2016204
  • -2016年-
    原著論文
    Ohama, N., Kusakabe, K., Mizoi, J., Zhao, H., Kidokoro, S., Koizumi, S., Takahashi, F., Ishida, T., Yanagisawa, S., Shinozaki, K., and *Yamaguchi-Shinozaki, K. (2016) The transcriptional cascade in the heat stress response of Arabidopsis is strictly regulated at the level of transcription factor expression. Plant Cell, 28, 181-201.
    http://www.plantcell.org/content/28/1/181

竹澤班

  • -2019年-
    原著論文
    Jahan, A., Komatsu, K., Wakida-Sekiya, M., Hiraide, M., Tanaka, K., Ohtake, R., Umezawa, T., Toriyama, T., Shinozawa, A., Yotsui, I., Sakata, Y., and *Takezawa, D. (2019) Archetypal roles of an abscisic acid receptor in drought and sugar responses in liverworts. Plant Physiol., 179, 317-328.
    http://www.plantphysiol.org/content/179/1/317
    Shinozawa, A., Otake, R., Takezawa, D., Umezawa, T., Komatsu, K., Tanaka, K., Amagai, A., Ishikawa, S., Hara, Y., Kamisugi, Y., Cuming, A. C., Hori, K., Ohta, H., Takahashi, F., Shinozaki, K., Hayashi, T., Taji, T., and *Sakata, Y. (2019) SnRK2 protein kinases represent an ancient system in plants for adaptation to a terrestrial environment. Commun. Biol., 2, 30 (13 pages).
    https://www.nature.com/articles/s42003-019-0281-1
  • -2018年-
    原著論文
    Amagai, A., Honda, Y., Ishikawa, S., Hara, Y., Kuwamura, M., Shinozawa, A., Sugiyama, N., Ishihama, Y., Takezawa, D., Sakata, Y., Shinozaki, K., and *Umezawa, T. (2018) Phosphoproteomic profiling reveals ABA-responsive phosphosignaling pathways in Physcomitrella patens. Plant J., 94, 699-708.
    https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/tpj.13891
    英語著書
    *Takezawa, D. (2018) Mechanisms underlying freezing and desiccation tolerance in bryophytes. In "Survival strategies in extreme cold and desiccation: Adaptation mechanisms and their application" edited by Iwaya-Inoue, M., Sakurai, M., and Uemura, M. Springer, 167-187.
    https://link.springer.com/chapter/10.1007%2F978-981-13-1244-1_10
  • -2017年-
    原著論文
    *Bowman, J. L., *Kohchi, T., *Yamato, K. T., Jenkins, J., Shu, S., Ishizaki, K., Yamaoka, S., Nishihama, R., Nakamura, Y., Berger, F., Adam, C, Aki, S. S., Althoff, F., Araki, T., Arteaga-Vazquez, M. A., Balasubrmanian, S., Barry, K., Bauer, D., Boehm, C. R., Briginshaw, L., Caballero-Perez, J., Catarino, B., Chen, F., Chiyoda, S., Chovatia, M., Davies, K. M., Delmans, M., Demura, T., Dierschke, T., Dolan, L., Dorantes-Acosta, A. E., Eklund, D. M., Florent, S. N., Flores-Sandoval, E., Fujiyama, A, Fukuzawa, H., Galik, B., Grimanelli, D., Grimwood, J., Grossniklaus, U., Hamada, T., Haseloff, J., Hetherington, A. J., Higo, A., Hirakawa, Y., Hundley, H. N, Ikeda, Y., Inoue, K., Inoue, S., Ishida, S., Jia, O., Kakita, M., Kanazawa, T., Kawai, Y., Kawashima, T., Kennedy, M., Kinose, K., Kinoshita, T., Kohara, Y., Koide, E., Komatsu, K., Kopischke, S., Kubo, M., Kyozuka, J., Lagercrantz, U., Lin, S. S., Lindquist, E., Lipzen, A. M., Lu, C. W., De Luna, E., Martienssen, R. A., Minamino, N., Mizutani, M., Mizutani, M., Mochizuki, N., Monte, I., Mosher, R., Nagasaki, H., Nakagami, H., Naramoto, S., Nishitani, K., Ohtani, M., Okamoto, T., Okumura, M., Phillips, J., Pollak, B., Reinders, A., Rövekamp, M., Sano, R., Sawa, S., Schmid, M. W., Shirakawa, M., Solano, R., Spunde, A., Suetsugu, N., Sugano, S., Sugiyama, A., Sun, R., Suzuki, Y., Takenaka, M., Takezawa, D., Tomogane, H., Tsuzuki, M., Ueda, T., Umeda, M., Ward, J. M., Watanabe, Y., Yazaki, K., Yokoyama, R., Yoshitake, Y., Yotsui, I., Zachgo, S., and Schmutz, J. (2017) Insights into land plant evolution garnered from the Marchantia polymorpha genome. Cell,, 171, 287-304.
    http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867417311248
    Hagiwara, K., Saruhashi, M., Ishizaki, Y., Sakata, Y., and *Takezawa, D. (2017) Isolation of abscisic acid-insensitive mutant lines of Physcomitrella patens by ultraviolet irradiation mutagenesis. Cryobiol. Cryotechnol., 63, 53-56.
    https://www.jstage.jst.go.jp/article/cryobolcryotechnol/63/1/63_53/_article
  • -2016年-
    原著論文
    Ghosh, T. K., Kaneko, M., Akter, K., Murai, S., Komatsu, K., Ishizaki, K., Yamato, K. T., Kohchi, T., and *Takezawa, D. (2016) Abscisic acid-induced gene expression in the liverwort Marchantia polymorpha is mediated by evolutionarily conserved promoter elements. Physiol. Plant., 156, 407-420.
    https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/ppl.12385

玉田班

  • -2019年-
    原著論文
    *#Ishikawa, M., #Morishita, M., Higuchi, Y., Ichikawa, S., Ishikawa, T., Nishiyama, T., Kabeya, Y., Hiwatashi, Y., Kurata, T., Kubo, M., Shigenobu, S., Tamada, Y., Sato, Y., and *Hasebe, M (2019) Physcomitrella STEMIN transcription factor induces stem cell formation with epigenetic reprogramming. Nature Plants, 5, 681-690.
    https://www.nature.com/articles/s41477-019-0464-2
    *Komuro, K., Oe, K., Tamada, Y., and Nomura, T. (2019) Complex amplitude mapping based on adaptive autofocusing algorithm. Opt. Rev., 26, 342-348.
    https://link.springer.com/article/10.1007/s10043-019-00507-5
    *Kubo, M., Nishiyama, T., Tamada, Y., Sano, R., Ishikawa, M., Murata, T., Imai, A., Lang, D., Demura, T., *Reski, R., and *Hasebe, M. (2019) Single-cell transcriptome analysis of Physcomitrella leaf cells during reprogramming using microcapillary manipulation. Nucleic Acids Res., 47, 4539-4553.
    https://academic.oup.com/nar/article/47/9/4539/5381068
    Sugimoto, R., Maruyama, R., Tamada, Y., Arimoto H., and *Watanabe, W. (2019) Contrast enhancement by oblique illumination microscopy with an LED array. Optik, 183, 92-98. [Cover]
    https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0030402619301858
    日本語著書・解説
    玉田洋介、三浦則明、服部雅之 (2019) 組織深部の生細胞における超解像観察を可能にする補償光学、光アライアンス（日本工業出版）、2019年8月号、31-35.
    玉田洋介、服部雅之 (2019) 補償光学：生物の深部を生きたまま観察、アグリバイオ（北隆館）、3 (2) 166-171.
  • -2018年-
    原著論文
    Ogasawara, Y., Sugimoto, R., Maruyama, R., Arimoto, H., Tamada, Y., and *Watanabe, W. (2018) Mobile-phone-based Rheinberg microscope with a light-emitting diode array. J. Biomed. Opt., 24, 031007 (6 pages).
    https://doi.org/10.1117/1.JBO.24.3.031007

千葉班

  • -2020年-
    原著論文
    #Motomura, K., #Arae, T., Uramoto, H. A., Suzuki, Y., Takeuchi, H., Suzuki, T., Ichihashi, Y., Shibata, A., Shirasu, K., Takeda, A., Higashiyama, T., and *Chiba, Y. (2020) AtNOT1 is a novel regulator of gene expression during pollen development. Plant Cell Physiol., 61, 712-721.
    https://academic.oup.com/pcp/article/61/4/712/5687859
  • -2019年-
    原著論文
    Arae, T., Morita, K., Imahori, R., *Suzuki, Y., *Yasuda, S., Sato, T., Yamaguchi, J., and *Chiba, Y. (2019) Identification of Arabidopsis CCR4-NOT complexes with Pumilio RNA binding proteins, APUM5 and APUM2. Plant Cell Physiol., 60, 2015-2025.
    https://doi.org/10.1093/pcp/pcz089

豊田班

野田口班

  • -2019年-
    原著論文
    #Shiratake, K. #Notaguchi, M., Makino, H., Sawai, Y., and *Borghi, L. (2019) Petunia PLEIOTROPIC DRUG RESISTANCE 1 is a strigolactone short-distance transporter with Long-distance outcomes. Plant Cell Physiol., 60, 1722-1733.
    https://doi.org/10.1093/pcp/pcz081
    *Toju, H., Okayasu, K., and Notaguchi, M. (2019) Leaf-associated microbiomes of grafted tomato plants. Sci. Rep., 9, 1787 (11 pages).
    https://www.nature.com/articles/s41598-018-38344-2
    総説論文
    Okayasu, K. and *Notaguchi, M. (2019) Efficient establishment of interfamily heterograft of Nicotiana benthamiana and Arabidopsis thaliana. Methods Mol. Biol., 2014, 411-420.
    https://link.springer.com/protocol/10.1007%2F978-1-4939-9562-2_31
    新聞ネット記事・テレビ報道
    日経産業新聞（2019年9月3日）
    JST news（2019年8月9日）
    日本農業新聞（2019年7月13日）
    日本経済新聞（2019年6月25日）
    日本経済新聞　電子版（2019年6月24日）
    日経産業新聞（2019年2月15日）
  • -2018年-
    原著論文
    Endo, M., Yoshida, M., Sasaki, Y., Negishi, K., Horikawa, K., Daimon, Y., Kurotani, K., Notaguchi, M., Abe, M., and *Araki, T. (2018) Re-evaluation of florigen transport kinetics with separation of functions by mutations that uncouple flowering initiation and long-distance transport. Plant Cell Physiol., 59, 1621-1629.
    https://doi.org/10.1093/pcp/pcy063
    日本語著書・解説
    野田口理孝（2018）異種間の接ぎ木技術の開発、アグリバイオ（北隆館）2018年10月号、1043-1047.
    新聞ネット記事・テレビ報道
    日経バイオテク（2018年10月8日）
    朝日新聞（2018年7月1日）
    BSフジ ガリレオX（2018年3月11日）
    日本テレビ ザ！世界仰天ニュース（2018年2月20日）
  • -2017年-
    原著論文
    *Kasahara, R. D., Notaguchi, M., and Honma, Y. (2017) Discovery of pollen tube-dependent ovule enlargement morphology phenomenon, a new step in plant reproduction. Commun. Integr. Biol., 10, e1338989 (4 pages).
    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5595410/
    総説論文
    Tsutsui, H. and *Notaguchi, M. (2017) The use of grafting to study systemic signaling in plants. Plant Cell Physiol., 58, 1291-1301.
    https://doi.org/10.1093/pcp/pcx098
    *Notaguchi, M. (2017) Systemic RNA in plants. BSJ-Review, 8, 121-129.
    新聞ネット記事・テレビ報道
    中日新聞（2017年8月17日）
    中日新聞（2017年8月10日）

藤井班

  • -2019年-
    原著論文
    *Fujii, S., Tsuchimatsu, T., Kimura, Y., Ishida, S., Tangpranomkorn, S., Shimosato-Asano, H., Iwano, M., Furukawa, S., Itoyama, W., Wada, Y., Shimizu, K. K., and *Takayama, S. (2019) A stigmatic gene confers interspecies incompatibility in the Brassicaceae. Nature Plants, 5, 731-741. [プレスリリース][新聞ネット記事]
    https://www.nature.com/articles/s41477-019-0444-6
    *Fujii, S. and Shiroto, Y. (2019) Molecular identification of the causal locus for the petaloid phenotype in Daucus carota. Breed. Sci., 69, 186-188.
    https://www.jstage.jst.go.jp/article/jsbbs/69/1/69_18120/_html/
    *Kawabe, A., Furihata, H., Y., Tsujino, Y., Kawanabe, T., Fujii, S., and Yoshida, T. (2019) Divergence of RNA editing among Arabidopsis species. Plant Sci., 280, 241-247.
    https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0168945218310021
    プレスリリース
    同種と異種の花粉を区別する分子を発見 ～種の壁を自在に制御する技術の開発に期待～ (2019年7月2日)
    https://www.a.u-tokyo.ac.jp/topics/topics_20190702-1.html
    新聞ネット記事・テレビ報道
    朝日新聞 (2019年9月12日) 他種の花粉　排除する遺伝子
    日経産業新聞 (2019年7月6日) 異種の花粉　侵入防ぐ仕組み
    農業共済新聞 (2019年7月3日) 受粉時に異種の花粉を排除する仕組み解明
    奈良新聞 (2019年7月3日) 花粉識別の仕組み解明
  • -2018年-
    総説論文
    Fujii, S. and *Takayama, S. (2018) Multilayered dominance hierarchy in plant self-incompatibility. Plant Reprod., 31, 15-19.
    https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs00497-017-0319-9
    日本語著書・解説
    藤井壮太、高山誠司（2018）被子植物における自他の花粉の識別システムおよびその進化の動態、ライフサイエンス領域融合レビュー、7、e006.
  • -2016年-
    原著論文
    #Yasuda, S., #Wada, Y., #Kakizaki, T., Tarutani, Y., Miura-Uno, E., Murase, K., Fujii, S., Hioki, T., Shimoda, T., Takada, Y., Shiba, H., Takasaki-Yasuda, T., Suzuki, G., *Watanabe, M., and *Takayama, S. (2016) A complex dominance hierarchy is controlled by polymorphism of small RNAs and their targets. Nature Plants, 3, 16206.
    https://www.nature.com/articles/nplants2016206
    Kubo, K., Tsukahara, M., Fujii, S., Murase, K., Wada, Y., Entani, T., Iwano, M., and *Takayama, S. (2016) Cullin1-P is an essential component of non-self recognition system in self-incompatibility in Petunia. Plant Cell Physiol., 57, 2403-2416.
    http://pcp.oxfordjournals.org/content/early/2016/08/26/pcp.pcw152.long
    *Fujii, S., Suzuki, T., Giegé, P., Higashiyama, T., Koizuka, N., and Shikanai, T. (2016) The Restorer-of-fertility-like 2 pentatricopeptide repeat protein and RNase P are required for the processing of mitochondrial orf291 RNA in Arabidopsis. Plant J., 86, 504-513.
    https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/tpj.13185
    総説論文
    Fujii, S., Kubo, K., and *Takayama, S. (2016) Non-self- and self-recognition models in plant self-incompatibility. Nature Plants, 2, 16130.
    http://www.nature.com/articles/nplants2016130

松下班

山口班

  • -2019年-
    原著論文
    Goh, T., Toyokura, K., Yamaguchi, N., Okamoto, Y., Uehara, T., Kaneko, S., Takebayashi, Y., Kasahara, H., Ikeyama, Y., Okushima, Y., Nakajima, K., Mimura, T., Tasaka, M., and *Fukaki, H. (2019) Lateral root initiation requires the sequential induction of transcription factors LBD16 and PUCHI in Arabidopsis thaliana. New Phytol., 224, 749-760.
    https://nph.onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/nph.16065
    Sun, B., Zhou, Y., Cai, J., Shang, E., Yamaguchi, N., Xiao, J., Looi, L. S., Wee, W. Y., Gao, X., Wagner, D., and *Ito, T (2019) Integration of transcriptional repression and Polycomb-mediated silencing of WUSCHEL in floral meristems. Plant Cell, 31, 1488-1505. [プレスリリース]
    https://doi.org/10.1105/tpc.18.00450
    Wu, J., *Yamaguchi, N., and *Ito, T. (2019) Histone demethylases control root elongation in response to stress-signaling hormone abscisic acid. Plant Signal. Behav., 14, 1604019.
    https://doi.org/10.1080/15592324.2019.1604019
    Wu, J., Ichihashi, Y., Suzuki, T., Shibata, A., Shirasu, K., *Yamaguchi, N., and *Ito, T. (2019) Abscisic acid‐dependent histone demethylation during postgermination growth arrest in Arabidopsis. Plant Cell Environ., 42, 2198-2214.
    https://doi.org/10.1111/pce.13547
    総説論文
    Lee, Z. H., Hirakawa, T., Yamaguchi, N., and *Ito, T. (2019) The roles of plant hormones and their interactions with regulatory genes in determining meristem activity. Int. J. Mol. Sci., 20, 4065.
    https://www.mdpi.com/1422-0067/20/16/4065/htm
    Xu, Ｙ., Yamaguchi, N., Gan, E. S., and Ito, T. (2019) When to stop: an update on molecular mechanisms of floral meristem termination. J. Exp. Bot., 70, 1711-1718.
    https://doi.org/10.1093/jxb/erz048
    プレスリリース
    植物は幹細胞の頑強な増殖を止めるために多段階スイッチを使っていた　開花、種づくりに向けての巧妙な仕組み解明 ～園芸植物の花の改良や食糧増産に期待～ (2019年5月14日)
    https://www.naist.jp/pressrelease/2019/05/005749.html