研究成果 研究班・研究成果

*Corresponding author, #These authors contributed equally to this work.
実線下線は研究代表者、点線下線は研究分担者

計画研究班

木下班

  • -2017年-
    原著論文
    Hayashi, M., Inoue, S., Ueno, Y., Kinoshita, T. (2017) A Raf-like protein kinase BHP mediates blue light-dependent stomatal opening. Scientific Reports, 7, 45586.
    https://www.nature.com/articles/srep45586
  • -2016年-
    原著論文
    Okumura, M., Kinoshita, T. (2016) Measurement of ATP hydrolytic activity of plasma membrane H+-ATPase from Arabidopsis thaliana leaves. Bio-protocol, in press.
    Inoue, S., Takahashi, K., Okumura, H. N., and Kinoshita, T. (2016) Auxin influx carrier AUX1 confers acid resistance for Arabidopsis root elongation through the regulation of plasma membrane H+-ATPase. Plant Cell Physiol., 57, 2194-2201.
    http://pcp.oxfordjournals.org/content/early/2016/08/08/pcp.pcw136
    *Uehara, K. B., *Wang, D. R., Furuta, T., Minami, A., Nagai, K., Gamuyao,R., Asano, K., Angeles-Shim, R. B., Shimizu, Y., Ayano, M., Komeda, N., Doi, K., Miura, K., Toda, Y., Kinoshita, T., Okuda, S., Higashiyama, T., Nomoto, M., Tada, Y., Shinohara, H., Matsubayashi, Y., Greenberg, A., Wu, J., Yasui, H., Yoshimura, A., Mori, H., McCouch, S. R., and Ashikari, M. (2016) Loss of function at RAE2, a previously unidentified EPFL, is required for awnlessness in cultivated Asian rice, PNAS, 113, 8969-8974.
    http://www.pnas.org/content/early/2016/07/26/1604849113
    Aleman, F., Yazaki, J., Lee, M., Takahashi, Y., Kim, A. Y., Kinoshita, T., Ecker, JR., and Schroeder, J. I. (2016) An ABA-increased interaction of the PYL6 ABA receptor with MYC2 transcription factor: A putative link of ABA and JA signaling. Scientific Reports, 6, 28941.
    http://www.nature.com/articles/srep28941
    Yamauchi S, Takemiya A, Sakamoto T, Kurata T, Kinoshita, T. , and Shimazaki K. (2016) Plasma membrane H+-ATPase1 (AHA1) plays a major role in stomatal opening in response to blue light. Plant Physiol., 171, 2731-43.
    http://www.plantphysiol.org/content/171/4/2731
    Takahashi Y, Kinoshita, T., Matsumoto M, and Shimazaki K. (2016) Inhibition of the Arabidopsis bHLH transcription factor by monomerization through abscisic acid-induced phosphorylation. Plant Journal, 87, 559-67.
    http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/tpj.13217/abstract
    Toda Y, Wang Y, Takahashi A, Kawai Y, Tada Y, Yamaji N, Ma J. F, Ashikari M, Kinoshita, T. (2016) Oryza sativa H+-ATPase (OSA) is involved in the regulation of dumbbell-shaped guard cells of rice. Plant Cell Physiol., 57, 1220-1230.
    http://pcp.oxfordjournals.org/content/57/6/1220
    Okumura M, Inoue S, Kuwata K, Kinoshita, T. (2016) Photosynthesis activates plasma membrane H+-ATPase via sugar accumulation. Plant Physiol., 171, 580-589.
    http://www.plantphysiol.org/content/171/1/580
    Nakamichi, N., Takao S, Kudo T, Kiba T, Wang Y, Kinoshita, T. , Sakakibara H. (2016) Improvement of Arabidopsis biomass and cold-, drought-, and salinity-stress tolerance by modified circadian clock-associated PSEUDO-RESPONSE REGULATORs. Plant Cell Physiol., 57, 1085-1097.
    http://pcp.oxfordjournals.org/content/57/5/1085
    Nagatoshi Y, Mitsuda N, Hayashi M, Inoue S, Okuma E, Kubo A, Murata Y, Seo M, Saji H, Kinoshita, T., Ohme-Takagi M. (2016) GOLDEN 2-LIKE transcription factors for chloroplast development affect ozone tolerance through the regulation of stomatal movement. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 113, 4218-4223.
    http://www.pnas.org/content/113/15/4218.abstract
    Kamioka, M., Takao, S., Suzuki, T., Taki, K., Higashiyama, T., Kinoshita, T. and *Nakamichi, N. (2016) Direct repression of evening genes by CIRCADIAN CLOCK-ASSOCIATED 1 in Arabidopsis circadian clock. Plant Cell, 28, 696-711.
    http://www.plantcell.org/content/28/3/696.short
    Yamada K, Yamaguchi K, Shirakawa T, Nakagami H, Mine A, Ishikawa K, Fujiwara M, Narusaka M, Narusaka Y, Ichimura K, Kobayashi Y, Matsui H, Nomura Y, Nomoto M, Tada Y, Fukao Y, Fukamizo T, Tsuda K, Shirasu K, Shibuya N, and *Kawasaki T. (2016) The Arabidopsis CERK1-associated kinase PBL27 connects chitin perception to MAPK activation. EMBO J., in press.
    http://emboj.embopress.org/content/early/2016/09/26/embj.201694248
    Hayami, N., Kimura, M., Tokizawa, M., Iuchi, S., Kurihara, Y., Matsui, M., Nomoto, M., Tada, Y., Sakai, Y., and *Yamamoto, Y.Y. (2016) The responses of Arabidopsis ELIP2 to UV-B, high light, and cold stress are regulated by a transcriptional regulatory unit composed of two elements. Plant Physiol., 169, 840-855.
    http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26175515
    Inoue K, Nishihama R, Kataoka H, Hosaka M, Manabe R, Nomoto M, Tada Y., Ishizaki K, Kohchi T. (2016) Phytochrome signaling is mediated by PHYTOCHROME INTERACTING FACTOR in the liverwort Marchantia polymorpha. Plant Cell, 28, 1406-1421.
    http://www.plantcell.org/content/28/6/1406
    Suzuki T, Matsushima C, Nishimura S, Higashiyama T, Sasabe M, Machida Y. (2016) Identification of Phosphoinositide-Binding Protein PATELLIN2 as a Substrate of Arabidopsis MPK4 MAP Kinase during Septum Formation in Cytokinesis. Plant Cell Physiol., 57, 1744-1755.
    https://academic.oup.com/pcp/article/57/8/1744/2755849/Identification-of-Phosphoinositide-Binding-Protein
    総説論文
    Takahashi K and Kinoshita, T. (2016) The regulation of plant cell expansion: Auxin-induced turgor-driven cell elongation. Molecular Cell Biology of the Growth and Differentiation of Plant Cells, 156-173. CRC Press.
    http://www.crcnetbase.com/doi/abs/10.1201/b20316-13
    日本語著書・解説
    木下俊則(2016)細胞膜、植物学の百科事典(丸善)392-393.
    木下俊則(2016)生体膜輸送系、植物学の百科事典(丸善)404-407.
    木下俊則、富山将和(2016)環境刺激による気孔開度制御機構の解明に向けて、BSJ-Review、7、97-109.
    木下俊則(2016)気孔の光開口運動における光シグナル伝達、光と生命の事典(朝倉書店)140-141.
    萩原伸也、吉村柾彦、土屋雄一朗、木下俊則、伊丹健一郎(2016)魔女の雑草の呪いを解く分子、化学、71、35-39.
  • -2015年-
    原著論文
    *#Tsuchiya Y., #Yoshimura M., Sato Y., Kuwata K., Toh S., Holbrook-Smith D., Zhang H., McCourt P., Itami K., Kinoshita T., and *Hagihara S. (2015) Probing strigolactone receptors in Striga hermonthica with fluorescence. Science, 349, 864-868. [プレスリリース] [新聞ネット記事]
    http://www.sciencemag.org/content/349/6250/864.abstract
    Kimura Y, Aoki S, Ando E, Kitatsuji A, Watanabe A, Ohnishi M, Takahashi K, Inoue S, Nakamichi N, Tamada Y, and *Kinoshita T. (2015) A flowering integrator, SOC1, affects stomatal opening in Arabidopsis thaliana. Plant Cell Physiol., 56, 640-649.
    http://pcp.oxfordjournals.org/content/56/4/640.short
    *Tsuji, H., Tachibana, C., Tamaki, S., Taoka, K., Kyozuka, J., and Shimamoto, K. (2015) Hd3a promotes lateral branching in rice. Plant J., 82, 256-266.
    http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25740115
    Saleh, A., Withers, J., Mohan, R., Marques, J., Gu, Y., Yan, S., Zavaliev, R., Nomoto, M., Tada, Y., and *Dong, X. (2015) Posttranslational modifications of the master transcriptional regulator NPR1 enable dynamic but tight control of plant immune responses. Cell Host & Microbe, 18, 169-182.
    http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1931312815002978
    Matsuo, M., Johnson, J. M., Hieno, A., Tokizawa, M., Nomoto, M., Tada, Y., Godfrey, R., Obokata, J., Sherameti, I., Yamamoto, Y. Y., Bohmer, F. D., and *Oelmuller, R. (2015) High REDOX RESPONSIVE TRANSCRIPTION FACTOR1 levels result in accumulation of reactive oxygen species in Arabidopsis thaliana shoots and roots. Mol. Plant, 8, 1253-1273.
    http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1674205215001793
    Kobayashi, K., Suzuki, T., Iwata, E., Nakamichi, N., Suzuki, T., Chen, P., Ohtani, M., Ishida, T., Hosoya, H., Muller, S., Leviczky, T., Pettko-Szandtner, A., Darula, Z., Iwamoto, A., Nomoto, M., Tada, Y., Higashiyama, T., Demura, T., Doonan, J. H., Hauser, M. T., Sugimoto, K., Umeda, M., Magyar, Z., Bogre, L., and Ito, M. (2015) Transcriptional repression by MYB3R proteins regulates plant organ growth. EMBO J., 34, 1992-2007.
    http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.15252/embj.201490899/abstract
    総説論文
    Takahashi Y, Kinoshita, T.. (2015) Stomatal function has an element of hysteresis.
    New Phytol. 205(2):455-7.
    http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25521066
    *Satake A, Sakurai G, and *Kinoshita T. (2015) Modeling strategies for plant survival, growth and reproduction. Plant Cell Physiol., 56, 583-585.
    http://pcp.oxfordjournals.org/content/56/4/583.short
    日本語著書・解説
    Wang Yin、木下俊則(2015)気孔調節による植物のCO2コンダクタンス制御、光合成研究、25(3)(通巻74号)、194-201.
    木下俊則(2015)未来をつなぐ風、実験医学、33、2670-2671.
    木下俊則(2015)生き残りのための環境突破力、理フィロソフィア(名古屋大学理学部・大学院理学研究科広報誌)、29, 8-11.
    木下俊則(2015)環境変動に対する気孔開閉制御、化学と生物、53、 608-613.
    プレスリリース
    アフリカの食糧問題に希望の光 ~ 寄生植物の発芽を制御するタンパク質を発見 ~ (2015年8月21日)
    http://www.itbm.nagoya-u.ac.jp/ja/research/2015/08/Yoshimulactone-Striga.php
    新聞ネット記事・テレビ報道
    読売新聞(2015年5月18日)「花咲かホルモン」(木下と辻の両方が取り上げられています。)
    JST サイエンスニュース・サイエンスチャンネル特集 2015年6月19日「花咲かホルモン」フロリゲン 植物ゲノム研究最前線(辻)
    ハーバービジネスオンライン 2015年12月19日 TPPで苦境に立たされた農業を開花ホルモン研究が救う?(辻)

松林班

  • -2017年-
            
    原著論文
    #Ohkubo, Y., #Tanaka, M., Tabata, R., Ohnishi, M. O. and *Matsubayashi, Y. (2017) Shoot-to-root mobile polypeptides involved in systemic regulation of nitrogen acquisition, Nature Plants, 3, 17029.
    http://www.nature.com/articles/nplants201729
    Hirakawa, Y., Shinohara, H., Welke, K., Irle, S., Matsubayashi, Y., *Torii, K. U. and *Uchida, N. (2017) Cryptic bioactivity capacitated by synthetic hybrid plant peptides. Nat. Commun., 8, 14318 (7 pages). [プレスリリース]
    http://www.nature.com/articles/ncomms14318
    #Nakayama,T., #Shinohara, H., Tanaka, M., Baba, K., Ohnishi, M. O. and *Matsubayashi, Y. (2017) A peptide hormone required for Casparian strip diffusion-barrier formation in Arabidopsis roots, Science, 355, 284-286.
    http://science.sciencemag.org/content/355/6322/284.full
  • -2016年-
            
    原著論文
    *Uehara, K. B., *Wang, D. R., Furuta, T., Minami, A., Nagai, K., Gamuyao,R., Asano, K., Angeles-Shim, R. B., Shimizu, Y., Ayano, M., Komeda, N., Doi, K., Miura, K., Toda, Y., Kinoshita, T., Okuda, S., Higashiyama, T., Nomoto, M., Tada, Y., Shinohara, H., Matsubayashi, Y., Greenberg, A., Wu, J., Yasui, H., Yoshimura, A., Mori, H., McCouch, S. R., and Ashikari, M. (2016) Loss of function at RAE2, a previously unidentified EPFL, is required for awnlessness in cultivated Asian rice, PNAS, 113, 8969-8974.
    http://www.pnas.org/content/early/2016/07/26/1604849113
    Shinohara, H., Mori, A., Yasue, N., Sumida, K. and *Matsubayashi, Y. (2016) Identification of three LRR-RKs involved in perception of root meristem growth factor in Arabidopsis. Proc. Natl Acad. Sci. U S A., 113, 3897-3902.
    http://www.pnas.org/content/113/14/3897.long
    日本語著書・解説
    松林嘉克 (2016) 植物ホルモン ペプチドホルモン、370-373、植物学の百科事典
  • -2015年-
    原著論文
    Okamoto, S., Suzuki, T., Kawaguchi, M., Higashiyama, T.and Matsubayashi, Y. (2015) A comprehensive strategy for identifying long-distance mobile peptides in xylem sap. Plant J. 84(3):611-620.
    http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/tpj.13015/full;
    jsessionid=F0FAD827615C87D58406A84C116A9EF4.f03t03?wol1URL=/doi/10.1111/tpj.13015/full®ionCode=JP-13&identityKey=431dcc5a-2702-4e29-81d8-4b5ffb169d0c
    Xu, C., Liberatore, K. L., MacAlister, C. A., Huang, Z., Chu, Y. H., Jiang, K., Brooks, C., Ogawa-Ohnishi, M., Xiong, G., Pauly, M., Van Eck, J., Matsubayashi, Y., van der Knaap, E., and *Lippman, Z. B. (2015) A cascade of arabinosyltransferases controls shoot meristem size in tomato. Nature Genet. 47, 784-792.
    http://www.nature.com/ng/journal/v47/n7/full/ng.3309.html
    Wu, T., Kamiya, T., Yumoto, H., Sotta, N., Katsushi, Y., Shigenobu, S., Matsubayashi, Y., and *Fujiwara, T. (2015) An Arabidopsis thaliana copper-sensitive mutant suggests a role of phytosulfokine in ethylene production. J. Exp. Bot. 66, 3657-3667.
    http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25908239?dopt=Abstract
    *Shinohara, H., and Matsubayashi, Y. (2015) Reevaluation of the CLV3-receptor interaction in the shoot apical meristem: dissection of the CLV3 signaling pathway from a direct ligand-binding point of view. Plant J. 82, 328-336.
    http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25754504
    Ogawa-Ohnishi, M., and *Matsubayashi, Y. (2015) Identification of three potent hydroxyproline O-galactosyltransferases in Arabidopsis. Plant J. 81, 736-746.
    http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25600942
    日本語著書・解説
    小川・大西真理、松林嘉克 (2015) 古くて新しい植物のO ― 結合型糖タンパク質の世界、化学と生物53, 729-730.
    田畑 亮、松林嘉克 (2015) 効率的な窒素栄養吸収を可能にする根-葉-根間長距離シグナル伝達、バイオインダストリー、32, 53-58

松永班

  • -2017年-
    原著論文
    Yagi, N., Matsunaga, S. and Hashimoto, T. (2017) Insights into cortical microtubule nucleation and dynamics in Arabidopsis leaf cells. J. Cell Sci., in press.
    http://jcs.biologists.org/content/early/2017/06/14/jcs.203778
    Kim, J. M., To, T., Matsui, A., Tanoi, K., Kobayashi, N., Matsuda, F., Habu, Y., Ogawa, D., Sakamoto, T., Matsunaga, S., Bashir, K., Rasheed, S., Ando, M., Takeda, H., Kawaura, K., Kusano, M., Fukushima, A., Endo, T., Kuromori, T., Ishida, J., Morosawa, T., Tanaka, M., Torii, C., Takebayashi, Y., Sakakibara, H., Ogihara, Y., Saito, K., Shinozaki, K., Devoto, A., and Seki, M. (2017) A plant ancestral polo-like kinase sheds light on the mystery of the evolutionary disappearance of polo-like kinases in the plant kingdom. Nature Plants, in press.
    Hoshino, A., Matsunaga, T. M., Sakamoto, T., and Matsunaga, S. (2017) Hi-C revolution: from a snapshot of DNA-DNA interaction in a single cell to chromosome-scale de novo genome assembly. Cytologia, in press.
    Sakamoto, Y. and Matsunaga, S. (2017) Deep imaging of plant Arabidopsis roots by a rapid transparency technique TOMEI. Cytologia, in press.
    #Sakamoto, N. A., #Thuong Lan, V. H., #Fujimoto, S., Matsunaga, S. and Tanaka, A. (2017) An ion beam-induced Arabidopsis mutant with marked chromosomal rearrangement. J. Rad. Res., in press. [プレスリリース] [新聞ネット記事]
    https://academic.oup.com/jrr/article/3862018/An-ion-beam-induced-Arabidopsis-mutant-with-marke
    Matsunaga, T. M., Ogawa, D., Taguchi-Shiobara, F., Ishimoto, M., Matsunaga, S. and Habu Y. (2017) Direct quantitative evaluation of disease symptoms on living plant leaves growing under natural light. Breed. Sci., in press.
    https://www.jstage.jst.go.jp/article/jsbbs/advpub/0/advpub_16169/_article
    Okamura, E., Sakamoto, T., Sasaki, T. and *Matsunaga, S. (2017) A plant ancestral polo-like kinase sheds light on the mystery of the evolutionary disappearance of polo-like kinases in the plant kingdom. Cytologia, in press.
    #Spallek, T., #Melnyk, C., W., Wakatake, T., Zhang, J., Sakamoto, Y., Kiba, T., Yoshida, S., Matsunaga, S., Sakakibara, H. and *Shirasu, K. (2017) Inter-species hormonal control of host root morphology by parasitic plants. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 114, 5283-5288. [プレスリリース]
    http://www.pnas.org/content/early/2017/04/27/1619078114.full.pdf
    #Kurita,K., #Sakamoto,T., Yagi, N., Sakamoto, Y., Ito, A., Nishino, N., Sako,K., Yoshida, M., Kimura, H., Seki, M. and *Matsunaga, S. (2017) Live imaging of H3K9 acetylation in plant cells. Sci. Rep., 7, 45894 (9 pages). [プレスリリース] [新聞ネット記事]
    https://www.nature.com/articles/srep45894
    Hirakawa, T., Hasegawa, J., White, C and *Matsunaga, S. (2017) RAD54 forms DNA repair foci in response to DNA damage in living plant cells. Plant J., 90, 372-382. [プレスリリース] [新聞ネット記事]
    http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/tpj.13499/abstract
    総説論文
    Tsukaya, H. and Matsunaga, S. (2017) Tissue-dependency of the impact of endoreduplication on cell size. Plant Morphology, in press.
    *Matsunaga, S. and Nakaya, A. (2017) Computational synteny analysis promotes a better understanding of chromosome evolution. Cytologia, 82, 101-104.
    https://www.jstage.jst.go.jp/article/cytologia/82/2/82_820201/_article
    日本語著書・解説
    松永幸大 (2017) For your Lifework、遺伝、71(2), 183.
    栗田和貴、坂本卓也、松永幸大 (2017) 植物のヒストン修飾ライブイメージング、Plant Morphology、印刷中
    プレスリリース
    イオンビームが植物の染色体構造をがらりと変えることを発見 - 植物ゲノムはしなやかに進化を目指す -
    http://www.tus.ac.jp/today/20170615101.pdf
    植物のエピジェネティクス変化をリアルタイムに捉えることに成功~マウスの抗体の一部が生きた植物細胞内でも抗原を認識した~
    http://www.tus.ac.jp/today/20170418018.pdf
    放射線や化学物質により形成される植物の核内構造体の発見~植物のストレス診断指標を見出す~
    http://www.tus.ac.jp/today/20161011001.pdf
    新聞ネット記事・テレビ報道
    日経産業新聞(2017年6月16日)染色体異常でも受粉・生育 量研機構など ビーム照射で確認
    時事ドットコムニュース(2017年6月15日)イオン照射で染色体変異=品種改良に応用期待
    http://www.jiji.com/jc/article?k=2017061500043&g=soc
    化学工業日報(2017年6月15日)植物の染色体構造変化 量研機構など イオンビーム照射で
    日本農業新聞(2017年6月15日)染色体に変異も 自家受粉で増殖 イオンビーム照射 品種改良に応用期待
    科学新聞(2017年5月12日)植物のエピジェネティクス変化 リアルタイムにキャッチ成功 - マウス抗体の一部、植物細胞内で抗原結合 - 理科大、理研、東工大
    東京新聞(2017年4月24日)・中日新聞(2017年4月27日)びっくり!新技術 植物を透明化 葉の裏側まで丸見え
    日経バイオテクONLINE アカデミック版(2017年4月20日) 東京理科大学、植物のエピジェネティクス変化をリアルタイムに捉えることに成功 - マウスの抗体の一部が生きた植物細胞内でも抗原を認識した -
    https://bio.nikkeibp.co.jp/atcl/release/17/04/20/03844/
    日経産業新聞(2017年4月20日)遺伝子活性化で光 東京理科大 生きた植物で観察
    化学工業日報(2017年4月19日)植物DNA修飾変化 リアルタイムに解析 東京理科大など - 生きた単一細胞で初
    科学新聞(2017年3月3日)放射線ストレスに反応して形成 東京理科大 核内構造体を発見
    フジサンケイビジネスアイ(2017年2月23日)植物のストレス度合いを診断 放射線や化学物質で形成する植物の核内構造体発見 東京理科大学
  • -2016年-
    原著論文
    Fujimoto, S., Sugano, S. S., Kuwata, K., Osakabe, K and *Matsunaga, S. (2016) Visualization of specific repetitive genomic sequences with fluorescent TALEs in Arabidopsis thaliana. J. Exp. Bot., 67, 6101-6110. [新聞ネット記事] [プレスリリース]
    http://jxb.oxfordjournals.org/content/67/21/6101.full
    #Takagi, M., #Sakamoto, T., Suzuki, R., Nemoto, K., Obayashi, T., Matsunaga, T. M., Hirakawa, T., Kurihara, D., Nariai, Y., Urano, T., Sawasaki, T., *Matsunaga, S. (2016) Plant Aurora kinases interact with and phosphorylate transcription factors. J. Plant Res., 129, 1165-1178.
    http://link.springer.com/article/10.1007/s10265-016-0860-x
    Fujimoto, S., Matsunaga, S. and *Murata, M. (2016) Mapping of T-DNA and Ac/Ds by TAIL-PCR to analyze chromosomal rearrangements. Methods Mol. Biol., 1469, 207-216.
    http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27557698"
    Hirakawa, T. and *Matsunaga, S. (2016) Three dimensional, live-cell imaging of chromosome dynamics in plant nuclei using chromatin tagging systems. Methods Mol. Biol., 1469, 189-195.
    http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27557696
    Yokoyama, R., Hirakawa, T., Hayashi, S., Sakamoto, T., and *Matsunaga, S. (2016) Dynamics of plant DNA replication based on PCNA visualization. Sci. Rep., 6, 29657. [プレスリリース]
    http://www.nature.com/articles/srep29657
    Sotta, N., Shantikumar, L., Sakamoto, T., Matsunaga, S. and *Fujiwara, T. (2016) TPR5 is involved in directional cell division and is essential for the maintenance of meristem cell organisation in Arabidopsis thaliana. J. Exp. Bot., 67, 2401-2411.
    http://jxb.oxfordjournals.org/content/early/2016/02/16/jxb.erw043.full?sid=5056a9d1-44e7-4b6a-9a21-81552cc405b4
    Katagiri, Y., Hasegawa, J., Fujikura, U., Hoshino R., *Matsunaga, S. and *Tsukaya, H. (2016) The coordination of ploidy and cell size differs between cell layers in leaves. Development, 143:1120-1125.*double corresponding authors.
    http://dev.biologists.org/content/early/2016/02/22/dev.130021
    Hasegawa, J., Sakamoto, Y., Nakagami, S., Aida, M., Sawa, S. and *Matsunaga, S. (2016) Three-dimensional imaging of plant organs using a simple and rapid transparency technique. Plant Cell Physiol., 57, 462-472.
    http://pcp.oxfordjournals.org/content/57/3/462.full
    #Kimata, Y., Higaki, T., Kawashima, T., Kurihara, D., Sato, Y., Yamada, T., Hasezawa, S., Berger, F., Higashiyama, T., and *Ueda, M. (2016) Cytoskeleton dynamics control the first asymmetric cell division in Arabidopsis zygote. PNAS, 113, 14157-14162. [Cover] [新聞ネット記事] [プレスリリース]
    http://www.pnas.org/content/113/49/14157.full?sid=2e9b9b43-088d-4060-8da6-ede6c586f6b7
    #*Nambo, M., Kurihara, D., Yamada, T., Nishiwaki, O. T., Kadofusa, N., Kimata, Y., Kuwata, K., Umeda, M., and #*Ueda, M. (2016) Combination of synthetic chemistry and live-cell imaging identified a rapid cell division inhibitor in tobacco and Arabidopsis thaliana. Plant Cell Physiol., 57, 2255-2268. [新聞ネット記事] [プレスリリース]
    http://pcp.oxfordjournals.org/content/57/11/2255
    総説論文
    Fujimoto, S. and *Matsunaga, S. (2016) Chromatin live imaging with genome editing techniques: switching from scissors to a lamp. Cytologia, 81, 359-362.
    https://www.jstage.jst.go.jp/article/cytologia/81/4/81_810402/_article
    Fujimoto, S. and *Matsunaga, S. (2016) Which is a reliable approach in the generation of artificial minichromosomes, bottom-up or top-down? Cytologia, 81, 251-256.
    https://www.jstage.jst.go.jp/article/cytologia/81/3/81_810302/_article
    Hirakawa, T. and *Matsunaga, S. (2016) Chromatin tagging systems contribute to live imaging analyses for chromatin dynamics. Cytologia, 81, 121-123.
    https://www.jstage.jst.go.jp/article/cytologia/81/2/81_810203/_article
    *Matsunaga, S. (2016) FISH is in the limelight again as more a cytogenetical technique for metaphase chromosomes. Cytologia, 81, 3-6.
    https://www.jstage.jst.go.jp/article/cytologia/81/1/81_3/_article
    英語著書
    Sakamoto, T., Sakamoto, Y. and *Matsunaga, S. (2016) Cell division and cell growth. In “Molecular cell biology of the growth and differentiation of plant cells” edited by Ray Rose. CRC press, 86-98.
    日本語著書・解説
    坂本勇貴、松永幸大 (2016) 植物の透明化技術TOMEI、顕微鏡、51(3) 150-153.
    松永幸大(2016)植物細胞核内の動的空間を見る、日経バイオテク、12、36-38
    長谷川淳子、松永幸大(2016)短時間で植物組織の内部を観察する手法 TOMEI、バイオサイエンスとインダストリー、74(5) 406-408.
    長谷川淳子、松永幸大(2016)目で見るバイオ 植物の内部を切片化せずに観察、バイオサイエンスとインダストリー、74(5) 378-379.
    坂本勇貴、松永幸大(2016)生体組織・器官の透明化イメージング ケミカルエンジニヤリング、61(7) 32-36.
    藤本聡、松永幸大(2016)生細胞におけるクロマチン配置の可視化法 ケミカルエンジニヤリング 61(2) 100-103. http://ci.nii.ac.jp/naid/40020722957
    池北雅彦、武村政春、鳥越秀峰、田村浩二、水田龍信、橋本茂樹、太田尚孝、鞆達也、和田直之、松永幸大、吉澤一巳、鈴木智順、秋本和憲(2016)理工系の基礎 生命科学入門
    松永幸大 (2016) 核、394-395、植物学の百科事典
    植田美那子 (2016) 植物の初期胚イメージング系の発展、植物科学の最前線 (BSJ-Review)、7:177 (5 pages).
            
    プレスリリース
    植物の DNA を生きたまま観察できる手法を開発~ゲノム編集のハサミをランプに替えることで作物のゲノム育種に貢献~
    http://www.tus.ac.jp/today/20161011001.pdf
    植物のDNA合成をリアルタイムで観察できるPCNA法の開発~作物のバイオマス増大プロセスの解析への応用に期待~
    http://www.tus.ac.jp/today/20160715101.pdf
    細胞と葉の大きさを決める隠されたしくみ
    http://www.tus.ac.jp/today/20160406_001.pdf
    透明作物を短時間で作製する手法“TOMEI”の開発~作物の内部構造の解析やバイオマス定量解析が可能に~
    http://www.tus.ac.jp/today/201603010000.pdf
    植物の受精卵が偏る仕組みを発見 ~細胞骨格がダイナミックに変化する様子の観察に成功~ (名古屋大学)
    http://www.nagoya-u.ac.jp/about-nu/public-relations/researchinfo/upload_images/20161122_itbm.pdf
    植物の受精卵が偏る仕組みを発見 ~細胞骨格がダイナミックに変化する様子の観察に成功~(東京大学)
    http://www.k.u-tokyo.ac.jp/info/entry/22_entry522/
    植物の細胞分裂を急速に止める新規化合物の発見 ~合成化学と植物科学の融合から植物の成長を制御する新たな薬剤の探索~(名古屋大学)
    http://www.nagoya-u.ac.jp/about-nu/public-relations/researchinfo/upload_images/20161110_itbm.pdf
    新聞ネット記事・テレビ報道
    科学新聞(2016年10月28日)生きたまま植物DNA解析 TALE-FP法 東京理科大グループが開発
    日経バイオテクONLINE アカデミック版(2016年10月27日) 理科大と京大、名大、徳島大、生きた植物の核内DNAを解析できるTALE FP法 - ゲノム編集ツールで植物のエピゲノム育種にも貢献
    https://bio.nikkeibp.co.jp/atclac/news/16/10/27/00254/?ST=academic
    フジサンケイビジネスアイ(2016年10月26日)植物のDNAを生きたまま観察できる手法を開発 東京理科大学
    化学工業日報(2016年10月20日)東京理科大など 蛍光たんぱく ゲノム編集で配置 - 植物DNAを生きたまま観察 作物育種技術に応用期待
    日経産業新聞(2016年10月20日)生きた植物 DNA観察 東京理科大 ゲノム編集で発光
    科学新聞(2016年7月29日)植物のDNA合成 リアルタイム観察 ~理科大が「PCNA法」開発~
    化学工業日報(2016年7月20日)植物のDNA合成 生きた細胞から解析 東京理科大・JST
    日刊工業新聞(2016年4月6日)植物の細胞核と細胞のサイズ比例、葉表皮の限定現象‐東大など発見
    科学新聞(2016年3月25日)透明作物を短時間で作製 理科大、熊本大など新たな手法開発
    文化放送「オトナカレッジ」(2016年3月15日)植物の透明化に新たな発見
    フジサンケイビジネスアイ(2016年3月31日号)大学発 ここにあり!日本を支える研究活動と技術開発: 植物を透明にして内部構造を観察する手法の開発
    読売新聞(2016年3月7日)植物、数時間で透明に
    化学工業日報(2016年3月7日)作物を2時間で透明化 内部構造研究や害虫検査が 容易に 東京理科大など
    朝日新聞(2016年3月1日)植物まるごと透明化
    熊本日日新聞(2016年3月1日)短時間で植物透明化 品種改良、害虫検出に
    日刊工業新聞(2016年3月1日)短時間で植物透明化 傷付けず内部構造観察 東京理科大など
    Kentucky University (2016年12月2日) UK research provides insight into plant cell division
    http://news.ca.uky.edu/article/uk-research-provides-insight-plant-cell-division
    Global Plant Council (2016年11月30日) THREE RINGS STOP CELL DIVISION IN PLANTS: DEVELOPMENT OF A TRIARYLMETHANE COMPOUND FOR POSSIBLE CONTROL OF PLANT GROWTH
    http://www.globalplantcouncil.org/news-events/latest-news/three-rings-stop-cell-division-in-plants-development-of-a-triarylmethane-compound-for-possible-control-of-plant-growth
    Phys.Org (2016年11月29日) Live cell imaging of asymmetric cell division in fertilized plant cells
    http://phys.org/news/2016-11-cell-imaging-asymmetric-division-fertilized.html
    Science Daily (2016年11月29日) Live cell imaging of asymmetric cell division in fertilized plant cells Insight into why leaves grow up and roots grow down in flowering plants
    https://www.sciencedaily.com/releases/2016/11/161129084231.htm
    Science Magazine (2016年11月29日) Live cell imaging of asymmetric cell division in fertilized plant cells
    http://scienmag.com/live-cell-imaging-of-asymmetric-cell-division-in-fertilized-plant-cells/
    Bioengineer (2016年11月29日) Live cell imaging of asymmetric cell division in fertilized plant cells
    https://bioengineer.org/live-cell-imaging-of-asymmetric-cell-division-in-fertilized-plant-cells/
    AlphaGalileo (2016年11月29日) Live cell imaging of asymmetric cell division in fertilized plant cells ~ Insight into why leaves grow up and roots grow down in flowering plants ~
    http://www.alphagalileo.org/ViewItem.aspx?ItemId=170420&CultureCode=en
    ResearchSEA (2016年11月29日) An international group of plant biologists have succeeded for the first time in visualizing how egg cells in plants divides unequally after being fertilized.
    http://www.researchsea.com/html/article.php/aid/10234/cid/1/research/science/
    institute_of_transformative_bio-molecules__wpi-itbm___nagoya_university/
    live_cell_imaging_of_asymmetric_cell_division_in_fertilized_plant_cells.html
    EurekAlert! (2016年11月29日) Live cell imaging of asymmetric cell division in fertilized plant cells
    https://www.eurekalert.org/pub_releases/2016-11/iotb-lci112916.php
    日経産業新聞 (2016年11月28日) 受精卵の非対称分裂解明 名大、植物で
    Phys.Org (2016年11月25日)Development of a triarylmethane compound for possible control of plant growth
    http://phys.org/news/2016-11-triarylmethane-compound-growth.html
    Science Daily (2016年11月25日)Three rings stop cell division in plants Development of a triarylmethane compound for possible control of plant growth
    https://www.sciencedaily.com/releases/2016/11/161125084223.htm
    Alpha Galileo JP (2016年11月25日)植物の細胞分裂を急速に止める新規化合物の発見 ~合成化学と植物科学の融合から植物の成長を制御する新たな薬剤の探索~
    http://www.alphagalileo.org/ViewItem.aspx?ItemId=170337&CultureCode=ja
    EurekAlert! (2016年11月25日)植物の細胞分裂を急速に止める新規化合物の発見 合成化学と植物科学の融合から植物の成長を制御する新たな薬剤の探索
    https://www.eurekalert.org/pub_releases_ml/2016-11/iotb-k112516.php
    日本の研究.com (2016年11月24日) 植物の受精卵が偏る仕組みを発見 ~細胞骨格がダイナミックに変化する様子の観察に成功~
    https://research-er.jp/articles/view/52743
    朝日新聞 (2016年11月22日) 花・葉は上に 根は下に ?どうやって? 受精卵のたんぱく質2種を観察
    中日新聞 (2016年11月22日) 植物受精卵 細胞分裂の仕組み確認
    日本の研究.com (2016年11月10日) 植物の細胞分裂を急速に止める新規化合物の発見 ~合成化学と植物科学の融合から植物の成長を制御する新たな薬剤の探索~
    https://research-er.jp/articles/view/52160
  • -2015年-
    原著論文
    Izaguirre-Carbonell, J., Kawakubo, H., Murata, H., Tanabe, A., Takeuchi, T., Kusayanagi, T., Tsukuda, S., Hirakawa, T., Iwabata, K., Kanai, Y., Ohta, K., Miura, M., Sakaguchi, K., Matsunaga, S., Sahara, H., Kamisuki, S., and Sugawara, F. (2015) Novel anticancer agent, SQAP, binds to focal adhesion kinase and modulates its activity. Sci. Rep., 5, 15136.
    http://www.nature.com/articles/srep15136
    Oroguchi, T., Sekiguchi, Y., Kobayashi, A., Masaki, Y., Fukuda, A., Hashimoto, S., *Nakasako, M., Ichikawa, I., Kurumizaka, H., Shimizu, M., Inui, Y., Matsunaga, S., Kato, T., Namba, K., Yamaguchi, K., Kuwata, K., Kameda, H., Fukui, N., Kawata, Y., Kameshima, T., Takayama, Y., Yonekura, K., and Yamamoto, M. (2015) Cryogenic coherent X-ray diffraction imaging for biological non-crystalline particles using the KOTOBUKI-1 diffraction apparatus at SACLA. J. Phys. B., 48, 184003 (11 pages).
    http://iopscience.iop.org/0953-4075/48/18/184003/metrics
    Hirakawa, T., Katagiri, Y., Ando, T. and *Matsunaga, S. (2015) DNA double-strand breaks alter the spatial arrangement of homologous loci in plant cells. Sci. Rep., 5, 11058 (8 pages). [プレスリリース][新聞ネット記事]
    http://www.nature.com/articles/srep11058
    #Takayama, Y., #Inui, Y., #Sekiguchi, Y., Kobayashi, A., Oroguchi, T., Yamamoto, M., *Matsunaga, S., *Nakasako, M. (2015) Coherent X-ray diffraction imaging of chloroplasts from Cyanidioschyzon merolae by using X-ray free electron laser. Plant Cell Physiol., 56, 1272-1286. [プレスリリース][新聞ネット記事][Cover]
    http://pcp.oxfordjournals.org/content/early/2015/03/04/pcp.pcv032
    Gooh, K., Ueda, M., Aruga, K., Park, J., Arata, H., Higashiyama, T., and *Kurihara, D. (2015) Live-cell imaging and optical manipulation of Arabidopsis early embryogenesis. Dev. Cell 34, 242-251.
    http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1534580715003974
    *Maruyama, D., Volz, R., Takeuchi, H., Mori, T., Igawa, T., Kurihara, D., Kawashima, T., Ueda, M., Ito, M., Umeda, M., Nishikawa, S., Gros-Hardt, R., and Higashiyama, T. (2015) Rapid elimination of the persistent synergid through a cell fusion mechanism. Cell 161, 907-918.
    http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867415003050
    日本語著書・解説
    平川健、松永幸大 (2015) DNA損傷時における植物クロマチン動態のイメージング解析、ISOTOPES NEWS、741:26-30
    プレスリリース
    低温X線回析イメージングによる葉緑体内部構造の非侵襲・高分解能観察に成功 (2015年7月13日)
    http://www.keio.ac.jp/ja/press_release/2015/osa3qr000000z1go.html
    植物の放射線傷害への応答反応を可視化することに成功~放射線により生じた傷を治すために染色体はダイナミックに動いていた~ (2015年6月3日)
    http://www.tus.ac.jp/today/20150605001.pdf
    新聞ネット記事・テレビ報道
    化学工業日報 (2015年7月23日) 葉緑体内部を観察 慶大 ― 理科大が新技術 非侵襲で高解像度
    日本経済新聞 (2015年6月29日) 転移がん高精度判定 東京理科大など 画像解析ソフト
    化学工業日報 (2015年6月22日) 東京理科大 植物細胞の染色体 動態変化を可視化 放射線に強い品種作出へ前進
    科学新聞 (2015年6月19日) 植物の放射線傷害応答反応を可視化
    原子力産業新聞 (2015年6月9日) 東京理科大、植物の放射線障害に対する応答反応を可視化
    日刊工業新聞 (2015年6月8日) 放射線傷害を受けた植物の細胞で染色体接近、DNA修復の可能性 ― 東京理科大が発見

杉本班

  • -2017年-
            
    原著論文
    Rymen B, Kawamura, A, Schaefer S, Breuer C, Iwase, A., Shibata M, Ikeda M, Mitsuda N, Koncz C, Ohme-Takagi M, Matsui M and *Sugimoto, K. (2017) ABA suppresses root hair growth through OBP4-mediated repression of RSL2, Plant Physiol., in press.
    Iwase, A., Harashima, H., Ikeuchi, M., Rymen, B., Ohnuma, M., Komaki, S., Morohashi, K., Kurata, T., Nakata, M., Ohme-Takagi, M., Grotewold, E., and *Sugimoto, K. (2017) WIND1 Promotes Shoot Regeneration through Transcriptional Activation of ENHANCER OF SHOOT REGENERATION1 in Arabidopsis, Plant Cell, 29, 54-69. [プレスリリース]
    http://www.plantcell.org/content/29/1/54
    Li, C., Sako, Y., Imai, A., Nishiyama, T., Thompson, K., Kubo, M., Hiwatashi, Y., Kabeya, Y., Karlson, D., Wu, S-H., Ishikawa, M., Murata, T., Benfey, P. N., Sato, Y., Tamada, Y., and Hasebe, M. (2017) A Lin28 homologue reprograms differentiated cells to stem cells in the moss Physcomitrella patens, Nature Com., in press. [プレスリリース]
    http://www.nature.com/articles/ncomms14242
    プレスリリース
    動物と植物に共通の幹細胞化誘導因子の発見 (2017年1月27日)
    http://www.nibb.ac.jp/pressroom/news/2017/01/27.html
    植物が傷口で茎葉を再生させる仕組み -組織培養による植物の量産や有用物質生産に期待- (2017年1月17日)
    http://www.riken.jp/pr/press/2017/20170117_2/
    総説論文
    #Franciosini A, #Rymen B, Shibata M, Favero D,S, and *Sugimoto K. (2017) Molecular networks orchestrating plant cell growth. Curr Opin Plant Biol., 35, 98-104.
    http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1369526616301984
  • -2016年-
    原著論文
    Heyman J, Cools T, Shavialenka S, Canher B, Traas J, Vercauteren I, Van den Daele H, Persiau G, De Jaeger G, Sugimoto K, and *De Veylder L. (2016) The heterodimeric transcription factor complex ERF115-PAT1 grants regeneration competence. Nature Plants, 16165.
    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27797356
    De Lucas M, Pu L, Turco G, Gaudinier A, Morao AK, Harashima H, Kim D, Ron M, Sugimoto K, Roudier F, and *Brady S. (2016) Transcriptional regulation of Arabidopsis Polycomb Repressive Complex 2 coordinates cell-type proliferation and differentiation. Plant Cell, 28, 2616-2631
    http://www.plantcell.org/content/28/10/2616.full
    Weimer AK, Biedermann S, Harashima H, Roodbarkelari F, Takahashi N, Foreman J, Guan Y, Pochon G, Heese M, Van Damme D, Sugimoto K, Koncz C, Doerner P, Umeda M, and *Schnittger A. (2016) The plant-specific CDKB1-CYCB1 complex mediates homologous recombination repair in Arabidopsis. EMBO J, 35, 2068-2086.
    http://emboj.embopress.org/content/35/19/2068
    Favero DS, Jacques CN, Iwase A, Le KN, Zhao J, Sugimoto K, and *Neff MM. (2016) SUPPRESSOR OF PHYTOCHROME B4-#3 represses genes associated with auxin signaling to modulate hypocotyl growth. Plant Physiol., 171:2701-16.
    http://www.plantphysiol.org/content/early/2016/06/24/pp.16.00405.abstract
    Cifuentes M, Jolivet S, Cromer L, Harashima H, Bulankova P, Renne C, Crismani W, Nomura Y, Nakagami H, Sugimoto K, Schnittger A, Riha K, and *Mercier R. (2016) TDM1 regulation determines the number of meiotic divisions. PLoS Genet, e1005856.
    http://journals.plos.org/plosgenetics/article?id=10.1371/journal.pgen.1005856
    総説論文
    *Schnittger A and *Sugimoto K. (2016) A journey to the interior of the cell. Curr Opin Plant Biol., in press.
    Ikeuchi M, Ogawa Y, Iwase A, *Sugimoto K. (2016) Plant regeneration: cellular origins and molecular mechanisms Developmet 143:1442-1451
    http://dev.biologists.org/content/143/9/1442
    Harashima H, *Sugimoto K. (2016) Integration of developmental and environmental signals into cell proliferation and differentiation through RETINOBLASTOMA-RELATED 1 Curr Opin Plant Biol., 29:95-103.
    http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1369526615300054
    新聞ネット記事・テレビ報道
    日経サイエンス 1月号「植物の分化の逆戻りを制御する仕組みを発見」
  • -2015年-
    原著論文
    Narender K, Harashima H, Shweta K, Jonathan B, Wang K, Sizani B. L, Bertrand L. L, Johnson M. C, Faulk C, Dale R, Simmons L. A, Churchman M. L, Sugimoto K, Kato N, Dasanayake M, Beemster G, Schnittger A and Larkin J. C (2015) Functional Conservation in the SIAMESE-RELATED Family of Cyclin-Dependent Kinase Inhibitors in Land Plants.
    Plant Cell.27:3065-3080
    http://www.plantcell.org/content/early/2015/11/06/tpc.15.00489.
    #Ikeuchi M, #Iwase A, Rymen B, H Harashima H, Shibata M, Ohnuma M, Breuer C, Morao AK, de Lucas M, De Veylder L, Goodrich J, Brady SM, Roudier F, and *Sugimoto K. (2015) PRC2 represses dedifferentiation of mature somatic cells in Arabidopsis. Nature Plants. 15089. [プレスリリース][新聞ネット記事] [Cover] [editorialに解説記事あり]
    http://www.nature.com/articles/nplants201589
    Kobayashi K, Suzuki T, Iwata E, Nakamichi N, Suzuki T, Chen P, Ohtani M, Ishida T, Hosoya H, Muller S, Leviczky T, Pettko-Szandtner A, Darula Z, Iwamoto A, Nomoto M, Tada Y, Higashiyama T, Demura T, Doonan JH, Hauser MT, Sugimoto K, Umeda M, Magyar Z, Bogre L, and *Ito M. (2015) Transcriptional repression by MYB3R proteins regulates plant organ growth. EMBO J 34(15): 1992-2007.
    http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.15252/embj.201490899/abstract
    Narukawa H, Yokoyama R, Komaki S, Sugimoto K, and *Nishitani K. (2015) Stimulation of cell elongation by tetraploidy in hypocotyls of dark-grown Arabidopsis seedlings. PLoS ONE 10(8):e0134547.
    http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0134547
    *Iwase A, Mita K, Nonaka S, Ikeuchi M, Koizuka C, Ohnuma M, Ezura H, Imamura J, *Sugimoto K. (2015) WIND1-based acquisition of regeneration competency in Arabidopsis and rapeseed. J Plant Res 128(3):389-97.
    http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25810222
    Kimura Y, Aoki S, Ando E, Kitatsuji A, Watanabe A, Ohnishi M, Takahashi K, Inoue S, Nakamichi N, Tamada Y and *Kinoshita T. (2015) A flowering integrator, SOC1, affects stomatal opening in Arabidopsis thaliana. Plant Cell Physiol., 56, 640-649.
    総説論文
    Ikeuchi M, Iwase A, *Sugimoto K (2015) Control of plant cell differentiation by histone modification and DNA methylation
    Curr. Opin. Plant. Biol.28:60-67
    http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1369526615001442
    *Sugimoto K (2015) Plant cell reprogramming as an adaptive strategy. J Plant Res 128(3):345-7.
    http://link.springer.com/article/10.1007%2Fs10265-015-0718-7
    プレスリリース
    植物の細胞分裂を支配する新しい調節因子を発見 ― 植物のバイオマス増強に期待 ― (2015年6月11日)
    http://www.nagoya-u.ac.jp/about-nu/public-relations/researchinfo/upload_images/20150611_agr.pdf
    植物の分化全能性抑制の分子メカニズムの一端を解明 ― ヒストンのメチル化で一度分化した細胞の脱分化を抑える ― (2015年6月30日)
    http://www.riken.jp/pr/press/2015/20150630_1/
    新聞ネット記事・テレビ報道
    日刊工業新聞 (2015年6月30日) 理研、植物の分化能力抑制の仕組み解明-たんぱく質「RPC2」が不必要な分化を制御
    Nature Plants(2015年6月29日)の著者インタビューを受けました。
    The Huffington Post (2015年10月30日)「植物の分化の逆戻りを制御する仕組みを発見」

福田班

  • -2017年-
    英語著書
    Saito, M., Nurani, A.M., *Kondo, Y. and *Fukuda H. (2017) Tissue culture of xylem differentiation with Arabidopsis leaves. In “Xylem-Methods and Protocols” edited by M. de Lucas and J. P. Etchells. Humana press, 59-65.
  • -2016年-
            
    原著論文
    *Kondo, Y., Nurani, A.M., Saito, C., Ichihashi,Y., Saito, M., Yamazaki, K., Mitsuda, N., Ohme-Takagi, M., and *Fukuda, H. (2016) Vascular cell Induction culture System Using Arabidopsis Leaves (VISUAL) visualizes the sequential differentiation of sieve element-like cells. Plant Cell, 28, 1250-1262.
    http://www.plantcell.org/content/early/2016/05/18/tpc.16.00027.abstract
    *Doi, H., Chinen, A., Fukuda, H., Usuda, Y. (2016) Vibrio algivorus sp. nov., an alginate and agarose assimilating bacterium isolated from the gut flora of a turban shell marine snail. Int. J. Syst. Evol. Micr., 66, 3164-3169.
    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27199227
    Inada, N., Betsuyaku, S., Shimada, T., Ebine, K., Ito, E., Kutsuna, N., Hasezawa, S., Takano, Y., and Fukuda, H., Nakano, A. and *Ueda, T. (2016) Modulation of plant RAB GTPase-mediated membrane trafficking pathway at the interface between plants and obligate biotrophic pathogens. Plant Cell Physiol., 57, 1854-1864. [Editor-in-chief's choice]
    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27318282
    Morita, J., Kato, K., Nakane, T., Kondo, Y., Fukuda, H., Nishimasu, H., *Ishitani R., and *Nureki, O. (2016) Crystal structure of the plant receptor-like kinase TDR in complex with the TDIF peptide. Nature Com., 7, 12383.
    http://www.nature.com/ncomms/2016/160808/ncomms12383/full/ncomms12383.html
    *Naramoto, S., Dainobu, T., Tokunaga, H., Kyozuka, J. and Fukuda, H. (2016) Cellular and developmental function of ACAP type ARF-GAP proteins are diverged in plant cells. Plant Biotechnology, 33, 309-314.
    https://www.jstage.jst.go.jp/article/plantbiotechnology/33/4/33_16.0309a/_article
    Tazoe, Y., Sazuka, T., Yamaguchi, M., Saito, C., Ikeuchi, M., Kanno, K., Kojima, S., Hirano, K., Kitano, H., Kasuga, S., Endo, T., Fukuda, H., and *Makino, A. (2016) Growth properties and biomass production in the hybrid C4 crop sorghum bicolor. Plant Cell Physiol., 57, 944-952.
    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26508521
    Zeng, J., Ding, Q., Fukuda, H., and *He, X.-Q. (2016) Fertilization Independent Endosperm genes repress NbGH3.6 and regulate the auxin level during shoot development in Nicotiana benthamiana. J. Exp. Bot., 67, 2207-2217.
    http://jxb.oxfordjournals.org/content/67/8/2207
    Endo, M., Shimizu, H., and Araki, T. (2016) Rapid and simple leaf tissue isolation in Arabidopsis thaliana. Nature Protocols, 11, 1388 (8 pages).
    Shimizu, H., Torii, K., Araki, T., and *Endo, M., (2016) Importance of epidermal clocks for regulation of hypocotyl elongation through PIF4 and IAA29. Plant Signal. Behav., 11, e1143999.
    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26829165
    Higo, A., Niwa, M., Yamato, K. T., Yamada, L., Sawada, H., Sakamoto, T., Kurata, T., Shirakawa, M., Endo, M., Shigenobu, S., Yamaguchi, K., Ishizaki, K., Nishihama, R., Kohchi, T. and *Araki, T. (2016) Transcriptional framework of male gametogenesis in the liverwort Marchantia polymorpha L. Plant Cell Physiol., 57, 325-38.
    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26858289
    Endo, M., Araki, T., and *Nagatani, A. (2016) Tissue-specific regulation of flowering by photoreceptors. Cell Mol. Life Sci., 73, 829-39.
    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26621669
    総説論文
    Fukuda, H. (2016) Signaling, transcriptional regulation, and asynchronous pattern formation governing plant xylem development. Proc. Japan Acad. Series B, 92, 98-107.
    https://www.jstage.jst.go.jp/article/pjab/92/3/92_PJA9203B-02/_article
    *Ohashi, I. K. and Fukuda, H. (2016) Functional mechanism of bHLH complexes during early vascular development. Curr. Opin. Plant Biol., 33, 42-47.
    http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1369526616300863
    *Endo, M. (2016) Tissue-specific circadian clocks in plants. Curr. Opin. Plant Biol., 29, 44-49.
    http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1369526615001727
    日本語著書・解説
    *福田裕穂、近藤侑貴、小澤靖子、岩本訓知,小田祥久 (2016) 木部細胞分化誘導、植物細胞壁実験法(石井忠他編)、弘前大学出版会、221-229.
    東京大学生命科学教科書編集委員会編 (2016) 演習で学ぶ生命科学-物理・化学・数理からみる生命科学入門、203.
    *福田裕穂 (2016) 学問ってスゴイ、維管束細胞の研究、My Vision、2016(2) 6-7
    *福田裕穂 (2016) 理学への招待 II-理学の楽しみ-、教養学部報、583、5-6.
    *福田裕穂 (2016) 理学部の魅力って何?-「無から問いをつくる力」、それは失敗の繰り返しから-、蛍雪時代8月号付録, 全国大学理学部・工学部系統の総合的研究、16-18.
    古藤 知子、清水 華子、遠藤求 (2016) 植物における非集中型の概日時計システム、化学と生物、54(7) 461-463.
    遠藤求 (2016) 植物の体内時計はどこにある?、じっきょう理科資料、78、1.
    プレスリリース
    植物のホルモンTDIFとその受容体TDRの複合体の「かたち」を解明 (2016年8月8日)
    http://www.s.u-tokyo.ac.jp/ja/info/4979/
    維管束の細胞を作り出す方法“VISUAL”の開発 (2016年5月20日)
    http://www.s.u-tokyo.ac.jp/ja/press/2016/4689/
    新聞ネット記事・テレビ報道
    日経産業新聞(2016年5月24日)篩管細胞、葉で増殖。栄養運搬、仕組み解明に道。東大が技術
    科学新聞(2016年7月15日)ゴットフリード・ワグネル賞 -3部門で若手研究者3氏に-
  • -2015年-
    原著論文
    Kawamoto, N., Endo, M., and *Araki, T. (2015) Expression of a kinase-dead form of CPK33 involved in florigen complex formation causes delayed flowering. Plant Signal. Behav., 10, e1086856, 1-2.
    Shimizu, H., Katayama, K., Koto, T., Torii, K., Araki, T., and Endo, M. (2015) Decentralized circadian clocks process thermal and photoperiodic cues in specific tissues. Nature Plants.1, Article number: 15163.
    http://www.nature.com/articles/nplants2015163
    Katayama H, Iwamoto K, Kariya Y, Asakawa T, Kan T, Fukuda H, Ohashi-Ito K. (2015) A Negative Feedback Loop Controlling bHLH Complexes Is Involved in Vascular Cell Division and Differentiation in the Root Apical Meristem. Curr Biol. 25(23):3144-50.
    http://www.cell.com/current-biology/abstract/S0960-9822(15)01345-7
    Shinohara N, Kakegawa K, Fukuda H. (2015) Monoclonal antibody-based analysis of cell wall remodeling during xylogenesis. J Plant Res. 128: 975-986.
    http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26464036
    Kondo, Y., Fujita, T., Sugiyama, M., and Fukuda, H. (2015) A novel system for xylem cell differentiation in Arabidopsis thaliana. Mol. Plant, 8, 612-621
    http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1674205214000264
    Shimizu, H., Araki, T. and *Endo, M. (2015) Photoperiod sensitivity of the Arabidopsis circadian clock is tissue-specific. Plant Signal. Behav.,. 10, e1010933
    http://www.tandfonline.com/doi/abs/10.1080/15592324.2015.1010933#.Vd_rJdwVjoo
    Kawamoto, N., Sasabe, M., Endo, M., Machida, Y., and *Araki, T. (2015) Calcium-dependent protein kinases responsible for the phosphorylation of a bZIP transcription factor FD crucial for the florigen complex formation. Scientific Reports, 5, 8341.
    総説論文
    Kondo, Y., Fukuda, H. (2015) The TDIF signaling network. Curr Opin Plant Biol. 28:106-10.
    http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1369526615001508
    新聞ネット記事・テレビ報道
    Nature Plants, News & Views. 2015年11月「Who knows where the time goes.」
    京都新聞 2015年11月3日「植物 組織ごとに体内時計、京大グループ解明 成長制御 技術に光」
    JST サイエンスポータル 2015年12月14日「存戦略を反映? 動物と違う植物の体内時 計 - 動物には指揮者が1 人、植物にはあちこちに ?」

篠崎班

  • -2017年-
            
    原著論文
    Kidokoro S, Yoneda K, Takasaki H, Takahashi F, Shinozaki K, *Yamaguchi-Shinozaki K. (2017) Different cold-signaling pathways function in the responses to rapid and gradual decreases in temperature. Plant Cell, 29, 760-774.[プレスリリース]
    http://www.plantcell.org/content/29/4/760
    Todaka D, Zhao Y, Yoshida T, Kudo M, Kidokoro S, Mizoi J, Kodaira KS, Takebayashi Y, Kojima M, Sakakibara H, Toyooka K, Sato M, Fernie AR, Shinozaki K, *Yamaguchi-Shinozaki K. (2017) Temporal and spatial changes in gene expression, metabolite accumulation and phytohormone content in rice seedlings grown under drought stress conditions. Plant J., 90, 61-78.
    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28019048
    Urano K, Maruyama K, Jikumaru Y, Kamiya Y, Yamaguchi-Shinozaki K, *Shinozaki K (2017) Analysis of plant hormone profiles in response to moderate dehydration stress. Plant J., 90, 17-36.
    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27995695
    #Soma F, #Mogami J, Yoshida T, Abekura M, Takahashi F, Kidokoro S, Mizoi J, Shinozaki K, and *Yamaguchi-Shinozaki K. (2017) ABA-unresponsive SnRK2 protein kinases regulate mRNA decay under osmotic stress in plants, Nature Plants, 3, 16204. [プレスリリース]
    http://www.nature.com/articles/nplants2016204
    *Maruyama K, Ogata T, Kanamori N, Yoshiwara K, Goto S, Yamamoto Y, Tokoro Y, Noda C, Takaki Y, Urawa H, Iuchi S, Urano K, Yoshida T, Sakurai T, Kojima M, Sakakibara H, Shinozaki K, and Yamaguchi-Shinozaki K. (2017) Design of an optimal promoter involved in the heat-induced transcriptional pathway in Arabidopsis, soybean, rice, and maize. Plant J., 89, 671-680.
    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27862521
    Kudo M, Kidokoro S, Yoshida T, Mizoi J, Todaka D, Fernie A, Shinozaki K, and *Yamaguchi-Shinozaki K. (2017) Double overexpression of DREB and PIF transcription factors improves drought stress tolerance and cell elongation in transgenic plants. Plant Biotechnol J., 15, 458-471.
    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27683092
    Masuta Y, Nozawa K, Takagi H, HYaegashi H, Tanaka K, Ito T, Saito H, Kobayashi H, Matsunaa W, Masuda S, Kato A, and *Ito H. (2017) Inducible transposition of a heat-activated retrotransposon in tissue culture. Plant cell physiol., 58, 375-384.
    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28013279
    プレスリリース
    植物は2つの異なる応答機構によって低温ストレスに対する耐性を獲得している(2017年3月27日)
    http://www.a.u-tokyo.ac.jp/topics/2017/20170330-2.html
    植物の水分欠乏時の成長促進機構の発見 -作物の乾燥や塩ストレス時の成長や収穫を向上させる技術開発への貢献に期待-(2017年1月11日)
    http://www.a.u-tokyo.ac.jp/topics/2016/20170111.html
    新聞ネット記事・テレビ報道
    日経バイオテク電子版(2017年1月12日)国立大学法人東京大学、植物の水分欠乏時の成長促進機構の発見
    https://bio.nikkeibp.co.jp/atcl/release/17/01/12/03330/
    日本工業新聞(2017年1月9日)東大、植物の水分欠乏時に成長促す仕組み発見
    日本経済新聞(2017年1月7日)東大と理研、植物の水分欠乏時の成長促進機構を発見
  • -2016年-
    原著論文
    Masuda S, Nozawa K, Matsunaga W, Masuta Y, Kawabe A, Kato A, and Ito *Ito H. (2016) Characterization of a heat-activated retrotransposon in natural accessions of Arabidopsis thaliana. Genes Genet. Syst., in press.
    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27980240
    Honna PT, Fuganti-Pagliarini R, Ferreira LC, Molinari MDC, Marin SRR, de Oliveira MCN, Farias JRB, Neumaier N, Mertz-Henning LM, Kanamori N, Nakashima K, Takasaki H, Urano K, Shinozaki K, Yamaguchi-Shinozaki K, Desiderio JA, and *Nepomuceno AL.(2016)Molecular, physiological, and agronomical characterization, in greenhouse and in field conditions, of soybean plants genetically modified with AtGolS2 gene for drought tolerance. Mol Breeding, 36, 157.
    http://link.springer.com/article/10.1007/s11032-016-0570-z
    Sato H, Todaka D, Kudo M, Mizoi J, Kidokoro S, Zhao Y, Shinozaki K, and *Yamaguchi-Shinozaki K. (2016) The Arabidopsis transcriptional regulator DPB3-1 enhances heat stress tolerance without growth retardation in rice. Plant Biotechnol. J., 14, 1756-1767. [プレスリリース]
    http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26841113
    Ohama N, Kusakabe K, Mizoi J, Zhao H, Kidokoro S, Koizumi S, Takahashi F, Ishida T, Yanagisawa S, Shinozaki K, and *Yamaguchi-Shinozaki K. (2016) The transcriptional cascade in the heat stress response of Arabidopsis is strictly regulated at the expression levels of transcription factors. Plant Cell, 28, 181-201.[プレスリリース]
    http://www.plantcell.org/content/early/2015/12/29/tpc.15.00435.full.pdf+html
    In Briefで紹介されました。
    *Ito H., Kim JM, Matsunaga W, Saze H, Matsui A, Endo TA, Harukawa Y, Takagi H, Yaegashi H, Masuta Y, Masuda S, Ishida J, Tanaka M, Takahashi S, Morosawa T, Toyoda T, Kakutani T, Kato A, Seki M. (2016) A stress-Activated Transposon in Arabidopsis Induces transgenerational Abscisic Acid Insensitivity. Sci. Rep., in press.
    http://www.nature.com/articles/srep23181
    総説論文
    #Ohama N, #Sato H, Shinozaki K, and *Yamaguchi-Shinozaki K. (2016) Transcriptional regulatory network of plant heat stress response. Trends Plant Sci., 22, 53-65.
    http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1360138516301261
    プレスリリース
    イネの高温ストレス耐性を向上する方法の開発 - 温暖化や熱波による農作物の収量低下を防ぐ技術応用に期待 -(2016年2月4日) http://www.a.u-tokyo.ac.jp/topics/2016/20160204-1.html
    植物の高温に対する初期応答のメカニズムを解明 - 作物の高温ストレス耐性を向上させる技術開発への貢献に期待 -(2016年1月5日)http://www.a.u-tokyo.ac.jp/topics/2016/20160105-1.html
    新聞ネット記事・テレビ報道
    TBSテレビ「未来の起源」出演(2016年4月17日)
    植物の高温ストレスに対する感知応答メカニズムについて研究成果を話しました。
    日経バイオテク(2016年2月18日)植物の高温ストレス耐性を高める新遺伝子戦略
  • -2015年-
    原著論文
    Takasaki H, Maruyama K, Takahashi F, Fujita M, Yoshida T, Nakashima K, Myouga F, Toyooka K, *Yamaguchi-Shinozaki K, and *Shinozaki K. (2015) SNAC-As, stress-responsive NAC transcription factors, mediate ABA-inducible leaf senescence. Plant J., 84, 1114-1123.[プレスリリース]
    http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/tpj.13067/full
    Shida T, Fukuda A, Saito T, Ito H, and *Kato A. (2015) AtRBP1, which encodes an RNA-binding protein containing RNA-recognition motifs, regulates root growth in Arabidopsis thaliana. Plant Physiol. Bioch., 92, 62-70.
    http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0981942815300103
    Matsunaga W, Ohama N, Tanabe N, Masuta Y, Masuda S, Mitani-Umeno N, *Yamaguchi-Shinozaki K, Ma JF, Kato A, and *Ito H. (2015) A small RNA mediated regulation of a stress-activated retrotransposon and the tissue specific transposition during the reproductive period in Arabidopsis. Front. Plant Sci., 6, 48 (12 pages).
    http://eprints.lib.hokudai.ac.jp/dspace/bitstream/2115/58270/3/FPLA_06_00048.pdf
    総説論文
    Yoshida T, Mogami J, and *Yamaguchi-Shinozaki K (2015) Omics Approaches Toward Defining the Comprehensive Abscisic Acid Signaling Network in Plants.
    Plant Cell Physiol., 56, 1043-1052.
    http://pcp.oxfordjournals.org/content/early/2015/04/25/pcp.pcv060.full.pdf+html
    日本語著書・解説
    佐藤輝、篠崎和子 (2015) 植物の乾燥・高温応答の解明と再生作物の開発に向けて,
    Bio Industry, 32(12): 25-31
    大濱直彦、篠崎和子 (2015) 高温環境を生き抜くための植物の転写制御機構、
    化学と生物 53(10): 696-702 https://katosei.jsbba.or.jp/index.php?aid=459
    プレスリリース
    長期の乾燥による葉の黄化防止に関わる遺伝子を発見 - 作物の黄化制御技術の開発に応用 -
    (2015年11月27日)http://www.a.u-tokyo.ac.jp/topics/2015/20151127-1.html
    新聞ネット記事・テレビ報道
    日本農業新聞(2015年12月15日)干ばつ時でも植物の黄化抑制
    化学工業日報(2015年12月7日)乾燥による葉の黄化制御 理研が関与遺伝子発見
    日経電子版(2015年11月27日)理研と東大、長期の乾燥による葉の黄化防止に関わる遺伝子のメカニズムを解明 長期の乾燥による葉の黄化防止に関わる遺伝子を発見 -作物の黄化制御技術の開発に応用-

角谷班

白須班