研究室で話題に出てきた参考文献 literature

• Tsunoda et al., Dissolution behaviors of famotidine and cimmetidineの原稿作成においてバックグラウンド調査したもの
  【1】Hofmeister系列・kosmotropic効果の国際的文脈 Collins (2004, Methods) によるlaw of matching water affinities、 Ball & Hallsworth (2015, PCCP)、Marcus (2009, Chem. Rev.) ——これらはkosmotropic効果の基礎として世界標準的に引用される論文です。(Claude 2026/04/01)
  1. Collins, K.D.; (2004) "Ions from the Hofmeister series and osmolytes: effects on proteins in solution and in the crystallization process", Methods, 34(3):300-311.
  2. Marcus, Y.; (2009) "Effect of Ions on the Structure of Water: Structure Making and Breaking", Chem. Rev., 109(3):1346-1370.
  3. Ball, P.; Hallsworth, J.E.; (2015) "Water structure and chaotropicity: their uses, abuses and biological implications", Phys. Chem. Chem. Phys., 17:8297-8305.
  【2】リン酸緩衝液 vs. 生体関連緩衝液の問題 製薬分野では「リン酸緩衝液は便利だが生体内条件（重炭酸緩衝液）と大きく異なる」 という議論が2010年代以降に活発化しています。 Sheng et al. (2008, Mol. Pharm.)、Dressman グループの一連の研究がこの問題を提起しており、 先生の研究はまさにこの「リン酸緩衝液が引き起こす予測不能な溶解度変動」の分子論的解明に位置づけられます。(Claude 2026/04/02)
  1. Sheng, J.J.; McNamara, D.P.; Amidon, G.L.; (2009) "Toward an In Vivo Dissolution Methodology: A Comparison of Phosphate and Bicarbonate Buffers", Mol. Pharm., 6(1):29-39.
     ミシガン大学・Amidon グループの論文で、ケトプロフェンとインドメタシンのin vitro溶出試験において、 USP/FaSSIFのリン酸緩衝液中での固有溶出速度が15 mM重炭酸緩衝液の1.5〜3.0倍になることを 実験的に示したランドマーク論文です。
  2. Boni, J.E.; Brickl, R.S.; Dressman, J.; (2007) "Is bicarbonate buffer suitable as a dissolution medium?", J. Pharm. Pharmacol., 59:1375-1382.
     
  3. Cristofoletti, R.; Dressman, J.B.; (2016) "Matching phosphate and maleate buffer systems for dissolution of weak acids: Equivalence in terms of buffer capacity of bulk solution or surface pH?", Eur. J. Pharm. Biopharm., 103:104-108.
  4. Cristofoletti, R.; Dressman, J.B.; (2017) "Dissolution Methods to Increasing Discriminatory Power of In Vitro Dissolution Testing for Ibuprofen Free Acid and Its Salts", J. Pharm. Sci., 106:92-99.
     CristofolettiとDressmanは、生理学的重炭酸緩衝液（pH 6.7）での溶出速度に相当する 等価リン酸緩衝液（5.0 mM）や等価マレイン酸緩衝液（2.2 mM）の計算手法を提案した研究です。
  5. Mann, J.; Dressman, J.; Rosenblatt, K.; Ashworth, L.; Muenster, U.; Frank, K.; Hutchins, P.; Williams, J.; Klumpp, L.; Wielockx, K.; Berben, P.; Augustijns, P.; Holm, R.; Hofmann, M.; Patel, S.; Beato, S.; Ojala, K.; Tomaszewska, I.; Bruel, J.-L.; Butler, J.; (2017) "Validation of Dissolution Testing with Biorelevant Media: An OrBiTo Study", Mol. Pharm., 14:4192-4201.
  6. Litou, C.; Psachoulias, D.; Vertzoni, M.; Dressman, J.; Reppas, C.; (2020) "Measuring pH and buffer capacity in fluids aspirated from the fasted upper gastrointestinal tract of healthy adults", Pharmaceut. Res., 37:42.
     絶食状態のヒト上部消化管から吸引した液のpHと緩衝能を実測した論文で、 in vitro試験条件のin vivo妥当性を直接裏付けるデータを提供しています。 (Claude 2026/04/02)
  7. Silva, D.A.; Al-Gousous, J.; Davies, N.M.; Chacra, N.B.; Webster, G.K.; Lipka, E.; Amidon, G.; Löbenberg, R.; (2019) "Simulated, biorelevant, clinically relevant or physiologically relevant dissolution media: thehidden role of bicarbonate buffer." Eur. J. Pharm. Biopharm., 142:8-19.
     タイトルが端的にこの問題を要約している論文です。 (Claude 2026/04/02)
  【3】分子柔軟性と溶解度の構造—物性相関 Huuskonen et al. (2008) のQSPR研究が 「rotatable bondsの数が溶解度を増加させる」と示しており、 Avdeefグループ（2020年代）の柔軟性指標Φを用いた研究もあります。 本論文のCIM/FAM比較はこの文脈で「実験的・機構論的な証拠を初めて提供した」と位置づけられます。(Claude 2026/04/01)
  1. Huuskonen, J.; Livingstone, D.J.; Manallack, D.T. (2008) "Prediction of drug solubility from molecular structure using a drug-like training set" SAR and QSAR in Environmental Research, 19(3-4): 191-212.
     AQUASOLデータベースから抽出した191種の薬物様化合物を訓練セットとして、 単純な構造的・物理化学的特性を用いた定量的構造物性相関（QSPR）研究が実施され、 水溶解度の予測モデルが構築された。 著者はヘルシンキ大学・ポーツマス大学・モナシュ大学の共同チームで、 ヘルシンキ大学のHuuskonenはQSPR/QSAR分野で長年にわたり水溶解度予測に取り組んできた第一人者です。
  Hofmeister系列・イオン強度と生体高分子：主要論文リスト（2015〜2025年）(Claude 2026/04/01)
  1. Okur, H.I.; Hladílková, J.; Rembert, K.B.; Cho, Y.; Heyda, J.; Dzubiella, J.; Cremer, P.S.; Jungwirth, O.P.; (2017) Beyond the Hofmeister Series: Ion-Specific Effects on Proteins and Their Biological Functions, J. Phys. Chem. B 121(9):1997-2014
     1888年の初出以来、Hofmeister系列はタンパク質の塩析・塩溶にとどまらず、酵素活性、タンパク質の結晶化、 さらにはイオン交換や電解質の表面張力、気泡の合一など、多岐にわたる現象に適用されてきました。 この論文では、カチオン・アニオン両系列が、タンパク質表面における骨格や荷電側鎖との 特異的相互作用によって合理的に説明できることを示し、古典的な水構造論を超えた分子レベルの理解を提示しています。 Cremer（Penn State）とJungwirth（Prague）両グループの共著で、 この分野の「新しい標準的総説」として広く引用されています。
  2. Kang, B.; Tang, H.; Zhao, Z.; Song, S.; (2020) Hofmeister Series: Insights of Ion Specificity from Amphiphilic Assembly and Interface Property, ACS Omega 5(12):6229-6239.
     イオン特異効果が両親媒性系（界面活性剤のCMC、サーモレスポンシブ挙動、凝集体転移）やゲル、 気水界面に与える影響を網羅的にレビューし、分子レベルの理論的説明を体系化した包括的な総説です。
  3. He, X.; Ewing, A.G.; (2023) Hofmeister Series: From Aqueous Solution of Biomolecules to Single Cells and Nanovesicles, Chem. Eur., 24(9):e202200694.
     タンパク質・酵素・脂質へのHofmeister効果の知見が、細胞の開口分泌（エキソサイトーシス）、小胞内容物、 ナノベシクル開口の動態調節という観点に橋渡しされたミニレビューで、 単一細胞・ナノベシクルレベルへの展開が新鮮です。
  4. Paterová, J.; Rembert, K.B.; Heyda, J.; Kurra, Y.; Okur, H.I.; Liu, W.R.; Hilty, C.; Cremer, P.S.; Jungwirth, P.; (2013) Reversal of the Hofmeister Series: Specific Ion Effects on Peptides, J. Phys. Chem. B, 117(27):8150-8158.
     NMRと分子動力学シミュレーションを用いてトリグリシンをモデル系とし、 アニオンのHofmeister系列がN末端のキャップを外すことで正方向から逆方向に変化することを実証。 弱く水和されたアニオン（I⁻、SCN⁻）はペプチド結合と相互作用し、強く水和されたSO₄²⁻は反発される一方、 正電荷のN末端では逆の順序になることを示した重要論文です。
  5. Tadeo, X.; López-Méndez, B.; Castaño, D.; Trigueros, T.; Millet, O.; (2009) Protein Stabilization and the Hofmeister Effect: The Role of Hydrophobic Solvation, Biophys. J. 97(9):2595-2603.
     IgG結合ドメイン（ProtL）の変異体を使い、 コスモトロピックアニオン（SO₄²⁻、PO₄³⁻、F⁻）による安定化効果が変異で 露出した非極性溶媒接触面積に比例することを定量的に示し、 疎水性溶媒和がHofmeister効果の核心メカニズムであることを実証した論文です。
  6. Liu, H.; Yang, D.; Zhang, Q.; McClements, D.J.; Xu, X.; Sun, Q.; Dong, X.; Dai, L.; (2025) Impact of Hofmeister anion type on the structural and mechanical properties of composite whey protein hydrogels, Hood Hydrocolloids, 158:110521.
     ホエイタンパクナノファイバー複合ハイドロゲルを各種アニオン塩溶液に浸漬した実験で、 ゲル強度の増加がHofmeister系列に厳密に対応（SO₄²⁻ > Cl⁻ > Br⁻）し、 FT-IRによりイオンが水素結合・疎水性相互作用を通じてタンパク質間結合を強化することを 確認した応用寄りの研究です。
  7. Das. S.; Giri, L.; Majumdar, S.; (2023) Hofmeister series: An insight into its application on gelatin and alginate-based dual-drug biomaterial design, Eur. Polymer J., 189:111961.
     高粘度の負電荷ポリマーに対してHofmeisterアニオンが逆方向に作用すること、 またポリ電解質/両性高分子混合系では塩の添加順序によって相互作用様式が変わることを報告し、 眼科用バイオマテリアルの薬物放出制御に応用した論文です。
  8. Das, S.; Majumdar, S. (2024) "Enhancing the Properties of Self-Healing Gelatin Alginate Hydrogels by Hofmeister Mediated Electrostatic Effect", ChemPhysChem DOI: 10.1002/cphc.202300660
     バイオポリマーハイドロゲルは食品製品において望ましいテクスチャーや口当たりを付与するために広く用いられている。 ホエイタンパク質からハイドロゲルを作製できるが、特定の応用には軟らかすぎて脆い。 先行研究では、ホエイタンパク質ナノファイバーをハイドロゲルに埋め込むことで機械的特性を改善できることが示されていた。 本論文はこの複合ハイドロゲルシステムにHofmeister系列のアニオンを含む塩溶液に浸漬（ソーキング）するという後処理を加え、 アニオンの種類とpHによってゲル特性を精密に制御できることを示した実験的研究です。
  9. Otis, J.B.; Sharpe, S.; (2022) Sequence Context and Complex Hofmeister Salt Interactions Dictate Phase Separation Propensity of Resilin-like Polypeptides, Biomacromolecules, 23(12):5225-5238.
     レジリン様ポリペプチドにおいてアミノ酸配列のコンテキストとHofmeister塩との複雑な相互作用が 液-液相分離（LLPS）の傾向を左右することを報告した論文で、生体模倣材料設計への示唆が豊富です。
  10. Dominy, B.N.; Perl, D.; Schmid, F.X.; Brooks III, C.L.; (2002) The Effects of Ionic Strength on Protein Stability: The Cold Shock Protein Family, J. Mol. Biol., 319(2):541-554.
      低塩濃度ではイオン強度が表面電荷-電荷相互作用のスクリーニングに寄与し、高塩ではHofmeister効果が現れること、 また核酸はリン酸骨格の大きな負電荷のため塩によって顕著に安定化され、 高塩ではDNAのB→A→Z型転移が促進されることが詳述された古典的参照論文です。
• トリプシン、キモトリプシンで蛍光測定している例: 黒澤話題提供 (2026/03/22)
  - Spectroscopic investigations on the interactions between isopropanol and trypsin at molecular level
  - Changes inConformationof InsolubilizedTrypsinand Chymotrypsin, FollowedbyFluorescence
  - A molecular simulation and spectroscopic approach to the binding affinity between trypsin and 2-propanol and protein conformation
• カウンターイオンでミセル形状が変わる: Counterion influence on perfluorooctanoate micelle characteristics: Shape, size, and interactions 黒澤話題提供 (2026/03/22)
• 東京理科大学 工学部 工業化学科 近藤研究室 黒澤話題提供 (2026/03/18)
• 日本薬剤学会 第10回 物性FGセミナー 黒澤話題提供 (2026/02/27)
• 京都大学 化学研究所 理学研究科 機能性界面解析分野 長谷川研究室 黒澤話題提供 (2026/02/21)
• 京都大学 化学研究所 (国際共同利用・共同研究拠点) 有機フッ素鎖のねじれ構造に起因するアトロプ異性が固体状態で発現することを解明 (長谷川研) 黒澤話題提供 (2026/02/21)
• Developmental Perfluorooctanesulfonic acid (PFOS) Exposure as a Potential Risk Factor for Late-Onset Alzheimer’s Disease in CD-1 Mice and SH-SY5Y Cells (N.H. Zawia) 黒澤話題提供 (2026/02/20)
• Amyloid fibril-based membranes for PFAS removal from water (R. Mezzenga) 黒澤話題提供 (2026/02/20)
• Developmental Perfluorooctanesulfonic acid (PFOS) Exposure as a Potential Risk Factor for Late-Onset Physicochemical Nature of Perfluoroalkyl Compounds Induced by Fluorine (T. Hasegawa: Kyoto-U) 藤江先生話題提供 (2026/02/19)
• FUNAKOSHI 脂肪酸分析用蛍光試薬 ADAM (9-Anthryldiazomethane) 黒澤話題提供 (2026/02/15)
• TCI 9-Aminoacridine CAS RN: 90-45-9 | 製品コード: A2905 黒澤話題提供 (2026/02/15)
• Amicon遠心式フィルター 黒澤話題提供 (2026/02/11)
• PFOS及びPFOA含有廃棄物の処理について (千葉県) 黒澤話題提供 (2026/01/13)
• Who are our Environmental Science Journals Outstanding Papaer Award winners? (2025/12/15)
• Analytical Aspects of ANSA–BSA Association: A Thermodynamic and Conformational Approach (N. Kishore) (2025/11/21)
• Serum Protein Binding of PFAS Used in Clean Energy (2025/11/18)
• Molecular Mechanisms of Protein Binding by Perfluoroalkyl Substances (PFASs) (2025/11/18)
• Binding of a perfluorinated surfactant to β-lactoglobulin in aqueous solutions (C. Schwieger & M.-H. Ropers) (2025/11/18)
• Serum albumin mitigated perfluorooctane sulfonate-induced cytotoxicity by affecting the cellular responses (R. Tian) (2025/11/18)
• Systematic investigation of the toxic mechanism of PFOA and PFOS on bovine serum albumin by spectroscopic and molecular modeling (H. Chen, J. Yao) (2025/11/18)
• フッ素の撥水撥油性 | フッ素化学 | ダイキン工業株式会社 黒澤話題提供 (2025/11/17)
• Impact of Carbon Chain Length on Binding of Perfluoroalkyl Acids to Bovine Serum Albumin Determined by Spectroscopic Methods (R. Liu) 黒澤話題提供 (2025/11/17)
• タンパク質の二次構造解析のブレイクスルー BeStSel とアプリケーション(2025/11/12)
• 赤外分光法を用いたタンパク質の二次構造解析(2025/11/12)
• 有機フッ素化学序論 フッ素化学ー戦争と平和ー(2025/10/31)
• 蛍光異方性（蛍光偏光）とは？ 黒澤話題提供 (2025/10/13)
• 偏光とは？光にこだわる会社が教える偏光の基本原理 (2025/10/12)
• A reassessment of synchronous fluorescence in the separation of Trp and Tyr contributions in protein emission and in the determination of conformational changes (L. Stella) 黒澤話題提供 (2025/10/10)
• Solvent Effects on Fluorescence Emission (2025/10/07)
• Fluorescence spectral resolution of tryptophan residues in bovine and human serum albumins (J.R. Albani) (2025/10/07)
• 蛍光スペクトルによるリゾチームの熱変性評価 (2025/10/07)
• 水中のPFOSとPFOAの分解技術の研究開発の経緯と最近の動向 黒澤話題提供 (2025/09/19)
• Investigation of binding behaviour of procainamide hydrochloride with human serum albumin using synchronous, 3D fluorescence and circular dichroism (S. Chimatadar) 黒澤話題提供 (2025/08/01)
• 同期蛍光法による分離分析 黒澤話題提供 (2025/07/31)
• The Hofmeister Series (2025/07/10)
• ネコはどうして落下中に体を回転できるの？ 「ネコひねり」を物理エンジンで説明 (2025/07/08)
• Highly sensitive Raman measurements of protein aqueous solutions using liquid-liquid phase separation (T. Nakabayashi: Tohoku-U) 黒澤話題提供 (2025/07/07)
• アルブミン結合蛍光プローブ (2025/04/30)
• Faceted fatty acid vesicles formed from single-tailed perfluorinated surfactants (J. Zhang) 黒澤話題提供 (2025/04/22)
• Role of chain length and electrolyte on the micellization of anionic fluorinated surfactants in water (P. Alexandridis) 黒澤話題提供 (2025/04/22)
• Lidocaine as eutectic forming drug for enhanced transdermal delivery of nonsteroidal anti-inflammatory drugs (G.M. El Maghraby)
• Exosomes: vehicles for the transfer of toxic proteins associated with neurodegenerative diseases? (A.F. Hill)
• 【連載】エクソソームと生命現象「第9回 エクソソームの生体内挙動」京都大・薬 高橋有己
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• 【連載】エクソソームと生命現象「第6回 エクソソームとウイルス」東海大・医 柿崎正敏、幸谷愛
• 【連載】エクソソームと生命現象「第5回 イミダゾールジペプチドによるエクソソームを介した脳腸相関活性化」九州大・農 片倉喜範
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• 【連載】The Gateway to qNMR～定量NMRへの扉～「第3話 測定例のご紹介」
• 【連載】The Gateway to qNMR～定量NMRへの扉～「第2話 qNMRで精確な測定をするために」 黒澤話題提供 (2025/04/19)
• 【連載】The Gateway to qNMR～定量NMRへの扉～「第1話 qNMR 高精度化のはじまり」
• NMR緩和時間測定による界面活性剤溶液の研究 （花王石鹸） 黒澤話題提供 (2025/04/19)
• Chem.Phys.Phys.Chem.: 液体-液体相分離に近いタンパク質溶液における普遍的な浸透圧状態方程式と動的挙動 黒澤話題提供 (2025/04/09)
• これからはじめる液-液相分離（LLPS）研究 (DOJINDO) 黒澤話題提供 (2025/04/02)
• Nature Communications: NMR分光法を用いたタンパク質の液液相分離の時間的および空間的特性評価 黒澤話題提供 (2025/03/28)
• LLPS 性質評価蛍光色素セット (DOJINDO) 黒澤話題関連 (2025/03/28)
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• 理研プレスリリース:「環状ペプチドは立体構造を変えて細胞に入る －中分子ペプチド医薬のデザイン・発展に貢献する新発見－」 黒澤話題提供 (2025/03/27)
• 北大:「COVID-19 に対するmRNAワクチンの開発」 黒澤話題提供 (2025/03/23)
• Discovery of transdermal penetration enhancers by high-throughput screening 三ツ谷話題提供
• 静岡市、山梨の企業とPFAS汚染除去へ 亜臨界水を活用日経新聞 2024.8.21) 三ツ谷話題提供
  【関連文献】 "Study of MOF incorporated dual layer membrane with enhanced removal of ammonia and per-/poly-fluoroalkyl substances (PFAS) in landfill leachate treatment"
  【関連文献】 "Sorption of PFOA onto different laboratory materials: Filter membranes and centrifuge tubes"
• ファモチジンの分子設計： 日本で作られた新しい殺虫剤の話－NACRAについて－ 下松 明雄 農薬ガイド 2002.7.31 長谷川 (2024/11/17)
• シメチジン、ニザチジン、ラニチジンの蛍光 550 nm "Determination of ranitidine, nizatidine, and cimetidine by a sensitive fluorescent probe"
  インドメタシンの蛍光 360 nm "Interaction of indomethacin with calf thymus DNA: a multi-spectroscopic, thermodynamic and molecular modelling approach" 長谷川 (2024/11/17)
• コアモルファス "Effect of Drug–Polymer Interactions through Hypromellose Acetate Succinate Substituents on the Physical Stability on Solid Dispersions Studied by Fourier-Transform Infrared and Solid-State Nuclear Magnetic Resonance" 長谷川 (2024/11/18)
  "A theoretical and spectroscopic study of co-amorphous naproxen and indomethacin" 長谷川 (2024/11/28)
• LLPSのレビュー "Pharmaceutical Perspective on Opalescence and Liquid–Liquid Phase Separation in Protein Solutions"
  拡散層のparticle drifting effect "Possible reduction of effective thickness of intestinal unstirred water layer by particle drifting effect" 長谷川 (2024/11/18)
• 伊東の用いた方法論： 【技術解説】潜在意味解析(LSA) ～特異値分解(SVD)から文書検索まで～
• 製剤系の話題： "分子集合体" リオトロピック液晶 荒牧賢治 J.Jpn.Soc.Colour Mater. 89(3):98–101, 2016
• ORAC法など： "抗酸化成分の機能評価法" 宮澤陽夫, 仲川清隆 日本油化学会誌 47(10):1073-1148. 1998
• SOAC法： "食品の抗酸化能 一重項酸素消去活性評価法(SOAC法)の開発" 向井和男, 大内綾 オレオサイエンス 13(8):371-378. 2013