2025.3.17. 総合研究院生物環境イノベーション研究部門の支援を受けて、オランダのDolf Weijers博士とウイーンのYan Ma博士を招聘し、国際シンポジウム "ImpeTUS for TUS Plant Science"を開催しました。西浜が口頭発表を、山内助教とB4の金澤朋寛君、栗林朋生君、野間啓人君、柚木渓人君、M2の石川歩君、今井雄星君、岡田真季さん、峯春翔さん、矢貫梨香さんがポスター発表を行いました。
2025.3.14-16. 植物生理学会金沢年会にて、山内助教が口頭発表(英語)を、峯春翔さん(M2)、栗林朋生君(B4)がポスター発表を行いました。また、西浜がオランダのDolf Weijers博士と国際シンポジウムをオーガナイズし、発表を行いました。
2025.3.7. QP45&QBIC2025 International Joint Workshopにて、西浜が招待講演を行いました。
2024.11.18-21. International Marchantia Workshopにて、山内助教と西浜が口頭発表を、金澤朋寛君(B4)、石川歩君(M2)、矢貫梨香さん(M2)、Akida Jahanさん(PD)がポスター発表を行いました。
2024.6.2. 中国深圳にて開催されたInternational Conference of Molecular Biology of Streptophytesにおいて、西浜が招待講演を行いました。
2024.3.17-19. 植物生理学会神戸年会にて、今井雄星君(M1)、山内助教が口頭発表を、矢貫梨香さん(M1)が口頭発表(英語)を行いました。また、授賞式があり、MpLAXR論文の著者を代表して西浜がPCP Best Paper Awardを受賞しました。
2024.2.21. 山内助教が細胞膜H+-ATPaseの新たな制御機構を解明し、Nature Communications 誌に報告しました。リンク プレスリリース
2023.12.21. オランダWageningen UniversityのDolf Weijers博士のグループと共同で、緑藻類から陸上植物に保存されたB4型Raf様キナーゼが迅速なオーキシン応答を仲介することを見出し、Cell 誌に報告しました。リンク
2023.12.20. 農理工学際連携コース発表会で学生がポスター発表を行いました。峯春翔さん(M1)が優秀発表賞を受賞しました。おめでとう!
2023.12.3. オーストラリアManosh UniversityのJohn Bowman博士、Eduardo Flores-Sandoval博士とともに、コケ植物の幹細胞全能性と再生のホルモン調節に関する総説を執筆し、Current Opinions in Plant Biology 誌に掲載されました。リンク
2023.11.14. MpLAXRの論文が2024年度のPCP Best Paper Awardを受賞することが決まりました。2024年3月の神戸年会にて授賞式が行われます。リンク
2023.10.27. 理科大葛飾キャンパスで開催された生物環境イノベーションワークショップにて、入野耀介君(M2)と矢貫梨香さん(M1)が優良ポスター賞を受賞しました。おめでとう! リンク
2023.10.27. 理科大葛飾キャンパスで開催された生物環境イノベーションワークショップにて、西浜が招待講演を行いました。
2023.10.16. 台湾Academia Sinicaで開催されたTaiwan-Japan Plant Biology 2023 (TJPB2023)にて、山内助教と今井雄星君(M1)の演題がShort Talkに採択され口頭発表を、矢貫梨香さん(M1)がポスター発表を行いました。
2023.10.13. 京都大学などとの共同研究により、5億年前に誕生したヘテロ二量体転写因子が、陸上植物の進化を通して生殖細胞をつくるための「鍵」としてはたらいてきたことを明らかにしました。Current Biology 誌に報告しました。プレスリリース
2023.9.8. 京都大学などとの共同研究により、陸上植物の進化の初期にジベレリン生合成の初発段階の酵素遺伝子を獲得し、ジベレリン様の化合物を遠赤色光応答を介した成長調節に利用していたことを明らかにしました。Plant Cell誌に報告しました。プレスリリース
2023.9.7. 西浜が日本植物学会第87回大会(北海道)のシンポジウム「植物の陸上進出の鍵となった細胞機能改変」で招待講演を行いました。
2023.6.12. M1の峯春翔さんと矢貫梨香さんが、理研CSRSで開催された植物再生ワークショップでポスター発表を行いました。
2023.6.6. The 33rd International Conference on Arabidopsis Research (ICAR2023)において、山内助教の演題がShort Talkに採択され、幕張メッセで口頭発表を行いました。
2023.4.1. 山内翔太助教が着任しました。
2023.3.13. B4の今井雄星君、半田和華さんが植物生理学会仙台年会にてポスター発表を行いました。
2023.1.23. 京都大学との共同研究により、気孔を喪失したコケ植物苔類が保持する気孔形成制御遺伝子の役割をゼニゴケを用いて解析し、コケ植物特有の組織「蒴柄(さくへい)」の形成制御に転用されたことを明らかにしました。Nature Plants誌に報告しました。プレスリリース
2022.12.19. 京都大学との共同研究により、オーキシン受容体MpTIR1を介したオーキシン信号伝達が、ゼニゴケの3次元的な形態形成に必須である一方で、細胞の生存には必須ではないという意外な事実を明らかにしました。The Plant Cell誌に報告しました。リンク プレスリリース
2022.12.21. 農理工学際連携コース発表会で学生がポスター発表を行いました。矢貫梨香さん(B4)が優秀ポスター賞を受賞しました。おめでとう!
2022.11.28. 西浜が国際ウェビナーシリーズ“From Cellular Dynamics to Morphology III”で招待講演を行いました。リンク
2022.8.22. 西浜が武田科学振興財団生命科学研究助成に採択されました。
2022.4.1. 西浜が新学術領域研究「植物の周期と変調」の公募研究に採択されました。リンク
2022.3.15. MpLAXRの論文がPlant & Cell Physiology誌の63巻3月号の表紙に採択されました!リンク
2022.1.13. 大阪大学、東京大学などとの共同研究により、動植物共通の透明化法iTOMEIを開発しました。ゼニゴケにも有効です!Communications Biology誌に報告しました。リンク
2022.1.7. 京都大学との共同研究により、ゼニゴケ葉状体の切断片において、植物ホルモンオーキシン濃度の低下により細胞リプログラミングが誘導されることを見出し、その鍵となる転写因子MpLAXRを同定しました。Plant & Cell Physiology誌に報告しました。リンク
2021.12.15. 農理工学際連携コース発表会でB4の入野耀介君、佐々木健君がポスター発表しました。
2021.11.8. 京都大学、本学理工学部朽津研との共同研究により、ゼニゴケの性決定遺伝子Feminzerを同定し、Current Biology誌に報告しました。プレスリリース
植物は光合成により作り出した産物を自身の成長に用いています。そのため、常に光合成の状態を把握して細胞活性や代謝を光合成活性に調和させています。また光情報そのものも植物の成長や発生の調節において重要な意味をもっています。私たちは植物が光合成や光の情報をどのように処理し、成長や代謝を調節しているのかについて調べることで、陸上植物の根源的な成長調節の共通原理を理解することを目指しています。
陸上植物の成長や発生の基盤となる頂端成長を担う幹細胞は、発生過程において規定されます。それは植物が高い再生能力をもつことにも反映されています。私たちは幹細胞を規定する遺伝子制御ネットワークを、転写やエピジェネティクス調節の解析を通して解明したいと思っています。
2024
Iwano, M., Suetsugu, N., Nishihama, R., Ishida, S., Horie, T., Costa, A., Katsuno, T., Kimura, M., Iida, K., Iida, H., Nagai, T., Kohchi, T. (2024) MID1-COMPLEMENTING ACTIVITY regulates cell proliferation and development via Ca2+ signaling in Marchantia polymorpha. Plant Physiol. 197: kiae613.
Yamamoto-Negi, Y., Higa, T., Komatsu, A., Sasaki, K., Ishizaki, K., Nishihama, R., Gotoh, E., Kohchi, T., Suetsugu, N. (2024) A kinesin-like protein, KAC, is required for light-induced and actin-based chloroplast movement in Marchantia polymorpha. Plant Cell Physiol. 65: 1787-1800.
Furuya, T., Saegusa, N., Yamaoka, S., Tomoita, Y., Minamino, N., Niwa, M., Inoue, K., Yamamoto, C., Motomura, K., Shimadzu, S., Nishihama, R., Ishizaki, K., Ueda, T., Fukaki, H., Kohchi, T., Fukuda, H., Kasahara, M., Araki, T., Kondo, Y. (2024) A non-canonical BZR/BES transcription factor regulates the development of haploid reproductive organs in Marchantia polymorpha. Nature Plants 10: 785-797.
Hong, S.F., Wei, W.L., Pan, Z.J., Yu, J.Z., Cheng, S., Hung, Y.L., Tjita, V., Wang, H.C., Komatsu, A., Nishihama, R., Kohchi, T., Chen, H.M., Chen, W.C., Lo, J.C., Chiu, Y.H., Yang, H.C., Lu, M.Y., Liu, L.D., Lin, S.S. Molecular insights into MpAGO1 and its regulatory miRNA, miR11707, in the high-temperature acclimation of Marchantia polymorpha. Plant Cell Physiol. 65: 1414-1433.
Hung, Y.L., Hong, S.F., Wei, W.L., Cheng, S., Yu, J.Z., Tjita, V., Yong, Q.Y., Nishihama, R., Kohchi, T., Bowman, J., Chien, Y.C., Chiu, Y.H., Yang, H.C., Jade Lu, M.Y., Pan, Z.J., Wang, C.N., Lin, S.S. (2024) Dual regulation of cytochrome P450 gene expression by two distinct small RNAs, a novel tasiRNA and miRNA, in Marchantia polymorpha. Plant Cell Physiol. 65: 1115-1134.
Fuji, S.*, Yamauchi, S.*, Sugiyama, N., Kohchi, T., Nishihama, R., Shimazaki, K. Takemiya, A. (2024) Light-induced stomatal opening requires phosphorylation of the C-terminal autoinhibitory domain of plasma membrane H+-ATPase. Nat. Commun. 15: 1195. *Contributed equally.
Lu, Y.T., Loue-Manifel, J., Bollier, N., Gadient, P., De Winter, F., Carella, P., Hoguin, A., Grey-Switzman, S., Marnas, H., Simon, F., Copin, A., Fischer, S., de Leau, E., Schornack, S., Nishihama, R., Kohchi, T., Depège Fargeix, N., Ingram, G., Nowack, M.K., Goodrich, J. (2024) Convergent evolution of water-conducting cells in Marchantia recruited the ZHOUPI gene promoting cell wall reinforcement and programmed cell death. Curr. Biol. 34: 793-807.
Bao, H., Sun, R., Iwano, M., Yoshitake, Y., Aki, S.S., Umeda, M., Nishihama, R., Yamaoka, S., Kohchi, T. (2024) Conserved CKI1-mediated signaling is required for female germline specification in Marchantia polymorpha. Curr. Biol. 34: 1324-1332.
Kajiwara, T., Miyazaki, M., Yamaoka, S., Yoshitake, Y., Yasui, Y., Nishihama, R., Kohchi, T. (2024) Transcription of the antisense long non-coding RNA, SUPPRESSOR OF FEMINIZATION, represses expression of the female-promoting gene FEMALE GAMETOPHYTE MYB in the liverwort Marchantia polymorpha. Plant Cell Physiol. 65: 338-349.
Kuhn, A., Roosjen, M., Mutte, S., Dubey, S.M., Carrillo Carrasco, V.P., Boeren, S., Monzer, A., Koehorst, J., Kohchi, T., Nishihama, R., Fendrych, M., Sprakel, J., Friml, J., Weijers, D. (2024) RAF-like protein kinases mediate a deeply conserved, rapid auxin response. Cell 187: 130-148. Link
Flores-Sandoval, E., Nishihama, R., Bowman, J.L. (2024) Hormonal and genetic control of pluripotency in bryophyte model systems. Curr. Opin. Plant Biol. 77: 102486.
2023
Tomizawa, Y., Minamino, N., Shimokawa, E., Kawamura, S., Komatsu, A., Hiwatashi, T., Nishihama, R., Ueda, T., Kohchi, T., Kondo, Y. (2023) Harnessing Deep Learning to Analyze Cryptic Morphological Variability of Marchantia polymorpha. Plant Cell Physiol. 64: 1343-1355.
Saito, M., Momiki, R., Ebine, K., Yoshitake, Y., Nishihama, R., Miyakawa, T., Nakano, T., Mitsuda, N., Araki, T., Kohchi, T., Yamaoka, S. (2023) A bHLH heterodimer regulates germ cell differentiation in land plant gametophytes. Curr. Biol. 33: 4980-4987.
Yotsui, I., Matsui, H., Miyauchi, S., Iwakawa, H., Melkonian, K., Schlüter, T., Michavila, S., Kanazawa, T., Nomura, Y., Stolze, S.C., Jeon, H.W., Yan, Y., Harzen, A., Sugano, S.S., Shirakawa, M., Nishihama, R., Ichihashi, Y., Ibanez, S.G., Shirasu, K., Ueda, T., Kohchi, T., Nakagami, H. (2023) LysM-mediated signaling in Marchantia polymorpha highlights the conservation of pattern-triggered immunity in land plants. Curr. Biol. 33: 3732-3746.
Sun R, Okabe M, Miyazaki S, Ishida T, Mashiguchi K, Inoue K, Yoshitake Y, Yamaoka S, Nishihama R, Kawaide H, Nakajima M, Yamaguchi S, Kohchi T. (2023) Biosynthesis of gibberellin-related compounds modulates far-red light responses in the liverwort Marchantia polymorpha. Plant Cell 35: 4111-4132.
Suzuki, H., Kato, H., Iwano, M., Nishihama, R.*, Kohchi, T.* (2023) Auxin signaling is essential for organogenesis but not for cell survival in the liverwort Marchantia polymorpha. Plant Cell 35: 1058-1075. *Corresponding authors.
Moriya, K.C., Shirakawa, M., Loue-Manifel, J. Matsuda, Y., Lu, Y.T., Tamura, K, Oka, Y., Matsushita, T., Hara-Nishimura, I., Ingram, G., Nishihama, R., Goodrich, J., Kohchi, T., Shimada, T. (2023) Stomatal regulators are co-opted for seta development in the astomatous liverwort Marchantia polymorpha. Nat. Plants. 9: 302-314.
2022
Aki, S.S., Morimoto, T., Ohnishi, T., Oda, A., Kato, H., Ishizaki, K., Nishihama, R., Kohchi, T., Umeda, M. (2022) R2R3-MYB transcription factor GEMMA CUP-ASSOCIATED MYB1 mediates the cytokinin signal to achieve proper organ development in Marchantia polymorpha. Sci. Rep. 12: 21123.
Kawamura, S., Romani, F., Yagura, M., Mochizuki, T., Sakamoto, M., Yamaoka, S., Nishihama, R., Nakamura, Y., Yamato, K.T., Bowman, J.L., Kohchi, T., and Tanizawa, Y. (2022) MarpolBase Expression: A web-based, comprehensive platform for visualization and analysis of transcriptomes in the liverwort Marchantia polymorpha. Plant Cell Physiol. pcac129.
Bowman, J.L., Arteaga-Vazquez, M. Berger, F., Briginshaw, L.N., Carella, P., Aguilar-Cruz, A., Davies, K.M., Dierschke, T., Dolan, L., Dorantes-Acosta, A.E., Fisher, T.J., Flores-Sandoval, E., Futagami, K., Ishizaki, K., Jibran, R., Kanazawa, T., Kato, H., Kohchi, T., Levins, J., Lin, S.S., Nakagami, H., Nishihama, R., Romani, F., Schornack, S., Tanizawa, Y., Tsuzuki, M., Ueda, T., Watanabe, Y., Yamato, K.T., and Zachgo, S. (2022) The Renaissance and Enlightenment of Marchantia as a model system. Plant Cell 34: 3512-3542.
Kanazawa, T., Nishihama, R., and Ueda, T. (2022) Normal oil body formation in Marchantia polymorpha requires functional coat protein complex I proteins. Front. Plant Sci. 13: 979066.
Ishida, S., Suzuki, H., Iwaki, A., Kawamura, S., Yamaoka, S., Kojima, M., Takebayashi, Y., Yamaguchi, K., Shigenobu, S., Sakakibara, H., Kohchi, T. and Nishihama, R. (2022) Diminished auxin signaling triggers cellular reprogramming by inducing a regeneration factor in the liverwort Marchantia polymorpha. Plant Cell Physiol. 63: 384-400.
Koeduka, T., Takaishi, M., Suzuki, M., Nishihama, R., Kohchi, T., Uefune, M., and Matsui, K. (2022) CRISPR/Cas9-mediated disruption of ALLENE OXIDE SYNTHASE results in defective 12-oxo-phytodienoic acid accumulation and reduced defense against spider mite (Tetranychus urticae) in liverwort (Marchantia polymorpha). Plant Biotechnol. 39: 191-194.
Furuya, T., Nishihama, R., Ishizaki, K., Kohchi, T., Fukuda, H., and Kondo, Y. (2022) A glycogen synthase kinase 3-like kinase MpGSK regulates cell differentiation in Marchantia polymorpha. Plant Biotechnol. 39: 65-72.
Sakai, Y., Higaki, T., Ishizaki, K., Nishihama, R., Kohchi, T., and Hasezawa, S. (2022) Migration of prospindle before the first asymmetric division in germinating spore of Marchantia polymorpha. Plant Biotechnol. 39: 5-12.
Sakamoto, Y., Ishimoto, A., Sakai, Y., Sato, M., Nishihama, R., Abe, K., Sano, Y., Furuichi, T., Tsuji, H., Kohchi, T., and Matsunaga, S. (2022) Improved clearing method contributes to deep imaging of plant organs. Commun. Biol. 5: 12
2021
Iwasaki, M., Kajiwara, T., Yasui, Y., Yoshitake, Y., Miyazaki, M., Kawamura, S., Suetsugu, N., Nishihama, R., Yamaoka, S., Wanke, D., Hashimoto, K., Kuchitsu, K., Montgomery, S.A., Singh, S., Tanizawa, Y., Yagura, M., Mochizuki, T., Sakamoto, M., Nakamura, Y., Liu, C., Berger, F., Yamato, K.T., Bowman, J.L., Kohchi, T. (2021) Identification of the sex-determining factor in the liverwort Marchantia polymorpha reveals unique evolution of sex chromosomes in a haploid system. Curr Biol. 31: 5522-5532.
Furuya, T., Shinkawa, H., Kajikawa, M., Nishihama, R., Kohchi, T., Fukuzawa, H., Tsukaya, H. (2021) A plant-specific DYRK kinase DYRKP coordinates cell morphology in Marchantia polymorpha. J Plant Res. 134: 1265-1277.
Iwakawa, H., Melkonian, K., Schlüter, T., Jeon, H.W., Nishihama, R., Motose, H., Nakagami, H. (2021) Agrobacterium-mediated transient transformation of Marchantia liverworts. Plant Cell Physiol. 62: 1718-1727.
Kohchi, T., Yamato, K.T., Ishizaki, K., Yamaoka, S., Nishihama, R. (2021) Development and molecular genetics of Marchantia polymorpha. Annu. Rev. Plant Biol. 72: 677-702.
Suzuki, H., Kohchi, T., Nishihama, R. (2021) Auxin biology in Bryophyta: a simple platform with versatile functions. Cold Spring Harb. Perspect. Biol. 13: a040055.
Umeda, M., Ikeuchi, M., Ishikawa, M., Ito, T., Nishihama, R., Kyozuka, J., Torii, K.U., Satake, A., Goshima, G., Sakakibara, H. (2021) Plant stem cell research is uncovering the secrets of longevity and persistent growth. Plant J. 106: 326-335.
Hernandez-Garcia, J., Sun, R., Serrano-Mislata, A., Inoue, K., Vargas-Chavez, C., Esteve-Bruna, D., Arbona, V., Yamaoka, S., Nishihama, R., Kohchi, T., Blazquez, M. A. (2021) Coordination between growth and stress responses by DELLA in the liverwort Marchantia polymorpha. Curr. Biol. 31: 3678-3686.
Okamura, E., Ohtaka, K., Nishihama, R., Uchida, K., Kuwahara, A., Mochida, K., Hirai, M.Y. (2021) Diversified amino acid-mediated allosteric regulation of phosphoglycerate dehydrogenase for serine biosynthesis in land plants. Biochem. J. 478: 2217-2232.
Takizawa, R., Hatada, M., Moriwaki, Y., Abe, S., Yamashita, Y., Arimitsu, R., Yamato, K.T., Nishihama, R., Kohchi, T., Koeduka, T., Chen, F., Matsui, K. (2021) Fungal-type terpene synthases in Marchantia polymorpha are involved in sesquiterpene biosynthesis in oil body cells. Plant Cell Physiol. 62: 528-537.
2020
Koide, E., Suetsugu, N., Iwano, M., Gotoh, E., Nomura, Y., Stolze, S.C., Nakagami, H., Kohchi, T., Nishihama, R. (2020) Regulation of photosynthetic carbohydrate metabolism by a Raf-like kinase in the liverwort Marchantia polymorpha. Plant Cell Physiol. 61: 631-643.
Suzuki, H., Harrison, C.J., Shimamura, M., Kohchi, T., Nishihama, R. (2020) Positional cues regulate dorsal organ formation in the liverwort Marchantia polymorpha. J. Plant Res. 133: 311-321.
Nishihama, R. and Naramoto, S. (2020) Apical stem cells sustaining prosperous evolution of land plants. J. Plant Res. 133: 279-282.
Kato, H., Mutte, S.K., Suzuki, H., Crespo, I., Das, S., Radoeva, T., Fontana, M., Yoshitake, Y., Hainiwa, E., van den Berg, W., Lindhoud, S., Ishizaki, K., Hohlbein, J., Borst, J.W., Boer, D.R., Nishihama, R., Kohchi, T., Weijers, D. (2020) Design principles of a minimal auxin response system. Nat. Plants 6: 473-482.
Hirakawa, Y., Fujimoto, T., Ishida, S., Uchida, N., Sawa, S., Kiyosue, T., Ishizaki, K., Nishihama, R., Kohchi, T., Bowman, J.L. (2020) Induction of multichotomous branching by CLAVATA peptide in Marchantia polymorpha. Curr. Biol. 30: 3833-3840.
Kanazawa, M., Ikeda, Y., Nishihama, R., Yamaoka, S., Lee, N.H., Yamato, K.T., Kohchi, T., Hirayama, T. (2020) Regulation of the poly(A) status of mitochondrial mRNA by poly(A)-specific ribonuclease is conserved among land plants. Plant Cell Physiol. 61: 470-480.
Matsui, H., Iwakawa, H., Hyon, G.-S., Yotsui, I., Katou, S., Monte, I., Nishihama, R., Franzen, R., Solano, R., Nakagami, H. (2020) Isolation of natural fungal pathogens from Marchantia polymorpha reveals antagonism between salicylic acid and jasmonate during liverwort-fungus interactions. Plant Cell Physiol. 61: 265-275.
2019
Yasui, Y., Tsukamoto, S., Sugaya, T., Nishihama, R., Wang, Q., Kato, H., Yamato, K.T., Fukaki, H., Mimura, T., Kubo, H., Theres, K., Kohchi, T., Ishizaki, K. (2019) GEMMA CUP-ASSOCIATED MYB1, an orthologue of axillary meristem regulator, is essential for vegetative reproduction in a liverwort Marchantia polymorpha. Curr. Biol. 29: 3987-3995.
Naramoto, S., Jones, V.A.S., Trozzi, N., Sato, M., Toyooka, K., Shimamura, M., Ishida, S., Nishitani, K., Ishizaki, K., Nishihama, R., Kohchi, T., Dolan, L., Kyozuka, J. (2019) A conserved regulatory mechanism mediates the convergent evolution of plant shoot lateral organs. PLoS Biol. 17: e3000560.
Aki, S.S., Nishihama, R., Kohchi, T., Umeda, M. Cytokinin signaling coordinates development of diverse organs in Marchantia polymorpha. (2019) Plant Signal. Behav. 14 1668232.
Aki, S.S., Mikami, T., Naramoto, S., Nishihama, R., Ishizaki, K., Kojima, M., Takebayashi, Y., Sakakibara, H., Kyozuka, J., Kohchi, T., Umeda, M. (2019) Cytokinin signaling is essential for organ formation in Marchantia polymorpha. Plant Cell Physiol. 60: 1842-1854.
Hirakawa, Y., Uchida, N., Yamaguchi, Y.L., Tabata, R., Ishida, S., Ishizaki, K., Nishihama, R., Kohchi, T., Sawa, S., Bowman, J.L. (2019) Control of proliferation in the haploid meristem by CLE peptide signaling in Marchantia polymorpha. PLoS Genet. 15: e1007997.
Kondou, Y., Miyagi, Y., Morito, T., Fujihira, K., Miyauchi, W., Moriyama, A., Terasawa, T., Ishida, S., Iwabuchi, K., Kubo, H., Nishihama, R., Ishizaki, K., Kohchi, T. (2019) Physiological function of photoreceptor UVR8 in UV-B tolerance in the liverwort Marchantia polymorpha. Planta 249: 1349-1364.
Inoue, K., Nishihama, R., Araki, T., Kohchi, T. (2019) Reproductive induction is a far-red high irradiance response that is mediated by phytochrome and PHYTOCHROME INTERACTING FACTOR in Marchantia polymorpha. Plant Cell Physiol. 60: 1136-1145.
Hisanaga, T., Okahashi, K., Yamaoka, S., Kajiwara, T., Nishihama, R., Shimamura, M., Yamato, K.T., Bowman, J.L., Kohchi, T., Nakajima, K. (2019) A cis-acting bidirectional transcription switch controls sexual dimorphism in the liverwort. EMBO J. e100240.
Monte, I., Franco-Zorrilla, J.M., García-Casado, G., Zamarreño, A.M., García-Mina, J.M., Nishihama, R., Kohchi, T., Solano, R. (2019) A Single JAZ repressor controls the jasmonate pathway in Marchantia polymorpha. Mol. Plant 12: 185-198.
Inoue, K., Nishihama, R., Kohchi, T. (2019) Phytochrome and light signaling in Marchantia. Andreas Hiltbrunner (ed.), Phototropism: Methods and Protocols, Methods in Molecular Biology, vol. 2026. pp. 215-223.
Komatsu, A., Nishihama, R., Kohchi, T. (2019) Observation of phototropic responses in the liverwort Marchantia polymorpha. Kotaro Yamamoto (ed.), Phototropism: Methods and Protocols, Methods in Molecular Biology, vol. 1924. pp. 53-61.
2018
Sugano, S.S., Nishihama, R., Shirakawa, M, Takagi, J., Matsuda, Y., Ishida, S., Shimada, T., Hara-Nishimura, I., Osakabe, K., Kohchi, T. (2018) Efficient CRISPR/Cas9-based genome editing and its application to conditional genetic analysis in Marchantia polymorpha. PLOS ONE 13: e0205117.
Sugano, S.S. Nishihama, R. (2018) CRISPR/Cas9-based genome editing of transcription factor genes in Marchantia polymorpha. Nobutoshi Yamaguchi (ed.), Plant Transcription Factors: Methods and Protocols, Methods in Molecular Biology, vol. 1830. pp. 109-126.
Kato, H., Nishihama, R., Weijers, D., Kohchi, T. (2018). Evolution of nuclear auxin signaling: lessons from genetic studies with basal land plants. J. Exp. Bot. 69: 291-301.
Yamaoka, S., Nishihama, R., Yoshitake, Y., Ishida, S., Inoue, K., Saito, M., Okahashi, K., Bao, H., Nishida, H., Yamaguchi, K., Shigenobu, S., Ishizaki, K., Yamato, K. T., Kohchi, T. (2018) Generative cell specification requires transcription factors evolutionarily conserved in land plants. Curr. Biol. 28: 479-486.
Eklund, D.M., Kanei, M., Flores-Sandoval, E., Ishizaki, K., Nishihama, R., Kohchi, T., Lagercrantz, U., Bhalerao, R.P., Sakata, Y., Bowman, J.L. (2018) An evolutionarily conserved abscisic acid signaling pathway regulates dormancy in the liverwort Marchantia polymorpha. Curr. Biol. 28: 3691-3699.
Higo, A., Kawashima, T., Borg, M., Zhao, M., López-Vidriero, I., Sakayama, H., Montgomery, S.A., Sekimoto, H., Hackenberg, D., Shimamura, M., Nishiyama, T., Sakakibara, K., Tomita, Y., Togawa, T., Kunimoto, K., Osakabe, A., Suzuki, Y., Yamato, K.T., Ishizaki, K., Nishihama, R., Kohchi, T., Franco-Zorrilla, J.M., Twell, D., Berger, F., Araki, T. (2018) Transcription factor DUO1 generated by neo-functionalization is associated with evolution of sperm differentiation in plants. Nat. Commun. 9: 5283.
Mano, S., Nishihama, R., Ishida, S., Hikino, K., Kondo, M., Nishimura, M., Yamato, K.T., Kohchi, T., Nakagawa, T. (2018) Novel gateway binary vectors for rapid tripartite DNA assembly and promoter analysis with various reporters and tags in the liverwort Marchantia polymorpha. PLOS ONE 13: e0204964.
Ikeda, Y., Nishihama, R., Yamaoka, S., Arteaga-Vazquez, M.A., Aguilar-Cruz, A., Grimanelli, D., Pogorelcnik, R., Martienssen, R.A., Yamato, K.T., Kohchi, T., Hirayama, T., Mathieu, O. (2018) Loss of CG methylation in Marchantia polymorpha causes disorganization of cell division and reveals unique DNA methylation regulatory mechanisms of non-CG methylation. Plant Cell Physiol. 59: 2421-2431.
Monte, I., Ishida, S., Zamarreno, A.M., Hamberg, M., Franco-Zorrilla, J.M., Garcia-Casado, G., Gouhier-Darimont, C., Reymond, P., Takahashi, K., Garcia-Mina, J. M., Nishihama, R., Kohchi, T., Solano, R. (2018) Ligand-receptor co-evolution shaped the jasmonate pathway in land plants. Nat. Chem. Biol. 14: 480-488.
Furuya, T., Hattori, K., Kimori, Y., Ishida, S., Nishihama, R., Kohchi, T., Tsukaya, H. (2018) ANGUSTIFOLIA contributes to the regulation of three-dimensional morphogenesis in the liverwort Marchantia polymorpha. Development 145: dev161398.
Otani, K., Ishizaki, K., Nishihama, R., Takatani, S., Kohchi, T., Takahashi, T., Motose, H. (2018) An evolutionarily conserved NIMA-related kinase directs rhizoid tip growth in the basal land plant Marchantia polymorpha. Development 145: dev154617.
Akashi, H., Okamura, E., Nishihama, R., Kohchi, T., Hirai, M.Y. (2018) Identification and biochemical characterization of the serine biosynthetic enzyme 3-phosphoglycerate dehydrogenase in Marchantia polymorpha. Front. Plant Sci. 9: 956.
Wang, M., Nishihama, R., Onishi, M., Pringle, J.R. (2018) Role of the Hof1-Cyk3 interaction in cleavage-furrow ingression and primary-septum formation during yeast cytokinesis. Mol. Biol. Cell 29: 597-609.
西浜竜一,河内孝之 (2018) 新しいモデル生物:苔類ゼニゴケ 領域融合レビュー 7: e008.
植物の声に耳を傾け、その生き方を
ぜひ一緒に解き明かしましょう。
植物の柔軟な生き方を解明したいです。
勇往邁進。
ゼニゴケと共に成長していきます。
ゼニゴケと仲良くなりたいです。
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研究頑張ります
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一菌で変える、緑の明日
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