リンク(便利なツール集)

結晶学関係
Protein Data Bank
PDBeFold (Structure Similarity)


分子生物学関係
(1) データベース (主なもののみ)
Genome Information Broker BacteriaやArchaea、Eukaryotesの一部
Microbial Genome Database BacteriaやArchaea、Eukaryotesの一部
Saccharomyces Genome Database   酵母Saccharomyces
H-Invitational Database ヒト

(2) 各種ツール
分子生物学研究用ツール集   リンク集
Compute pI/Mw アミノ酸配列から等電点、分子量を計算
ProtParam アミノ酸配列からモル吸光係数、アミノ酸組成、等電点、分子量などを計算
(280nmの吸光度によるタンパク質定量の目安になる)
PSIPRED アミノ酸配列から二次構造を予測
SOSUI アミノ酸配列から膜貫通部位を予測
TMHMM アミノ酸配列から膜貫通部位を予測
ClustalW アミノ酸配列からアライメント
ESPript アミノ酸配列、二次構造、アライメントの図を作成
BoxShade アミノ酸配列、アライメントの図を作成
NEBcutter 制限酵素切断サイトを表示
BioMath Calculators プライマーのTm値を予測
DNAWorks Codon Usage、制限酵素部位を除く等遺伝子配列を最適化するプライマーセットのデザイン


その他
PubMed
高エネ研・共同利用支援システム
制限酵素の切れやすさの指標
Codon Usage Database

静岡県立大学 生命物理化学教室
PF構造生物学ビームライン