研究成果 計画研究班・研究成果

*Corresponding author, #These authors contributed equally to this work.
実線下線は研究代表者、点線下線は研究分担者

計画研究班

木下班

  • -2019年-
    原著論文
    #Aoki, S., #Toh, S., Nakamichi, N., Hayashi, Y., Wang, Y., Suzuki, T., Tsuji, H., and *Kinoshita, T. (2019) Regulation of stomatal opening and histone modification by photoperiod in Arabidopsis thaliana. Sci. Rep., 9, 10054 (9 pages). [プレスリリース]
    https://www.nature.com/articles/s41598-019-46440-0
    #Uehara, T. N., #Mizutani, Y., Kuwata, K., Hirota, T., Sato, A., Mizoi, J., Takao, S., Matsuo, H., Suzuki, T., Ito, S., Saito, A. N., Nishiwaki-Ohkawa, T., Yamaguchi-Shinozaki, K., Yoshimura, T,. Kay, S. A., Itami, K., Kinoshita, T., *Yamaguchi, J., and *Nakamichi, N. (2019) Casein kinase 1 family regulates PRR5 and TOC1 in the Arabidopsis circadian clock. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 116, 11528-11536. [プレスリリース][新聞ネット記事]
    https://doi.org/10.1073/pnas.1903357116
    *#Minami, A., #Takahashi, K., Inoue, S., Tada, Y., and Kinoshita, T. (2019) Brassinosteroid induces phosphorylation of the plasma membrane H+-ATPase during hypocotyl elongation in Arabidopsis thaliana. Plant Cell Physiol., 60, 935-944. [ハイライト]
    https://academic.oup.com/pcp/article/60/5/935/5289540
    Toda, Y., Kudo, T., Kinoshita, T., and *Nakamichi, N. (2019) Evolutionary insight into the clock-associated PRR5 transcriptional network of flowering plants. Sci. Rep., 9, 2983 (14 pages).
    https://www.nature.com/articles/s41598-019-39720-2
    Oochi, A., Hajny, J., Fukui, K., Nakao, Y., Gallei, M., Quareshy, M., Takahashi, K., Kinoshita, T., Harborough, S. R., Kepinski, S., Kasahara, H., Napier, R., Friml, J., and *Hayashi, K. (2019) Pinstatic acid promotes auxin transport by inhibiting PIN internalization. Plant Physiol., 180, 1152-1165.
    http://www.plantphysiol.org/content/180/2/1152
    Tanaka-Takada, N., Kobayashi, A., Takahashi, H., Kamiya, T., Kinoshita, T., and *Maeshima, M. (2019) Plasma membrane-associated Ca2+-binding protein PCaP1 is involved in root hydrotropism of Arabidopsis thaliana. Plant Cell Physiol., 60, 1331-1341.
    https://doi.org/10.1093/pcp/pcz042
    Asaoka, M., Inoue, S., Gunji, S., Kinoshita, T., Maeshima, M., Tsukaya, H., and *Ferjani, A. (2019) Excess pyrophosphate within guard cells delays stomatal closure. Plant Cell Physiol., 60, 875-887.
    https://doi.org/10.1093/pcp/pcz002
    Ando, E. and *Kinoshita, T. (2019) Fluence rate dependence of red light-induced phosphorylation of plasma membrane H+-ATPase in stomatal guard cells. Plant Signal. Behav., 14, 1561107.
    https://doi.org/10.1080/15592324.2018.1561107
    #Motomura, K., #Arae, T., Uramoto, H. A., Suzuki, Y., Takeuchi, H., Suzuki, T., Ichihashi, Y., Shibata, A., Shirasu, K., Takeda, A., Higashiyama, T., and *Chiba, Y. (2019) AtNOT1 is a novel regulator of gene expression during pollen development. Plant Cell Physiol., in press.
    https://doi.org/10.1093/pcp/pcz235
    *Rymen, B., Kawamura, A., Lambolez, A., Inagaki, S., Takebayashi, A., Iwase, A., Sakamoto, Y., Sako, K., Favero, D. S., Ikeuchi, M., Suzuki, T., Seki, M., Kakutani, T., Roudier, F., and *Sugimoto, K. (2019) Histone acetylation orchestrates wound-induced transcriptional activation and cellular reprogramming in Arabidopsis. Commun. Biol., 2, 404 (15 pages).
    https://www.nature.com/articles/s42003-019-0646-5
    Sato, H., Suzuki, T., Takahashi, F., Shinozaki, K, and *Yamaguchi-Shinozaki, K. (2019) NF-YB2 and NF-YB3 have functionally diverged and differentially induce drought and heat stress-specific genes. Plant Physiol., 180, 1677-1690.
    https://doi.org/10.1104/pp.19.00391
    Hirakawa, T., Kuwata, K., Gallego, M. E., White, C. I., Nomoto, M., Tada, Y., and *Matsunaga, S. (2019) LSD1-LIKE1-mediated H3K4me2 demethylation is required for homologous recombination repair. Plant Physiol., 181, 499-509.
    http://www.plantphysiol.org/content/181/2/499
    プレスリリース
    植物は自分のおかれた環境を細胞レベルで記憶する ?植物細胞における記憶の仕組みの解明に道筋?(2019年7月22日)
    http://www.nagoya-u.ac.jp/about-nu/public-relations/researchinfo/upload_images/20190723_itbm1.pdf
    低分子化合物で植物時計の仕組みを発見!(2019年5月17日)
    http://www.nagoya-u.ac.jp/about-nu/public-relations/researchinfo/upload_images/20190517_itbm001.pdf
    新聞ネット記事・テレビ報道
    中日新聞(2019年5月14日)植物の生物時計を変化させる化合物 名大などグループ発見
  • -2018年-
    原著論文
    Ando, E. and *Kinoshita, T. (2018) Red light-induced phosphorylation of plasma membrane H+-ATPase in stomatal guard cells. Plant Physiol., 178, 838-849.
    http://www.plantphysiol.org/content/178/2/838
    *Kinoshita, T., *McCourt, P., Asami, T., and *Torii, K. U. (2018) Plant chemical biology. Plant Cell Physiol., 59, 1483-1486.
    https://academic.oup.com/pcp/article/59/8/1483/5056048
    Yamada, R., Murai, K., Uchida, N., Takahashi, K., Iwasaki, R., Tada, Y., Kinoshita, T., Itami, K., *Torii, K. U., and *Hagihara, S. (2018) A super strong engineered auxin-TIR1 pair. Plant Cell Physiol., 59, 1538-1544.
    https://doi.org/10.1093/pcp/pcy127
    *#Nishimura, N., #Tsuchiya, W., Moresco, J. J., Hayashi, Y., Satoh, K., Kaiwa, N., Irisa, T., Kinoshita, T., Schroeder, J. I., Yates, III J. R., Hirayama, T., and Yamazaki, T. (2018) Control of seed dormancy and germination by DOG1-AHG1 PP2C phosphatase complex via binding to heme. Nature Commun., 9, 2132 (14 pages).
    https://www.nature.com/articles/s41467-018-04437-9
    *Uraguchi, D., Kuwata, K., Hijikata, Y., Yamaguchi, R., Imaizumi, H., Am, S., Rakers, C., Mori, N., Akiyama, K., Irle, S., McCourt, P., Kinoshita, T., *Ooi, T., and *Tsuchiya, Y. (2018) A femtomolar-range suicide germination stimulant for the parasitic plant Striga hermonthica. Science, 362, 1301-1305. [プレスリリース] [新聞ネット記事]
    http://science.sciencemag.org/content/362/6420/1301
    Yoshimura, M., Sato, A., Kuwata, K., Inukai, Y., Kinoshita, T., Itami, K., *Tsuchiya, Y., and *Hagihara, S. (2018) Discovery of shoot branching regulator targeting strigolactone receptor DWARF14. ACS Cent. Sci., 4, 230-234.
    https://pubs.acs.org/doi/full/10.1021/acscentsci.7b00554
    Toh, S., Inoue, S., Toda, Y., Yuki, T., Suzuki, K., Hamamoto, S., Fukatsu, K., Aoki, S., Uchida, M., Asai, E., Uozumi, N., Sato, A., and *Kinoshita, T. (2018) Identification and characterization of compounds that affect stomatal movements. Plant Cell Physiol., 59, 1568-1580. [プレスリリース] [新聞ネット記事]
    https://academic.oup.com/pcp/article/59/8/1568/4950858
    #Uchida, N., #Takahashi, K., Iwasaki, R., Yamada, R., Yoshimura, M., Endo, T. A., Kimura, S., Zhang, H., Nomoto, M., Tada, Y., Kinoshita, T., Itami, K., *Hagihara, S., and *Torii, K. U. (2018) Chemical hijacking of auxin signaling with an engineered auxin-TIR1 pair. Nature Chem. Biol., 14, 299-305.
    https://www.nature.com/articles/nchembio.2555
    *Sato, H., Takasaki, H., Takahashi, F., Suzuki, T., Iuchi, S., Mitsuda, N., Ohme-Takagi, M., Ikeda, M., Seo, M., Yamaguchi-Shinozaki, K., and *Shinozaki, K. (2018) Arabidopsis thaliana NGATHA1 transcription factor induces ABA biosynthesis by activating NCED3 gene during dehydration stress. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 115, E11178-E11187.
    http://www.pnas.org/content/115/47/E11178.full
    #Kadokura, S., *#Sugimoto, K., Tarr, P., Suzuki, T., and *Matsunaga, S. (2018) Characterization of somatic embryogenesis initiated from the Arabidopsis shoot apex. Dev. Biol., 442, 13-27.
    https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0012160617308023
    Sato, K., Kadota, Y., Gan, P., Bino, T., Uehara, T., Yamaguchi, K., Ichihashi, I., Maki, N., Iwahori, H., Suzuki, T., *Shigenobu, S., and *Shirasu, K. (2018) High-quality genome sequence of the root-knot nematode Meloidogyne arenaria genotype A2-O. Genome Announc., 6, e00519-18 (2 pages).
    https://mra.asm.org/content/6/26/e00519-18
    #Hasegawa, J., #Sakamoto, T., Fujimoto, T., Yamashita, T., Suzuki, T., and *Matsunaga, S. (2018) Auxin decreases chromatin accessibility through the TIR1/AFBs auxin signaling pathway in proliferative cells. Sci. Rep., 8, 7773 (12 pages).
    https://www.nature.com/articles/s41598-018-25963-y
    Uemura, A., Yamaguchi, N., Xu, Y., Wee, W. Y., Ichihashi, Y., Suzuki, T., Shibata, A., Shirasu, K., and *Ito, T. (2018) Regulation of floral meristem activity through the interaction of AGAMOUS, SUPERMAN, and CLAVATA3 in Arabidopsis. Plant Reprod., 31, 89-105.
    https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs00497-017-0315-0
    Ohta, M., Sato, A., Renhu, N., Yamamoto, T., Oka, N., Zhu, J. K., Tada, Y., Suzaki, T., and *Miura, K. (2018) MYC-type transcription factors, MYC67 and MYC70, interact with ICE1 and negatively regulate cold tolerance in Arabidopsis. Sci. Rep., 8, 11622 (12 pages).
    https://www.nature.com/articles/s41598-018-29722-x
    プレスリリース
    アフリカで猛威を振るう寄生植物ストライガの撲滅に向けて ~スフィンクスの名をもつ発芽刺激分子で穀物被害の軽減へ~ (2018年12月17日)
    http://www.itbm.nagoya-u.ac.jp/ja/research/2018/12/Striga-SPL7.php
    気孔開口を抑制する新しい化合物を発見 ~植物のしおれを抑える新たな技術開発に期待~ (2018年4月9日)
    http://www.itbm.nagoya-u.ac.jp/ja/research/2018/04/SCL-Kinoshita.php
    新聞ネット記事・テレビ報道
    日経産業新聞 (2018年12月18日) 朝刊6面 寄生植物被害 撲滅へ アフリカで名大、新薬剤を開発
    毎日新聞 (2018年12月16日) 朝刊27面 「魔女の雑草」駆除に光 アフリカで年間1兆円被害
    毎日新聞web (2018年12月16日) 発芽誘発分子 名大研究グループが発見 「魔女の雑草」駆除に光 アフリカで年間1兆円被害
    https://mainichi.jp/articles/20181216/ddq/041/040/013000c
    中日新聞web (2018年12月16日) 中日春秋
    朝日新聞web (2018年12月14日)  「魔女の雑草」撲滅に期待 琵琶湖に小さじ1杯で...
    https://www.asahi.com/articles/ASLDC5777LDCULBJ00N.html
    時事ドットコムニュース (2018年12月14日) 「魔女の雑草」駆除に道=アフリカで猛威の寄生植物-名大など
    毎日新聞web (2018年12月14日)  "魔女の雑草" 駆除に有効な分子を名大Gが発見 食糧問題解決に道
    https://mainichi.jp/articles/20181213/k00/00m/040/230000c
    読売新聞web (2018年12月14日)  穀物枯らす「魔女の雑草」、駆除薬剤を開発
    日本経済新聞web (2018年12月14日) アフリカの寄生植物を効率駆除 名大が化合物を開発
    https://www.nikkei.com/article/DGXMZO38895670T11C18A2TJM000/
    産経ニュース (2018年12月14日) 「魔女の雑草」退治へ アフリカ食糧問題解決に新手法
    https://www.sankei.com/life/news/181214/lif1812140021-n1.html
    日本の研究.com (2018年12月14日) アフリカで猛威を振るう寄生植物ストライガの撲滅に向けて ~スフィンクスの名をもつ発芽刺激分子で穀物被害の軽減へ~
    https://research-er.jp/articles/view/76049
    中日新聞 (2018年12月14日) 朝刊30面 「魔女の雑草」解く新薬 名大グループ安価で製造 アフリカ食糧問題に光
    朝日新聞 (2018年12月14日) 朝刊6面 「魔女の雑草」退治 分子を開発 名大チーム
    ニュースイッチ (2018年4月30日) 植物のしおれを防止する化合物 名古屋大学が発見
    https://newswitch.jp/p/12780
    日刊工業新聞 (2018年4月27日) 植物、しおれ抑制して長持ち 名大が耐乾燥性化合物を発見
    https://www.nikkan.co.jp/articles/view/00471423
    日経産業新聞 (2018年4月12日) 5面「気孔」開口を制御 植物の耐乾防ぐ 名古屋大が化合物特定
    中日新聞(2018年4月10日)朝刊3面 生花の葉にシュッ みずみずしさ維持 名大チーム 気孔の開き 抑える物質発見
    朝日新聞デジタル(2018年4月10日)葉の乾燥抑える化合物発見 生け花の鮮度保つ効果期待
    https://www.asahi.com/articles/ASL465HCJL46OIPE01R.html
    朝日新聞(2018年4月9日)夕刊8面 葉っぱにシュッ しおれ抑える 名大チーム、新たな化合物発見
    EurekAlert! JP(2018年4月9日)気孔開口を抑制する新しい化合物を発見
    https://www.eurekalert.org/pub_releases_ml/2018-04/iotb-i040818.php
    日本の研究.com(2018年4月9日)気孔開口を抑制する新しい化合物を発見 ~植物のしおれを抑える新たな技術開発に期待~
    https://research-er.jp/articles/view/69620
    AlphaGalileo JP(2018年4月9日)気孔開口を抑制する新しい化合物を発見 ~植物のしおれを抑える新たな技術開発に期待~
    https://www.alphagalileo.org/en-gb/Item-Display/ItemId/161937
  • -2017年-
    原著論文
    *Bowman, J. L., *Kohchi, T., *Yamato, K. T., Jenkins, J., Shu, S., Ishizaki, K., Yamaoka, S., Nishihama, R., Nakamura, Y., Berger, F., Adam, C, Aki, S. S., Althoff, F., Araki, T., Arteaga-Vazquez, M. A., Balasubrmanian, S., Barry, K., Bauer, D., Boehm, C. R., Briginshaw, L., Caballero-Perez, J., Catarino, B., Chen, F., Chiyoda, S., Chovatia, M., Davies, K. M., Delmans, M., Demura, T., Dierschke, T., Dolan, L., Dorantes-Acosta, A. E., Eklund, D. M., Florent, S. N., Flores-Sandoval, E., Fujiyama, A, Fukuzawa, H., Galik, B., Grimanelli, D., Grimwood, J., Grossniklaus, U., Hamada, T., Haseloff, J., Hetherington, A. J., Higo, A., Hirakawa, Y., Hundley, H. N, Ikeda, Y., Inoue, K., Inoue, S., Ishida, S., Jia, O., Kakita, M., Kanazawa, T., Kawai, Y., Kawashima, T., Kennedy, M., Kinose, K., Kinoshita, T., Kohara, Y., Koide, E., Komatsu, K., Kopischke, S., Kubo, M., Kyozuka, J., Lagercrantz, U., Lin, S. S., Lindquist, E., Lipzen, A. M., Lu, C. W., De Luna, E., Martienssen, R. A., Minamino, N., Mizutani, M., Mizutani, M., Mochizuki, N., Monte, I., Mosher, R., Nagasaki, H., Nakagami, H., Naramoto, S., Nishitani, K., Ohtani, M., Okamoto, T., Okumura, M., Phillips, J., Pollak, B., Reinders, A., Rövekamp, M., Sano, R., Sawa, S., Schmid, M. W., Shirakawa, M., Solano, R., Spunde, A., Suetsugu, N., Sugano, S., Sugiyama, A., Sun, R., Suzuki, Y., Takenaka, M., Takezawa, D., Tomogane, H., Tsuzuki, M., Ueda, T., Umeda, M., Ward, J. M., Watanabe, Y., Yazaki, K., Yokoyama, R., Yoshitake, Y., Yotsui, I., Zachgo, S., and Schmutz, J. (2017) Insights into land plant evolution garnered from the Marchantia polymorpha genome. Cell,, 171, 287-304.
    http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867417311248
    Peterson, J., Inoue, S., Kelly, S. M., Sullivan, S., Kinoshita, T., and *Christie, J. M. (2017) Functional characterization of a constitutively active kinase variant of Arabidopsis phototropin 1. J. Biol. Chem., 292, 13843-13852.
    http://www.jbc.org/content/292/33/13843
    *Inoue, S., Iwashita, N., Takahashi, Y., Gotoh, E., Okuma, E., Hayashi, M., Tabata, R., Takemiya, A., Murata, Y., Doi, M., Kinoshita, T., and *Shimazaki, K. (2017) Brassinosteroid involvement in Arabidopsis thaliana stomatal opening. Plant Cell Physiol., 58, 1048-1058.
    https://academic.oup.com/pcp/article-lookup/doi/10.1093/pcp/pcx049
    Wang, Y. and *Kinoshita, T. (2017) Measurement of stomatal conductance in rice. Bio-protocol, 7, e2226 (6 pages).
    http://www.bio-protocol.org/e2226
    *Nakamura, A., Tochio, N., Fujioka, S., Ito, S., Kigawa, T,. Shimada, Y., Matsuoka, M., Yoshida, S., Kinoshita, T., Asami, T., Seto, H., and Nakano, T. (2017) Molecular actions of two synthetic brassinosteroids, iso-carbaBL and 6-deoxoBL, which cause altered physiological activities between Arabidopsis and rice. PLoS ONE, 12, e0174015 (16 pages).
    http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0174015
    Hayashi, M., Inoue, S., Ueno, Y., and Kinoshita, T. (2017) A Raf-like protein kinase BHP mediates blue light-dependent stomatal opening. Sci. Rep., 7, 45586 (12 pages).
    https://www.nature.com/articles/srep45586
    Joo, S., Nishimura, Y., Cronmiller, E., Hong, R. H., Kariyawasam, T., Wang, M. H., Shao, N. C., Akkad, S. E., Suzuki, T., Higashiyama, T., Jin, E., and Lee, J. H. (2017) Gene regulatory networks for the haploid-to-diploid transition of Chlamydomonas reinhardtii. Plant Physiol., 175, 314-332.
    http://www.plantphysiol.org/content/175/1/314
    Gamuyao, R., Nagai, K., Ayano, M., Mori, Y., Minami, A., Kojima, M., Suzuki, T., Sakakibara, H., Higashiyama, T., Ashikari, M., and *Reuscher, S. (2017) Hormone distribution and transcriptome profiles in bamboo shoots provide insights on bamboo stem emergence and growth. Plant Cell Physiol., 58, 702-716.
    https://academic.oup.com/pcp/article/58/4/702/2993903
    #Ushijima, T., #Hanada, K., Gotoh, E., Yamori, W., Kodama, Y., Tanaka, H., Kusano, M., Fukushima, A., Tokizawa, M., Yamamoto, Y. Y., Tada, Y., Suzuki, Y., and *Matsushita, T. (2017) Light controls protein localization through phytochrome-mediated alternative promoter selection. Cell, 171, 1316-1325.
    http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867417312400
    総説論文
    Inoue, S. and Kinoshita, T. (2017) Blue light regulation of stomatal opening and the plasma membrane H+-ATPase. Plant Physiol., 174, 531-538.
    http://www.plantphysiol.org/content/174/2/531
    日本語著書・解説
    木下俊則、高橋宏二(2017)水と植物細胞、テイツ/ザイガー植物生理学・発生学 原著第6版(講談社サイエンティフィック)第3章、85-99.
    木下俊則、高橋宏二(2017)植物における水収支、テイツ/ザイガー植物生理学・発生学 原著第6版(講談社サイエンティフィック)第4章、101-119.
    新聞ネット記事・テレビ報道
    日経新聞(2017年7月6日)農作物の開花早める化合物 名大が開発、寒冷地でも収穫安定
    Nikkei Asian Review(2017年7月6日)Nagoya University scientists develop compound that hastens flowering
    https://asia.nikkei.com/Tech-Science/Science/Nagoya-University-scientists-develop-compound-that-hastens-flowering
    日刊工業新聞(2017年4月13日)植物の気孔開口に不可欠 たんぱく質を発見 名大
    日経産業新聞(2017年4月11日)気孔を閉じる仕組み判明 名大 乾燥に強くする薬品に道
    化学工業日報(2017年4月10日)名大―龍谷大 植物の気孔開く分子発見 乾燥耐性作物開発に道
    日本の研究.com(2017年4月5日)気孔開口の鍵因子を発見 ~農作物の乾燥耐性や成長を制御する新たな技術開発に期待~
    https://research-er.jp/articles/view/57142
  • -2016年-
    原著論文
    Okumura, M. and *Kinoshita, T. (2016) Measurement of ATP hydrolytic activity of plasma membrane H+-ATPase from Arabidopsis thaliana leaves. Bio-protocol, 6, e2044 (7 pages).
    http://www.bio-protocol.org/e2044
    Inoue, S., Takahashi, K., Okumura, H. N., and Kinoshita, T. (2016) Auxin influx carrier AUX1 confers acid resistance for Arabidopsis root elongation through the regulation of plasma membrane H+-ATPase. Plant Cell Physiol., 57, 2194-2201.
    http://pcp.oxfordjournals.org/content/early/2016/08/08/pcp.pcw136
    #Bessho-Uehara, K., #Wang, D. R., Furuta, T., Minami, A., Nagai, K., Gamuyao,R., Asano, K., Angeles-Shim, R. B., Shimizu, Y., Ayano, M., Komeda, N., Doi, K., Miura, K., Toda, Y., Kinoshita, T., Okuda, S., Higashiyama, T., Nomoto, M., Tada, Y., Shinohara, H., Matsubayashi, Y., Greenberg, A., Wu, J., Yasui, H., Yoshimura, A., *Mori, H., *McCouch, S. R., and *Ashikari, M. (2016) Loss of function at RAE2, a previously unidentified EPFL, is required for awnlessness in cultivated Asian rice, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 113, 8969-8974.
    http://www.pnas.org/content/113/32/8969
    Aleman, F., Yazaki, J., Lee, M., Takahashi, Y., Kim, A. Y., Kinoshita, T., Ecker, J. R., and Schroeder, J. I. (2016) An ABA-increased interaction of the PYL6 ABA receptor with MYC2 transcription factor: A putative link of ABA and JA signaling. Sci. Rep., 6, 28941 (10 pages).
    http://www.nature.com/articles/srep28941
    Yamauchi, S., Takemiya, A., Sakamoto, T., Kurata, T., Kinoshita, T. , and *Shimazaki, K. (2016) The plasma membrane H+-ATPase AHA1 plays a major role in stomatal opening in response to blue light. Plant Physiol., 171, 2731-43.
    http://www.plantphysiol.org/content/171/4/2731
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    Nakamichi, N., Takao, S., Kudo, T., Kiba,T., Wang, Y., Kinoshita, T., and Sakakibara, H. (2016) Improvement of Arabidopsis biomass and cold, drought, and salinity stress tolerance by modified circadian clock-associated PSEUDO-RESPONSE REGULATORs. Plant Cell Physiol., 57, 1085-1097.
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    Yamada, K., Yamaguchi, K., Shirakawa, T., Nakagami, H., Mine, A., Ishikawa, K., Fujiwara, M., Narusaka, M., Narusaka, Y., Ichimura, K., Kobayashi, Y., Matsui, H., Nomura, Y., Nomoto, M., Tada, Y., Fukamizo, T., Tsuda, K., Shirasu, K., Shibuya, N., and *Kawasaki, T. (2016) The Arabidopsis CERK1-associated kinase PBL27 connects chitin perception to MAPK activation. EMBO J., 35, 2468-2483.
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    総説論文
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    日本語著書・解説
    木下俊則(2016)細胞膜、植物学の百科事典(丸善)、392-393.
    木下俊則(2016)生体膜輸送系、植物学の百科事典(丸善)、404-407.
    木下俊則、富山将和(2016)環境刺激による気孔開度制御機構の解明に向けて、BSJ-Review、7、97-109.
    木下俊則(2016)気孔の光開口運動における光シグナル伝達、光と生命の事典(朝倉書店)、140-141.
    萩原伸也、吉村柾彦、土屋雄一朗、木下俊則、伊丹健一郎(2016)魔女の雑草の呪いを解く分子、化学、71、35-39.
    新聞ネット記事・テレビ報道
    International Service for the Acquisition of Agri-biotech Applications(2016年6月23日)Japanese scientists develop super plants thru simple GM
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    Global Plant Council (2016年4月6日)Plant's morning calls to prepare for the night
    Science Daily (2016年3月23日)Plant's morning calls to prepare for the night
    https://www.sciencedaily.com/releases/2016/03/160323082508.htm
    ScienMag(2016年3月23日)Plant's morning calls to prepare for the night
    https://scienmag.com/plants-morning-calls-to-prepare-for-the-night/
  • -2015年-
    原著論文
    *#Tsuchiya, Y., #Yoshimura, M., Sato, Y., Kuwata, K., Toh, S., Holbrook-Smith, D., Zhang, H., McCourt, P., Itami, K., Kinoshita, T., and *Hagihara, S. (2015) Probing strigolactone receptors in Striga hermonthica with fluorescence. Science, 349, 864-868. [プレスリリース] [新聞ネット記事]
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    Kimura, Y., Aoki, S., Ando, E., Kitatsuji, A., Watanabe, A., Ohnishi, M., Takahashi, K., Inoue, S., Nakamichi, N., Tamada, Y., and *Kinoshita, T. (2015) A flowering integrator, SOC1, affects stomatal opening in Arabidopsis thaliana. Plant Cell Physiol., 56, 640-649.
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    http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/tpj.12811/full
    Saleh, A., Withers, J., Mohan, R., Marques, J., Gu, Y., Yan, S., Zavaliev, R., Nomoto, M., Tada, Y., and *Dong, X. (2015) Posttranslational modifications of the master transcriptional regulator NPR1 enable dynamic but tight control of plant immune responses. Cell Host & Microbe, 18, 169-182.
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    Matsuo, M., Johnson, J. M., Hieno, A., Tokizawa, M., Nomoto, M., Tada, Y., Godfrey, R., Obokata, J., Sherameti, I., Yamamoto, Y. Y., Bohmer, F. D., and *Oelmuller, R. (2015) High REDOX RESPONSIVE TRANSCRIPTION FACTOR1 levels result in accumulation of reactive oxygen species in Arabidopsis thaliana shoots and roots. Mol. Plant, 8, 1253-1273.
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    *Tsukagoshi, H., Suzuki, T., Nishikawa, K., Agarie, S., Ishiguro, S., and Higashiyama, T. (2015) RNA-seq analysis of the response of the halophyte, Mesembryanthemum crystallinum (ice plant) to high salinity. PLoS ONE., 10, e0118339 (16 pages).
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    *Okamoto, S., Suzuki, T., Kawaguchi, M., Higashiyama, T., and Matsubayashi, Y. (2015) A comprehensive strategy for identifying long-distance mobile peptides in xylem sap. Plant J., 84, 611-620.
    http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/tpj.13015/full
    Schaap, P., Barrantes, I., Minx, P., Sasaki, N., Anderson, R. W., Bénard, M., Biggar, K. K., Buchler, N. E., Bundschuh, R., Chen, X., Fronick, C., Fulton, L., Golderer, G., Jahn, N., Knoop, V., Landweber, L. F., Maric, C., Miller, D., Noegel, A. A., Peace, R., Pierron, G., Sasaki, T., Schallenberg-Rüdinger, M., Schleicher, M., Singh, R., Spaller, T., Storey, K. B., Suzuki, T., Tomlinson, C., Tyson, J. J., Warren, W. C., Werner, E. R., Werner-Felmayer, G., Wilson, R. K., Winckler, T., Gott, J. M., Glöckner, G., and *Marwan, W. (2015) The physarum polycephalum genome reveals extensive use of prokaryotic two-component and metazoan-type tyrosine kinase signaling. Genome Biol Evol., 8, 109-125.
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    *Notaguchi, M., Higashiyama, T., and Suzuki, T. (2015) Identification of mRNAs that move over long distances using an RNA-Seq analysis of Arabidopsis/Nicotiana benthamiana heterografts. Plant Cell Physiol., 56, 311-321.
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    *Song, X. J., Kuroha, T., Ayano, M., Furuta, T., Nagai, K., Komeda, N., Segami, S., Miura, K., Ogawa, D., Kamura, T., Suzuki, T., Higashiyama, T., Yamasaki, M., Mori, H., Inukai, Y., Wu, J., Kitano, H., Sakakibara, H., *Jacobsen, S. E., and *Ashikari, M. (2015) Rare allele of a previously unidentified histone H4 acetyltransferase enhances grain weight, yield, and plant biomass in rice. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 112, 76-81.
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    Kobayashi, K., Suzuki, T., Iwata, E., Nakamichi, N., Suzuki, T., Chen, P., Ohtani, M., Ishida, T., Hosoya, H., Muller, S., Leviczky, T., Pettko-Szandtner, A., Darula, Z., Iwamoto, A., Nomoto, M., Tada, Y., Higashiyama, T., Demura, T., Doonan, J. H., Hauser, M. T., Sugimoto, K., Umeda, M., Magyar, Z., Bogre, L., and *Ito, M. (2015) Transcriptional repression by MYB3R proteins regulates plant organ growth. EMBO J., 34, 1992-2007.
    https://www.embopress.org/doi/full/10.15252/embj.201490899
    総説論文
    Takahashi, Y. and Kinoshita, T. (2015) Stomatal function has an element of hysteresis.
    New Phytol., 205, 455-457.
    https://doi.org/10.1111/nph.13149
    *Satake, A., Sakurai, G., and *Kinoshita, T. (2015) Modeling strategies for plant survival, growth and reproduction. Plant Cell Physiol., 56, 583-585.
    https://academic.oup.com/pcp/article/56/4/583/2756513
    *Nakamichi, N. (2015) Adaptation to the local environment by modifications of the photoperiod response in crops. Plant Cell Physiol., 56, 594-604.
    https://academic.oup.com/pcp/article-lookup/doi/10.1093/pcp/pcu181
    日本語著書・解説
    Wang Yin、木下俊則(2015)気孔調節による植物のCO2コンダクタンス制御、光合成研究、25 (3)(通巻74号)、194-201.
    木下俊則(2015)未来をつなぐ風、実験医学、33、2670-2671.
    木下俊則(2015)生き残りのための環境突破力、理フィロソフィア(名古屋大学理学部・大学院理学研究科広報誌)、29、8-11.
    木下俊則(2015)環境変動に対する気孔開閉制御、化学と生物、53、608-613.
    プレスリリース
    アフリカの食糧問題に希望の光 ~ 寄生植物の発芽を制御するタンパク質を発見 ~ (2015年8月21日)
    http://www.itbm.nagoya-u.ac.jp/ja/research/2015/08/Yoshimulactone-Striga.php
    新聞ネット記事・テレビ報道
    中日新聞(日刊)(2015年8月21日)アフリカ有害植物 駆除に光
    読売新聞(2015年5月18日)「花咲かホルモン」(木下と辻の両方が取り上げられています。)
    JST サイエンスニュース・サイエンスチャンネル特集 2015年6月19日「花咲かホルモン」フロリゲン 植物ゲノム研究最前線(辻)
    ハーバービジネスオンライン 2015年12月19日 TPPで苦境に立たされた農業を開花ホルモン研究が救う?(辻)

松林班

  • -2020年-
    原著論文
    Ota, R., Ohkubo, Y., Yamashita, Y., Ogawa-Ohnishi, M., and *Matsubayashi, Y. (2020) Shoot-to-root mobile CEPD-like 2 integrates shoot nitrogen status to systemically regulate nitrate uptake in Arabidopsis. Nature Commun., 11, 641 (9 pages).
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  • -2019年-
    原著論文
    Shinohara, H., Yasue, N., Onuki, T., Kondo, Y., Yoshida, M., and *Matsubayashi, Y. (2019) Screening and identification of a non-peptide antagonist for the peptide hormone receptor in Arabidopsis. Commun. Biol., 2, 61 (8 pages).
    https://www.nature.com/articles/s42003-019-0307-8
    Toyokura, K., Goh, T., Shinohara, H., Shinoda, A., Kondo, Y., Okamoto, Y., Uehara, T., Fujimoto, K., Okushima, Y., Ikeyama, Y., Nakajima, K., Mimura, T., Tasaka, M., Matsubayashi, Y., and *Fukaki, H. (2019) Lateral inhibition by a peptide hormone-receptor cascade during Arabidopsis lateral root founder cell formation. Dev. Cell, 48, 64-75.
    https://doi.org/10.1016/j.devcel.2018.11.031
    *Yoro, E., Nishida, H., Ogawa-Ohnishi, M., Yoshida, C., Suzaki, T., Matsubayashi, Y., and *Kawaguchi, M. (2019) PLENTY, a hydroxyproline O-arabinosyltransferase, negatively regulates root nodule symbiosis in Lotus japonicus. J. Exp. Bot., 70, 507-517.
    https://doi.org/10.1093/jxb/ery364
    #Uehara, T. N., #Mizutani, Y., Kuwata, K., Hirota, T., Sato, A., Mizoi, J., Takao, S., Matsuo, H., Suzuki, T., Ito, S., Saito, A. N., Nishiwaki-Ohkawa, T., Yamaguchi-Shinozaki, K., Yoshimura, T., Kay, S. A., Itami, K., Kinoshita, T., *Yamaguchi, J., and *Nakamichi, N (2019) Casein kinase 1 family regulates PRR5 and TOC1 in the Arabidopsis circadian clock. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 116, 11528-11536.
    https://doi.org/10.1073/pnas.1903357116
    Hirakawa, T., Kuwata, K., Gallego, M. E., White, C. I., Nomoto, M., Tada, Y., and *Matsunaga, S. (2019) LSD1-LIKE1-mediated H3K4me2 demethylation is required for homologous recombination repair. Plant Physiol., 181, 499-509.
    http://www.plantphysiol.org/content/181/2/499
  • -2018年-
    原著論文
    #Takenaka, Y., #Kato, K., Ogawa-Ohnishi, M., Tsuruhama, K., Kajiura, H., Yagyu, K., Takeda, A., Takeda, Y., Kunieda, T., Hara-Nishimura, I., Kuroha, T., Nishitani, K., Matsubayashi, Y., and *Ishimizu, T. (2018) Pectin RG-I rhamnosyltransferases represent a novel plant-specific glycosyltransferase family. Nature Plants, 4, 669-676.
    https://www.nature.com/articles/s41477-018-0217-7
    *Uraguchi, D., Kuwata, K., Hijikata, Y., Yamaguchi, R., Imaizumi, H., Am, S., Rakers, C., Mori, N., Akiyama, K., Irle, S., McCourt, P., Kinoshita, T., *Ooi, T., and *Tsuchiya, Y. (2018) A femtomolar-range suicide germination stimulant for the parasitic plant Striga hermonthica. Science, 362, 1301-1305.
    https://science.sciencemag.org/content/362/6420/1301
    Yoshimura, M., Sato, A., Kuwata, K., Inukai, Y., Kinoshita, T., Itami, K., *Tsuchiya, Y., and *Hagihara, S. (2018) Discovery of shoot branching regulator targeting strigolactone receptor DWARF14. ACS Cent. Sci., 4, 230-234.
    https://pubs.acs.org/doi/full/10.1021/acscentsci.7b00554
    総説論文
    *Matsubayashi, Y. (2018) Exploring peptide hormones in plants: identification of four peptide hormone-receptor pairs and two post-translational modification enzymes. P. Jpn Acad. B-Phys., 94, 59-74.
    https://www.jstage.jst.go.jp/article/pjab/94/2/94_PJA9402B-01/_html/
  • -2017年-
    原著論文
    #Ohkubo, Y., #Tanaka, M., Tabata, R., Ohnishi, M. O., and *Matsubayashi, Y. (2017) Shoot-to-root mobile polypeptides involved in systemic regulation of nitrogen acquisition, Nature Plants, 3, 17029.
    http://www.nature.com/articles/nplants201729
    Hirakawa, Y., Shinohara, H., Welke, K., Irle, S., Matsubayashi, Y., *Torii, K. U., and *Uchida, N. (2017) Cryptic bioactivity capacitated by synthetic hybrid plant peptides. Nature Commun., 8, 14318 (7 pages).
    http://www.nature.com/articles/ncomms14318
    #Nakayama, T., #Shinohara, H., Tanaka, M., Baba, K., Ohnishi, M. O., and *Matsubayashi, Y. (2017) A peptide hormone required for Casparian strip diffusion-barrier formation in Arabidopsis roots, Science, 355, 284-286.
    http://science.sciencemag.org/content/355/6322/284.full
    Kanadome, T., *Shibata,H., Kuwata, K, Takahara, T., and Maki, M. (2017) The calcium-binding protein ALG-2 promotes endoplasmic reticulum exit site localization and polymerization of Trk-fused gene (TFG) protein. FEBS J., 284, 56-76.
    http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/febs.13949/full
    Yamada, T., Tahara, E., Kanke, M., Kuwata, K., and *Nishiyama, T. (2017) Drosophila Dalmatian combines sororin and shugoshin roles in establishment and protection of cohesion. EMBO J., 36, 1513-1527.
    http://emboj.embopress.org/content/36/11/1513
  • -2016年-
    原著論文
    #Bessho-Uehara, K., #Wang, D. R., Furuta, T., Minami, A., Nagai, K., Gamuyao,R., Asano, K., Angeles-Shim, R. B., Shimizu, Y., Ayano, M., Komeda, N., Doi, K., Miura, K., Toda, Y., Kinoshita, T., Okuda, S., Higashiyama, T., Nomoto, M., Tada, Y., Shinohara, H., Matsubayashi, Y., Greenberg, A., Wu, J., Yasui, H., Yoshimura, A., *Mori, H., *McCouch, S. R., and *Ashikari, M. (2016) Loss of function at RAE2, a previously unidentified EPFL, is required for awnlessness in cultivated Asian rice, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 113, 8969-8974.
    https://www.pnas.org/content/113/32/8969
    Shinohara, H., Mori, A., Yasue, N., Sumida, K., and *Matsubayashi, Y. (2016) Identification of three LRR-RKs involved in perception of root meristem growth factor in Arabidopsis. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 113, 3897-3902.
    http://www.pnas.org/content/113/14/3897.long
    #*Nambo, M., Kurihara, D., Yamada, T., Nishiwaki, O. T., Kadofusa, N., Kimata, Y., Kuwata, K., Umeda, M., and #*Ueda, M. (2016) Combination of synthetic chemistry and live-cell imaging identified a rapid cell division inhibitor in tobacco and Arabidopsis thaliana. Plant Cell Physiol., 57, 2255-2268.
    http://pcp.oxfordjournals.org/content/57/11/2255
    Okumura, M., Inoue, S., Kuwata, K., and Kinoshita, T. (2016) Photosynthesis activates plasma membrane H+-ATPase via sugar accumulation. Plant Physiol., 171, 580-589.
    http://www.plantphysiol.org/content/171/1/580
    Fujimoto, S., Sugano, S. S., Kuwata, K., Osakabe, K., and *Matsunaga, S. (2016) Visualization of specific repetitive genomic sequences with fluorescent TALEs in Arabidopsis thaliana. J. Exp. Bot., 67, 6101-6110.
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    日本語著書・解説
    松林嘉克 (2016) 植物ホルモン ペプチドホルモン、植物学の百科事典、370-373.
  • -2015年-
    原著論文
    *Okamoto, S., Suzuki, T., Kawaguchi, M., Higashiyama, T., and Matsubayashi, Y. (2015) A comprehensive strategy for identifying long-distance mobile peptides in xylem sap. Plant J., 84, 611-620.
    http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/tpj.13015/full
    Xu, C., Liberatore, K. L., MacAlister, C. A., Huang, Z., Chu, Y. H., Jiang, K., Brooks, C., Ogawa-Ohnishi, M., Xiong, G., Pauly, M., Van Eck, J., Matsubayashi, Y., van der Knaap, E., and *Lippman, Z. B. (2015) A cascade of arabinosyltransferases controls shoot meristem size in tomato. Nature Genet. 47, 784-792.
    https://www.nature.com/articles/ng.3309?lang=en
    Wu, T., Kamiya, T., Yumoto, H., Sotta, N., Katsushi, Y., Shigenobu, S., Matsubayashi, Y., and *Fujiwara, T. (2015) An Arabidopsis thaliana copper-sensitive mutant suggests a role of phytosulfokine in ethylene production. J. Exp. Bot. 66, 3657-3667.
    https://academic.oup.com/jxb/article/66/13/3657/513140
    *Shinohara, H., and Matsubayashi, Y. (2015) Reevaluation of the CLV3-receptor interaction in the shoot apical meristem: dissection of the CLV3 signaling pathway from a direct ligand-binding point of view. Plant J., 82, 328-336.
    http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/tpj.12817/full
    Ogawa-Ohnishi, M., and *Matsubayashi, Y. (2015) Identification of three potent hydroxyproline O-galactosyltransferases in Arabidopsis. Plant J., 81, 736-746.
    http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/tpj.12764/full
    *#Tsuchiya Y., #Yoshimura, M., Sato, Y., Kuwata, K., Toh, S., Holbrook-Smith, D., Zhang, H., McCourt, P., Itami, K., Kinoshita, T., and *Hagihara, S. (2015) Probing strigolactone receptors in Striga hermonthica with fluorescence. Science, 349, 864-868.
    https://science.sciencemag.org/content/349/6250/864.full
    日本語著書・解説
    小川・大西真理、松林嘉克 (2015) 古くて新しい植物のO ― 結合型糖タンパク質の世界、化学と生物、53、729-730.
    田畑 亮、松林嘉克 (2015) 効率的な窒素栄養吸収を可能にする根-葉-根間長距離シグナル伝達、バイオインダストリー、32、53-58.

松永班

  • -2020年-
    原著論文
    Adamusova, K., Khosravi, S., Fujimoto, S., Houben, A., Matsunaga, S., Fajkus, J., and *Fojtova, M. (2020) Two combinatorial patterns of telomere histone marks in plants with canonical and non-canonical telomere repeats. Plant J., in press.
    https://doi.org/10.1111/tpj.14653
    Luo, L., Ando, S., Sakamoto, Y., Suzuki, T., Takahashi, H., Ishibashi, N., Kojima, S., Kurihara, D., Higashiyama, T., Yamamoto, K. T., *Matsunaga, S., *Machida, C., *Sasabe, M., and *Machida, Y. (2020) The formation of perinucleolar bodies is important for normal leaf development and requires the zinc-finger DNA-binding motif in Arabidopsis ASYMMETRIC LEAVES2. Plant J., in press.
    https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/tpj.14579
    *Nurani, A. M., Ozawa, Y., Furuya, T., Sakamoto, Y., Ebine, K., Matsunaga, S., Ueda, T., Fukuda, H., and *Kondo, Y. (2020) Deep imaging analysis in VISUAL reveals the role of YABBY genes in vascular stem cell fate determination. Plant Cell Physiol., 61, 255-264.
    https://doi.org/10.1093/pcp/pcaa002
    Hirai, R., Higaki, T., Takenaka, Y., Sakamoto, Y., Hasegawa, J., Matsunaga, S., *Demura, T., and *Ohtani, M. (2020) The progression of xylem vessel cell differentiation is dependent on the activity level of VND7 in Arabidopsis thaliana. Plants, 9, 39 (12 pages).
    https://www.mdpi.com/2223-7747/9/1/39/htm
  • -2019年-
    原著論文
    Kato, S., Okamura, E., Matsunaga, T. M., Nakayama, M., Kawanishi, Y., Ichinose, T., Iwane, A. H., Sakamoto, T., Imoto, Y., Ohnuma, M., Nomura, Y., Nakagami, H., Kuroiwa, H., Kuroiwa, T., and *Matsunaga, S. (2019) Cyanidioschyzon merolae aurora kinase phosphorylates evolutionarily conserved sites on its target to regulate mitochondrial division. Commun. Biol., 2, 477 (9 pages). [プレスリリース][新聞ネット記事]
    https://doi.org/10.1038/s42003-019-0714-x
    Hirakawa, T., Kuwata, K., Gallego, M. E., White, C. I., Nomoto, M., Tada, Y., and *Matsunaga, S. (2019) LSD1-LIKE1-mediated H3K4me2 demethylation is required for homologous recombination repair. Plant Physiol., 181, 499-509. [プレスリリース][新聞ネット記事]
    http://www.plantphysiol.org/content/181/2/499
    Hirakawa, T. and *Matsunaga, S. (2019) Characterization of DNA repair foci in root cells of Arabidopsis in response to DNA damage. Front. Plant Sci., 10, 990 (9pages).
    https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpls.2019.00990/full
    #Kurita, K., #Sakamoto, Y., Naruse, S., Matsunaga, T. M., Arata, H., Higashiyama, T., Habu, Y., Utsumi, Y., Utsumi, C., Tanaka, M., Takahashi, S., Kim, J. M., Seki, M., Sakamoto, T., and *Matsunaga, S. (2019) Intracellular localization of histone deacetylase HDA6 in plants. J. Plant Res., 132, 629?640.
    https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs10265-019-01124-8
    Diaz, M., Pe?inkova, P., Nowicka, A., Baroux, C., Sakamoto, T., Gandha, P. Y., Je?abkova, H., Matsunaga, S., Grossniklaus, U., and *Pecinka, A. (2019) The SMC5/6 complex subunit NSE4A is involved in DNA damage repair and seed development. Plant Cell, 31, 1579?1597.
    http://www.plantcell.org/content/31/7/1579
    #Sotta, N., #Sakamoto, T., Matsunaga, S., and *Fujiwara, T. (2019) Abnormal leaf development of rpt5a mutant under zinc deficiency reveals important role of DNA damage alleviation for normal leaf development. Sci. Rep., 9, 9369 (10 pages).
    https://www.nature.com/articles/s41598-019-44789-w
    Sakamoto, T., Sotta, N., Suzuki, T., Fujiwara, T., and *Matsunaga, S. (2019) The 26S proteasome is required for the maintenance of root apical meristem by modulating auxin and cytokinin responses under high-boron stress. Front. Plant Sci., 10, 590 (13 pages).
    https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpls.2019.00590/full
    Sakamoto, T., Sugiyama, T., Yamashita, T., and *Matsunaga, S. (2019) Plant condensin II is required for the correct spatial relationship between centromeres and rDNA arrays. Nucleus, 10, 116-125.
    https://doi.org/10.1080/19491034.2019.1616507
    Hayashi, K. and *Matsunaga, S. (2019) Heat and chilling stress induce nucleolus morphological changes. J. Plant Res., 132, 395-403.
    https://link.springer.com/article/10.1007/s10265-019-01096-9
    Utsumi, Y., Utsumi, C., Tanaka, M., Ha, C. V., Takahashi, S., Matsui, A., Matsunaga, T. M., Matsunaga, S., Kanno, Y., Seo, M., Okamoto, Y., Moriya, E., and *Seki, M. (2019) Acetic acid treatment enhances drought avoidance in cassava (Manihot esculenta Crantz). Front. Plant Sci., 10, 521 (12 pages).
    https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpls.2019.00521/full
    #Ishihara, H., *#Sugimoto, K., Tarr, P. T., Temman, H., Kadokura, S., Inui, Y., Sakamoto, T., Sasaki, T., Aida, M., Suzuki, T., Inagaki, S., Morohashi, K., Seki, M., Kakutani, T., Meyerowitz, E. M., and *Matsunaga, S. (2019) Primed histone demethylation regulates shoot regenerative competency. Nature Commun., 10, 1786 (15 pages). [プレスリリース] [新聞ネット記事]
    https://www.nature.com/articles/s41467-019-09386-5
    Myobatake, Y., *Kamisuki, S., Tsukuda, S., Higashi, T., Chinen, T., Takemoto, K., Hachisuka, M., Suzuki, Y., Takei, M., Tsurukawa, Y., Maekawa, H., Takeuchi, T., Matsunaga, T. M., Sahara, H., Usui, T., Matsunaga, S., and Sugawara, F. (2019) Pyrenocine A induces monopolar spindle formation and suppresses proliferation of cancer cells. Bioorg. Med. Chem., 27, 115149 (5 pages).
    https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0968089619313136
    Kobayashi, W., Liu, E., Ishii, H., Matsunaga, S., Schlögelhofer, P., and *Kurumizaka, H. (2019) Homologous pairing activities of Arabidopsis thaliana RAD51 and DMC1. J. Biochem., 165, 289-295.
    https://academic.oup.com/jb/advance-article/doi/10.1093/jb/mvy105/5230994
    総説論文
    Toyoda, Y. and *Matsunaga, S. (2019) Lysine-specific demethylase epigenetically regulates human and plant phenomena. Cytologia, 84, 295-298.
    https://www.jstage.jst.go.jp/article/cytologia/84/4/84_840401/_article/
    Shibuta, M. K., Matsuoka, M., and *Matsunaga, S. (2019) 2A peptides contribute to the co-expression of proteins for imaging and genome editing. Cytologia, 84, 107-111.
    https://www.jstage.jst.go.jp/article/cytologia/84/2/84_840203/_article/
    Shibuta, M. K. and *Matsunaga, S. (2019) Seasonal and diurnal regulation of flowering via an epigenetic mechanism in Arabidopsis thaliana. Cytologia, 84, 3-8.
    https://www.jstage.jst.go.jp/article/cytologia/84/1/84_840103/_article/
    Sugimoto, K., Temman, H., Kadokura, H., and *Matsunaga, S. (2019) To regenerate or not to regenerate: factors that drive plant regeneration. Curr. Opin. Plant Biol., 47, 138-150.
    https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1369526618300517
    日本語著書・解説
    栗田和貴、坂本卓也、松永幸大 (2019) 植物におけるエピジェネティクス状態の可視化技術、アグリバイオ(北隆館)、3 (2) 28-32.
    プレスリリース
    真核生物の起源につながる、細胞内小器官の分裂を制御するメカニズムを発見 ~「自分の中のよそもの」との同時増殖を可能にした制御機構とは? ~(2019年12月20日)
    https://www.tus.ac.jp/mediarelations/archive/20191220001.html
    植物がDNA損傷から身を守る、新規のエピジェネティクス制御メカニズムを解明 ~植物に多様なストレス耐性を付加でき、食糧生産にも貢献できる~(2019年8月5日)
    https://www.tus.ac.jp/mediarelations/archive/20190805001.html
    植物の驚異的な再生能力の秘密を解明 -「備えあれば憂いなし」、傷を受ける前に再生準備を整える植物再生の新しいメカニズムを発見 -(2019年4月16日)
    https://www.tus.ac.jp/today/2019041701.pdf
    新聞ネット記事・テレビ報道
    EurekAlert (2019年12月20日)A step closer to understanding evolution -- mitochondrial division conserved across species
    https://eurekalert.org/pub_releases/2019-12/tuos-asc121919.php
    Technology Networks (2019年8月5日)Novel Epigenetic Regulation Mechanism Underlies Improved Stress Response in Plants
    https://www.technologynetworks.com/applied-sciences/news/novel-epigenetic-regulation-mechanism-underlies-improved-stress-response-in-plants-322492
    SeedQuest (2019年8月1日)Scientists crack the code to improve stress tolerance in plants - Novel epigenetic regulation mechanism underlies improved stress response in plants, which can be exploited for global food security
    https://www.seedquest.com/news.php?type=news&id_article=109085
    Phys.org (2019年8月1日)Scientists crack the code to improve stress tolerance in plants
    https://phys.org/news/2019-08-scientists-code-stress-tolerance.html
    Science Daily (2019年8月1日)Scientists crack the code to improve stress tolerance in plants
    https://www.sciencedaily.com/releases/2019/08/190801104034.htm
    日本経済新聞 (2019年5月12日)朝刊 30面 草木再生 カギ握る酵素 東京理科大など発見 栽培に応用も
    https://www.nikkei.com/article/DGKKZO44622050Q9A510C1MY1000/
    東京新聞 (2019年4月29日)朝刊 4面 びっくり!新技術 植物の再生能力 酵素の働きに秘密あり
    日経バイオテクONLINE (2019年4月26日)東京理科大、植物の再生能力を支えるエピジェネ酵素を同定  再生の新機構解明をNature姉妹誌にて発表
    https://bio.nikkeibp.co.jp/atcl/news/p1/19/04/24/05544/
    Crop Biotech Update (2019年4月24日)Scientists Discover Ways to Regenerate Plant Tissues
    http://www.isaaa.org/kc/cropbiotechupdate/article/default.asp?ID=17407
    Editage Insights (2019年4月22日)植物の強力な再生能力の秘密を解明 -「備えあれば憂いなし」、受傷の前に再生準備を整える新しいメカニズムを発見-
    https://www.editage.jp/insights/scientists-crack-the-code-to-regenerate-plant-tissues
    Innovation Tronto (2019年4月21日)Cracking the code to regenerate plant tissues
    https://www.innovationtoronto.com/2019/04/cracking-the-code-to-regenerate-plant-tissues/
    化学工業日報 (2019年4月17日)植物再再生の酵素解明 遺伝子群統制し分化待機
    EurekAlert (2019年4月16日)Scientists crack the code to regenerate plant tissues
    https://www.eurekalert.org/pub_releases/2019-04/tuos-sct041619.php
    ScienceDaily (2019年4月16日)Scientists crack the code to regenerate plant tissues
    https://www.sciencedaily.com/releases/2019/04/190416132112.htm
    SCIENMAG (2019年4月16日)Scientists Crack The Code To Regenerate Plant Tissues
    https://scienmag.com/scientists-crack-the-code-to-regenerate-plant-tissues/
    科学新聞 (2019年1月1日) 過剰なホウ素毒性がDNA損傷の原因に
  • -2018年-
    原著論文
    Sakamoto, T., Tsujimoto-Inui, Y., Sotta, N., Hirakawa, T., Matsunaga, T. M., Fukao, Y., *Matsunaga, S., and *Fujiwara, T. (2018) Proteasomal degradation of BRAHMA promotes Boron tolerance in Arabidopsis. Nature Commun., 9, 5285 (16 pages). [プレスリリース] [新聞ネット記事]
    https://www.nature.com/articles/s41467-018-07393-6
    Yagi, N., Matsunaga, S., and *Hashimoto, T. (2018) Insights into cortical microtubule nucleation and dynamics in Arabidopsis leaf cells. J. Cell Sci., 131, 203778 (7 pages).
    http://jcs.biologists.org/content/131/2/jcs203778
    Hayashi, K., Kato, S., and *Matsunaga, S. (2018) Convolutional neural network-based automatic classification for algal morphogenesis. Cytologia, 83, 301-305.
    https://www.jstage.jst.go.jp/article/cytologia/83/3/83_D-18-00021/_article/
    #Kadokura, S., *#Sugimoto, K., Tarr, P., Suzuki, T., and *Matsunaga, S. (2018) Characterization of somatic embryogenesis initiated from the Arabidopsis shoot apex. Dev. Biol., 442, 13-27. [Cover]
    https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0012160617308023
    #Hasegawa, J., #Sakamoto, T., Fujimoto, T., Yamashita, T., Suzuki, T., and *Matsunaga, S. (2018) Auxin decreases chromatin accessibility through the TIR1/AFBs auxin signaling pathway in proliferative cells. Sci. Rep., 8, 7773 (12 pages). [プレスリリース][新聞ネット記事]
    https://www.nature.com/articles/s41598-018-25963-y
    Nishida, H., Tanaka, S., Handa, Y., Ito, M., Sakamoto, Y., Matsunaga, S., Betsuyaku, S., Miura, K., Soyano, T., Kawaguchi, M., and *Suzaki, T. (2018) A NIN-LIKE PROTEIN mediates nitrate-induced control of root nodule symbiosis in Lotus japonicus. Nature Commun., 9, 499 (14 pages).
    https://www.nature.com/articles/s41467-018-02831-x
    総説論文
    Watanabe, M., Sakamoto, Y., and *Matsunaga, S. (2018) Imaging with split fluorescent proteins based on the reconstruction of separated asymmetric protein fragments. Cytologia, 83, 347-350.
    https://www.jstage.jst.go.jp/article/cytologia/83/4/83_830401/_article
    *Kazama, Y., Hirano, T., Abe, T., and Matsunaga, S. (2018) Chromosomal rearrangement: from induction by heavy-ion irradiation to in vivo engineering by genome editing. Cytologia, 83, 125-128.
    https://www.jstage.jst.go.jp/article/cytologia/83/2/83_830202/_article/
    *Matsunaga, S. (2018) Planimal cells: Artificial photosynthetic animal cells inspired by endosymbiosis and photosynthetic animals. Cytologia, 83, 3-6.
    https://www.jstage.jst.go.jp/article/cytologia/83/1/83_830103/_article/
    英語著書
    Sekiguchi, Y., Kobayashi, A., Takayama, Y., Oide, M., Fukuda, A., Yamamoto, T., Okajima, K., Oroguchi, T., Hirakawa, T., Inui, Y., Matsunaga, S., Yamamoto, M., and Nakasako, M. (2018) Chapter 10 Coherent X-ray Diffraction Imaging of Cyanidioschyzon merolae. In "Cyanidioschyzon merolae: A New Model Eukaryote for Cell and Organelle Biology" edited by Kuroiwa, T., Miyagishima, S., Matsunaga, S., Sato, N., Nozaki, H., Tanaka, K., and Misumi, O. Springer, 153-173.
    Yoshida, Y., Sakamoto, Y., Iwasaki, K., Maruyama, S., and Matsunaga, S. (2018) Chapter 14 Double-Membrane-Bounded Organelles: Recent Findings Regarding Division, Inheritance, Structure, and Evolution of the Nucleus, Mitochondria, and Chloroplasts. In "Cyanidioschyzon merolae: A New Model Eukaryote for Cell and Organelle Biology" edited by Kuroiwa, T., Miyagishima, S., Matsunaga, S., Sato, N., Nozaki, H., Tanaka, K., and Misumi, O. Springer, 205-233.
    プレスリリース
    植物におけるホウ素毒性メカニズムの一端を解明 ~過剰なホウ素がもたらす DNA 損傷の発生とその緩和機構の発見~(2018年12月12日)
    https://www.tus.ac.jp/today/20181213001_02.pdf
    植物ホルモン・オーキシンは増殖細胞における DNA 損傷を減らす ~オーキシンにはDNAとタンパク質の複合体を凝縮させる効果があった~(2018年5月17日)
    https://www.tus.ac.jp/today/20180517003.pdf
    新聞ネット記事・テレビ報道
    日本経済新聞web (2018年12月12日) 植物におけるホウ素毒性メカニズムの一端を解明
    https://www.nikkei.com/article/DGXLRSP497950_S8A211C1000000/
    科学新聞(2018年6月8日)DNA損傷 減少効果 植物ホルモン同定 理科大
    化学工業日報(2018年5月23日)東京理科大 植物ホルモン「オーキシン」新機能発見 増殖細胞のDNA損傷軽減
  • -2017年-
    原著論文
    Fujimoto, S. and *Matsunaga, S. (2017) Visualization of chromatin loci with transiently expressed CRISPR/Cas9 in plants. Cytologia, 82, 559-562.
    https://www.jstage.jst.go.jp/article/cytologia/82/5/82_MS1997/_article
    #*Sakamoto, N. A., #Thuong Lan, V. H., #Fujimoto, S., Matsunaga, S., and Tanaka, A. (2017) An ion beam-induced Arabidopsis mutant with marked chromosomal rearrangement. J. Rad. Res., 58, 772-781. [プレスリリース] [新聞ネット記事]
    https://academic.oup.com/jrr/article/3862018/An-ion-beam-induced-Arabidopsis-mutant-with-marke
    Matsunaga, T. M., Ogawa, D., Taguchi-Shiobara, F., Ishimoto, M., Matsunaga, S., and *Habu, Y. (2017) Direct quantitative evaluation of disease symptoms on living plant leaves growing under natural light. Breed. Sci., 67, 316-319.
    https://www.jstage.jst.go.jp/article/jsbbs/67/3/67_16169/_article
    #*Kim, J. M., #To, T. K., Matsui, A., Tanoi, K., Kobayashi, N., Matsuda, F., Habu, Y., Ogawa, D., Sakamoto, T., Matsunaga, S., Bashir, K., Rasheed, S., Ando, M., Takeda, H., Kawaura, K., Kusano, M., Fukushima, A., Takaho, A. E., Kuromori, T., Ishida, J., Morosawa, T., Tanaka, M., Torii, C., Takebayashi, Y., Sakakibara, H., Ogihara, Y., Saito, K., Shinozaki, K., Devoto, A., and *Seki, M. (2017) Acetate-mediated novel survival strategy against drought in plants. Nature Plants, 3, 17097 (7 pages).
    https://www.nature.com/articles/nplants201797
    Okamura, E., Sakamoto, T., Sasaki, T., and *Matsunaga, S. (2017) A plant ancestral polo-like kinase sheds light on the mystery of the evolutionary disappearance of polo-like kinases in the plant kingdom. Cytologia, 82, 261-266
    https://www.jstage.jst.go.jp/article/cytologia/82/3/82_MS1944/_article
    #Spallek, T., #Melnyk, C. W., Wakatake, T., Zhang, J., Sakamoto, Y., Kiba, T., Yoshida, S., Matsunaga, S., Sakakibara, H., and *Shirasu, K. (2017) Interspecies hormonal control of host root morphology by parasitic plants. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 114, 5283-5288.
    http://www.pnas.org/content/114/20/5283
    #Kurita, K., #Sakamoto, T., Yagi, N., Sakamoto, Y., Ito, A., Nishino, N., Sako, K., Yoshida, M., Kimura, H., Seki, M., and *Matsunaga, S. (2017) Live imaging of H3K9 acetylation in plant cells. Sci. Rep., 7, 45894 (9 pages). [プレスリリース] [新聞ネット記事]
    https://www.nature.com/articles/srep45894
    Hirakawa, T., Hasegawa, J., White, C. I., and *Matsunaga, S. (2017) RAD54 forms DNA repair foci in response to DNA damage in living plant cells. Plant J., 90, 372-382.[プレスリリース] [新聞ネット記事]
    https://doi.org/10.1111/tpj.13499
    #*Kurihara, D., #Kimata, Y., Higashiyama, T., and *Ueda, M. (2017) In Vitro ovule cultivation for live-cell imaging of Zygote polarization and Embryo patterning in Arabidopsis thaliana. J. Vis. Exp., 127, e55975.
    https://www.jove.com/video/55975/
    *Ueda, M., Aichinger, E., Gong, W., Groot, E., Verstraeten, I., Vu, L. D., De Smet, I., Higashiyama, T., Umeda, M.,and *Laux, T. (2017) Transcriptional integration of paternal and maternal factors in the Arabidopsis zygote. Genes & Dev., 31, 617-627. [プレスリリース] [新聞ネット記事]
    http://genesdev.cshlp.org/content/31/6/617.full
    総説論文
    *Tsukaya, H. and Matsunaga, S. (2017) Tissue-dependency of the impact of endoreduplication on cell size. Plant Morphology, 29, 87-90.
    https://www.jstage.jst.go.jp/article/plmorphol/29/1/29_87/_article/
    *Matsunaga, S. and Matsunaga, T. M. (2017) FISH with padlock probes can efficiently reveal the genomic position of low or single-copy DNA sequences. Cytologia, 82, 337-339.
    https://www.jstage.jst.go.jp/article/cytologia/82/4/82_820402/_article
    Hoshino, A., Matsunaga, T. M., Sakamoto, T., and *Matsunaga, S. (2017) Hi-C revolution: from a snapshot of DNA-DNA interaction in a single cell to chromosome-scale de novo genome assembly. Cytologia, 82, 223-226.
    https://www.jstage.jst.go.jp/article/cytologia/82/3/82_170523/_article
    Sakamoto, Y. and *Matsunaga, S. (2017) Deep imaging of plant roots by a rapid transparency technique TOMEI. Cytologia, 82, 221-222.
    https://www.jstage.jst.go.jp/article/cytologia/82/3/82_170210/_article
    *Matsunaga, S. and Nakaya, A. (2017) Computational synteny analysis promotes a better understanding of chromosome evolution. Cytologia, 82, 101-104.
    https://www.jstage.jst.go.jp/article/cytologia/82/2/82_820201/_article
    日本語著書・解説
    栗田和貴、坂本卓也、松永幸大 (2017) 植物のヒストン修飾ライブイメージング、Plant Morphology、29 (1) 3-7.
    https://www.jstage.jst.go.jp/article/plmorphol/29/1/29_3/_article/-char/ja/
    坂本勇貴、松永幸大 (2017) 生体組織深部イメージングのための透明化技術、JSMI Report、11 (1) 17-21.
    松永幸大 (2017) For your Lifework、遺伝、71 (2) 183.
    植田美那子 (2017) 植物受精卵が極性化する動態のライブイメージング、Plant Morphology、29 (1) 23-26.
    https://www.jstage.jst.go.jp/article/plmorphol/29/1/29_23/_article/-char/ja/
    プレスリリース
    イオンビームが植物の染色体構造をがらりと変えることを発見 - 植物ゲノムはしなやかに進化を目指す -(2017年6月13日)
    https://www.tus.ac.jp/today/20170615101.pdf
    植物のエピジェネティクス変化をリアルタイムに捉えることに成功 ~マウスの抗体の一部が生きた植物細胞内でも抗原を認識した~(2017年4月18日)
    https://www.tus.ac.jp/today/20170418018.pdf
    放射線や化学物質により形成される植物の核内構造体の発見 ~植物のストレス診断指標を見出す~(2017年2月8日)
    https://www.tus.ac.jp/today/20161011001.pdf
    Maternal and paternal cooperation(Freiburg大学) (2017年5月8日)
    https://www.pr.uni-freiburg.de/pm-en/2017/maternal-and-paternal-cooperation
    植物では両親の遺伝子の協力によって子供の形ができる ~父母由来の因子が受精卵を非対称に分裂させることを発見~(名古屋大学トランスフォーマティブ生命分子研究所) (2017年4月21日)
    http://www.itbm.nagoya-u.ac.jp/ja/research/2017/04/GandD-Parents.php
    新聞ネット記事・テレビ報道
    科学新聞(2017年6月23日)イオン照射で染色体変異 構造変化を初証明 植物作出「別の種の性質」
    大学ジャーナルオンライン(2017年6月22日)イオンビーム照射により植物の進化を人工的にデザインできる可能性-東京理科大学
    http://univ-journal.jp/14378/
    日経産業新聞(2017年6月16日)染色体異常でも受粉・生育 量研機構など ビーム照射で確認
    時事ドットコムニュース(2017年6月15日)イオン照射で染色体変異=品種改良に応用期待
    化学工業日報(2017年6月15日)植物の染色体構造変化 量研機構など イオンビーム照射で
    日本農業新聞(2017年6月15日)染色体に変異も 自家受粉で増殖 イオンビーム照射 品種改良に応用期待
    科学新聞(2017年5月12日)植物のエピジェネティクス変化 リアルタイムにキャッチ成功 - マウス抗体の一部、植物細胞内で抗原結合 - 理科大、理研、東工大
    東京新聞(2017年4月24日)・中日新聞(2017年4月27日)びっくり!新技術 植物を透明化 葉の裏側まで丸見え
    日経バイオテクONLINE アカデミック版(2017年4月20日) 東京理科大学、植物のエピジェネティクス変化をリアルタイムに捉えることに成功 - マウスの抗体の一部が生きた植物細胞内でも抗原を認識した -
    https://bio.nikkeibp.co.jp/atcl/release/17/04/20/03844/
    日経産業新聞(2017年4月20日)遺伝子活性化で光 東京理科大 生きた植物で観察
    化学工業日報(2017年4月19日)植物DNA修飾変化 リアルタイムに解析 東京理科大など - 生きた単一細胞で初
    科学新聞(2017年3月3日)放射線ストレスに反応して形成 東京理科大 核内構造体を発見
    フジサンケイビジネスアイ(2017年2月23日)植物のストレス度合いを診断 放射線や化学物質で形成する植物の核内構造体発見 東京理科大学
    科学新聞 (2017年5月17日) 植物の成長に両親由来遺伝子が協力
    日経産業新聞 (2017年4月25日) 朝刊8面 受精卵の成長過程 解明 名大 植物異種交配しやすく
    グノシー (2017年4月25日) 植物の子育ては「父母の協力」、名古屋大グループらが新発見
    https://gunosy.com/articles/RNB9i
    マイナビニュース (2017年4月25日)
    http://news.mynavi.jp/news/2017/04/25/095/
    Infoseekニュース (2017年4月25日)
    gooニュース (2017年4月25日)
    エキサイトニュース (2017年4月25日)
    Mapionニュース (2017年4月25日)
    NTTドコモニュース (2017年4月25日)
    Biglobeニュース (2017年4月25日)
    日本の研究.com (2017年4月17日) 植物では両親の遺伝子の協力によって子供の形ができる ~父母由来の因子が受精卵を非対称に分裂させることを発見~
    https://research-er.jp/articles/view/57520
    日経バイオテク (2017年4月17日) 名古屋大学、植物では両親の遺伝子の協力によって子供の形ができる
    https://bio.nikkeibp.co.jp/atcl/release/17/04/17/03832/
  • -2016年-
    原著論文
    Fujimoto, S., Sugano, S. S., Kuwata, K., Osakabe, K., and *Matsunaga, S. (2016) Visualization of specific repetitive genomic sequences with fluorescent TALEs in Arabidopsis thaliana. J. Exp. Bot., 67, 6101-6110. [新聞ネット記事] [プレスリリース]
    http://jxb.oxfordjournals.org/content/67/21/6101.full
    #Takagi, M., #Sakamoto, T., Suzuki, R., Nemoto, K., Obayashi, T., Matsunaga, T. M., Hirakawa, T., Kurihara, D., Nariai, Y., Urano, T., Sawasaki, T., *Matsunaga, S. (2016) Plant Aurora kinases interact with and phosphorylate transcription factors. J. Plant Res., 129, 1165-1178.
    http://link.springer.com/article/10.1007/s10265-016-0860-x
    Fujimoto, S., Matsunaga, S., and *Murata, M. (2016) Mapping of T-DNA and Ac/Ds by TAIL-PCR to analyze chromosomal rearrangements. Methods Mol. Biol., 1469, 207-216.
    https://link.springer.com/protocol/10.1007%2F978-1-4939-4931-1_17
    Hirakawa, T. and *Matsunaga, S. (2016) Three-dimensional, live-cell imaging of chromatin dynamics in plant nuclei using chromatin tagging systems. Methods Mol. Biol., 1469, 189-195.
    https://link.springer.com/protocol/10.1007%2F978-1-4939-4931-1_15
    Yokoyama, R., Hirakawa, T., Hayashi, S., Sakamoto, T., and *Matsunaga, S. (2016) Dynamics of plant DNA replication based on PCNA visualization. Sci. Rep., 6, 29657 (9 pages). [プレスリリース]
    http://www.nature.com/articles/srep29657
    Sotta, N., Shantikumar, L., Sakamoto, T., Matsunaga, S., and *Fujiwara, T. (2016) TPR5 is involved in directional cell division and is essential for the maintenance of meristem cell organization in Arabidopsis thaliana. J. Exp. Bot., 67, 2401-2411.
    http://jxb.oxfordjournals.org/content/early/2016/02/16/jxb.erw043.full?sid=5056a9d1-44e7-4b6a-9a21-81552cc405b4
    Katagiri, Y., Hasegawa, J., Fujikura, U., Hoshino, R., *Matsunaga, S., and *Tsukaya, H. (2016) The coordination of ploidy and cell size differs between cell layers in leaves. Development, 143, 1120-1125.
    http://dev.biologists.org/content/143/7/1120
    Hasegawa, J., Sakamoto, Y., Nakagami, S., Aida, M., Sawa, S., and *Matsunaga, S. (2016) Three-dimensional imaging of plant organs using a simple and rapid transparency technique. Plant Cell Physiol., 57, 462-472.
    http://pcp.oxfordjournals.org/content/57/3/462.full
    #Kimata, Y., Higaki, T., Kawashima, T., Kurihara, D., Sato, Y., Yamada, T., Hasezawa, S., Berger, F., Higashiyama, T., and *Ueda, M. (2016) Cytoskeleton dynamics control the first asymmetric cell division in Arabidopsis zygote. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 113, 14157-14162. [Cover] [新聞ネット記事] [プレスリリース]
    http://www.pnas.org/content/113/49/14157.full?sid=2e9b9b43-088d-4060-8da6-ede6c586f6b7
    #*Nambo, M., Kurihara, D., Yamada, T., Nishiwaki, O. T., Kadofusa, N., Kimata, Y., Kuwata, K., Umeda, M., and #*Ueda, M. (2016) Combination of synthetic chemistry and live-cell imaging identified a rapid cell division inhibitor in tobacco and Arabidopsis thaliana. Plant Cell Physiol., 57, 2255-2268. [新聞ネット記事] [プレスリリース]
    http://pcp.oxfordjournals.org/content/57/11/2255
    総説論文
    Fujimoto, S. and *Matsunaga, S. (2016) Chromatin live imaging with genome editing techniques: switching from scissors to a lamp. Cytologia, 81, 359-362.
    https://www.jstage.jst.go.jp/article/cytologia/81/4/81_810402/_article
    Fujimoto, S. and *Matsunaga, S. (2016) Which is a reliable approach in the generation of artificial minichromosomes, bottom-up or top-down? Cytologia, 81, 251-256.
    https://www.jstage.jst.go.jp/article/cytologia/81/3/81_810302/_article
    Hirakawa, T. and *Matsunaga, S. (2016) Chromatin tagging systems contribute to live imaging analyses for chromatin dynamics. Cytologia, 81, 121-123.
    https://www.jstage.jst.go.jp/article/cytologia/81/2/81_810203/_article
    *Matsunaga, S. (2016) FISH is in the limelight again as more a cytogenetical technique for metaphase chromosomes. Cytologia, 81, 3-6.
    https://www.jstage.jst.go.jp/article/cytologia/81/1/81_3/_article
    英語著書
    Sakamoto, T., Sakamoto, Y., and *Matsunaga, S. (2016) Cell division and cell growth. In “Molecular cell biology of the growth and differentiation of plant cells” edited by Ray Rose. CRC press, 86-98.
    日本語著書・解説
    坂本勇貴、松永幸大 (2016) 植物の透明化技術TOMEI、顕微鏡、51 (3) 150-153.
    松永幸大(2016)植物細胞核内の動的空間を見る、日経バイオテク、12、36-38.
    長谷川淳子、松永幸大(2016)短時間で植物組織の内部を観察する手法 TOMEI、バイオサイエンスとインダストリー、74 (5) 406-408.
    長谷川淳子、松永幸大(2016)目で見るバイオ 植物の内部を切片化せずに観察、バイオサイエンスとインダストリー、74 (5) 378-379.
    坂本勇貴、松永幸大(2016)生体組織・器官の透明化イメージング ケミカルエンジニヤリング、61(7) 32-36.
    藤本聡、松永幸大(2016)生細胞におけるクロマチン配置の可視化法 ケミカルエンジニヤリング 61(2) 100-103. http://ci.nii.ac.jp/naid/40020722957
    池北雅彦、武村政春、鳥越秀峰、田村浩二、水田龍信、橋本茂樹、太田尚孝、鞆達也、和田直之、松永幸大、吉澤一巳、鈴木智順、秋本和憲(2016)理工系の基礎 生命科学入門
    松永幸大 (2016) 核、394-395、植物学の百科事典
    植田美那子 (2016) 植物の初期胚イメージング系の発展、植物科学の最前線 (BSJ-Review)、7、177 (5 pages).
    プレスリリース
    植物の DNA を生きたまま観察できる手法を開発~ゲノム編集のハサミをランプに替えることで作物のゲノム育種に貢献~(2016年10月11日)
    https://www.tus.ac.jp/today/20161011001.pdf
    植物のDNA合成をリアルタイムで観察できるPCNA法の開発~作物のバイオマス増大プロセスの解析への応用に期待~(2016年7月15日)
    https://www.tus.ac.jp/today/20160715101.pdf
    細胞と葉の大きさを決める隠されたしくみ(2016年4月6日)
    https://www.tus.ac.jp/today/20160406_001.pdf
    透明作物を短時間で作製する手法“TOMEI”の開発~作物の内部構造の解析やバイオマス定量解析が可能に~(2016年2月26日)
    https://www.tus.ac.jp/today/201603010000.pdf
    植物の受精卵が偏る仕組みを発見 ~細胞骨格がダイナミックに変化する様子の観察に成功~ (名古屋大学)(2016年11月22日)
    http://www.nagoya-u.ac.jp/about-nu/public-relations/researchinfo/upload_images/20161122_itbm.pdf
    植物の受精卵が偏る仕組みを発見 ~細胞骨格がダイナミックに変化する様子の観察に成功~(東京大学)(2016年11月22日)
    http://www.k.u-tokyo.ac.jp/info/entry/22_entry522/
    植物の細胞分裂を急速に止める新規化合物の発見 ~合成化学と植物科学の融合から植物の成長を制御する新たな薬剤の探索~(名古屋大学)(2016年11月10日)
    http://www.nagoya-u.ac.jp/about-nu/public-relations/researchinfo/upload_images/20161110_itbm.pdf
    新聞ネット記事・テレビ報道
    科学新聞(2016年10月28日)生きたまま植物DNA解析 TALE-FP法 東京理科大グループが開発
    日経バイオテクONLINE アカデミック版(2016年10月27日) 理科大と京大、名大、徳島大、生きた植物の核内DNAを解析できるTALE FP法 - ゲノム編集ツールで植物のエピゲノム育種にも貢献
    フジサンケイビジネスアイ(2016年10月26日)植物のDNAを生きたまま観察できる手法を開発 東京理科大学
    化学工業日報(2016年10月20日)東京理科大など 蛍光たんぱく ゲノム編集で配置 - 植物DNAを生きたまま観察 作物育種技術に応用期待
    日経産業新聞(2016年10月20日)生きた植物 DNA観察 東京理科大 ゲノム編集で発光
    科学新聞(2016年7月29日)植物のDNA合成 リアルタイム観察 ~理科大が「PCNA法」開発~
    化学工業日報(2016年7月20日)植物のDNA合成 生きた細胞から解析 東京理科大・JST
    日刊工業新聞(2016年4月6日)植物の細胞核と細胞のサイズ比例、葉表皮の限定現象‐東大など発見
    科学新聞(2016年3月25日)透明作物を短時間で作製 理科大、熊本大など新たな手法開発
    文化放送「オトナカレッジ」(2016年3月15日)植物の透明化に新たな発見
    フジサンケイビジネスアイ(2016年3月31日号)大学発 ここにあり!日本を支える研究活動と技術開発: 植物を透明にして内部構造を観察する手法の開発
    読売新聞(2016年3月7日)植物、数時間で透明に
    化学工業日報(2016年3月7日)作物を2時間で透明化 内部構造研究や害虫検査が 容易に 東京理科大など
    朝日新聞(2016年3月1日)植物まるごと透明化
    熊本日日新聞(2016年3月1日)短時間で植物透明化 品種改良、害虫検出に
    日刊工業新聞(2016年3月1日)短時間で植物透明化 傷付けず内部構造観察 東京理科大など
    Kentucky University (2016年12月2日) UK research provides insight into plant cell division
    http://news.ca.uky.edu/article/uk-research-provides-insight-plant-cell-division
    Global Plant Council (2016年11月30日) THREE RINGS STOP CELL DIVISION IN PLANTS: DEVELOPMENT OF A TRIARYLMETHANE COMPOUND FOR POSSIBLE CONTROL OF PLANT GROWTH
    Phys.Org (2016年11月29日) Live cell imaging of asymmetric cell division in fertilized plant cells
    http://phys.org/news/2016-11-cell-imaging-asymmetric-division-fertilized.html
    Science Daily (2016年11月29日) Live cell imaging of asymmetric cell division in fertilized plant cells Insight into why leaves grow up and roots grow down in flowering plants
    https://www.sciencedaily.com/releases/2016/11/161129084231.htm
    Science Magazine (2016年11月29日) Live cell imaging of asymmetric cell division in fertilized plant cells
    http://scienmag.com/live-cell-imaging-of-asymmetric-cell-division-in-fertilized-plant-cells/
    Bioengineer (2016年11月29日) Live cell imaging of asymmetric cell division in fertilized plant cells
    https://bioengineer.org/live-cell-imaging-of-asymmetric-cell-division-in-fertilized-plant-cells/
    AlphaGalileo (2016年11月29日) Live cell imaging of asymmetric cell division in fertilized plant cells ~ Insight into why leaves grow up and roots grow down in flowering plants ~
    http://www.alphagalileo.org/ViewItem.aspx?ItemId=170420&CultureCode=en
    ResearchSEA (2016年11月29日) An international group of plant biologists have succeeded for the first time in visualizing how egg cells in plants divides unequally after being fertilized.
    http://www.researchsea.com/html/article.php/aid/10234/cid/1/research/science/
    institute_of_transformative_bio-molecules__wpi-itbm___nagoya_university/
    live_cell_imaging_of_asymmetric_cell_division_in_fertilized_plant_cells.html
    EurekAlert! (2016年11月29日) Live cell imaging of asymmetric cell division in fertilized plant cells
    https://www.eurekalert.org/pub_releases/2016-11/iotb-lci112916.php
    日経産業新聞 (2016年11月28日) 受精卵の非対称分裂解明 名大、植物で
    Phys.Org (2016年11月25日)Development of a triarylmethane compound for possible control of plant growth
    http://phys.org/news/2016-11-triarylmethane-compound-growth.html
    Science Daily (2016年11月25日)Three rings stop cell division in plants Development of a triarylmethane compound for possible control of plant growth
    https://www.sciencedaily.com/releases/2016/11/161125084223.htm
    Alpha Galileo JP (2016年11月25日)植物の細胞分裂を急速に止める新規化合物の発見 ~合成化学と植物科学の融合から植物の成長を制御する新たな薬剤の探索~
    http://www.alphagalileo.org/ViewItem.aspx?ItemId=170337&CultureCode=ja
    EurekAlert! (2016年11月25日)植物の細胞分裂を急速に止める新規化合物の発見 合成化学と植物科学の融合から植物の成長を制御する新たな薬剤の探索
    https://www.eurekalert.org/pub_releases_ml/2016-11/iotb-k112516.php
    日本の研究.com (2016年11月24日) 植物の受精卵が偏る仕組みを発見 ~細胞骨格がダイナミックに変化する様子の観察に成功~
    https://research-er.jp/articles/view/52743
    朝日新聞 (2016年11月22日) 花・葉は上に 根は下に ー どうやって? 受精卵のたんぱく質2種を観察
    中日新聞 (2016年11月22日) 植物受精卵 細胞分裂の仕組み確認
    日本の研究.com (2016年11月10日) 植物の細胞分裂を急速に止める新規化合物の発見 ~合成化学と植物科学の融合から植物の成長を制御する新たな薬剤の探索~
    https://research-er.jp/articles/view/52160
  • -2015年-
    原著論文
    Izaguirre-Carbonell, J., Kawakubo, H., Murata, H., Tanabe, A., Takeuchi, T., Kusayanagi, T., Tsukuda, S., Hirakawa, T., Iwabata, K., Kanai, Y., Ohta, K., Miura, M., Sakaguchi, K., Matsunaga, S., Sahara, H., *Kamisuki, S., and *Sugawara, F. (2015) Novel anticancer agent, SQAP, binds to focal adhesion kinase and modulates its activity. Sci. Rep., 5, 15136 (13 pages).
    http://www.nature.com/articles/srep15136
    #Oroguchi, T., #Sekiguchi, Y., Kobayashi, A., Masaki, Y., Fukuda, A., Hashimoto, S., *Nakasako, M., Ichikawa, I., Kurumizaka, H., Shimizu, M., Inui, Y., Matsunaga, S., Kato, T., Namba, K., Yamaguchi, K., Kuwata, K., Kameda, H., Fukui, N., Kawata, Y., Kameshima, T., Takayama, Y., Yonekura, K., and Yamamoto, M. (2015) Cryogenic coherent X-ray diffraction imaging for biological non-crystalline particles using the KOTOBUKI-1 diffraction apparatus at SACLA. J. Phys. B., 48, 184003 (11 pages).
    http://iopscience.iop.org/0953-4075/48/18/184003/metrics
    Hirakawa, T., Katagiri, Y., Ando, T., and *Matsunaga, S. (2015) DNA double-strand breaks alter the spatial arrangement of homologous loci in plant cells. Sci. Rep., 5, 11058 (8 pages). [プレスリリース][新聞ネット記事]
    http://www.nature.com/articles/srep11058
    #Takayama, Y., #Inui, Y., #Sekiguchi, Y., Kobayashi, A., Oroguchi, T., Yamamoto, M., *Matsunaga, S., and *Nakasako, M. (2015) Coherent X-ray diffraction imaging of chloroplasts from Cyanidioschyzon merolae by using X-ray free electron laser. Plant Cell Physiol., 56, 1272-1286. [プレスリリース][新聞ネット記事][Cover]
    https://academic.oup.com/pcp/article/56/7/1272/2756362
    Gooh, K., Ueda, M., Aruga, K., Park, J., Arata, H., Higashiyama, T., and *Kurihara, D. (2015) Live-cell imaging and optical manipulation of Arabidopsis early embryogenesis. Dev. Cell 34, 242-251.
    http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1534580715003974
    *Maruyama, D., Volz, R., Takeuchi, H., Mori, T., Igawa, T., Kurihara, D., Kawashima, T., Ueda, M., Ito, M., Umeda, M., Nishikawa, S., Gros-Hardt, R., and Higashiyama, T. (2015) Rapid elimination of the persistent synergid through a cell fusion mechanism. Cell 161, 907-918.
    http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867415003050
    日本語著書・解説
    平川健、松永幸大 (2015) DNA損傷時における植物クロマチン動態のイメージング解析、ISOTOPES NEWS、741、26-30.
    プレスリリース
    低温X線回析イメージングによる葉緑体内部構造の非侵襲・高分解能観察に成功 (2015年7月13日)
    https://www.keio.ac.jp/ja/press_release/2015/osa3qr000000z1go-att/150713_1.pdf
    植物の放射線傷害への応答反応を可視化することに成功~放射線により生じた傷を治すために染色体はダイナミックに動いていた~ (2015年6月3日)
    https://www.tus.ac.jp/today/20150605001.pdf
    新聞ネット記事・テレビ報道
    化学工業日報 (2015年7月23日) 葉緑体内部を観察 慶大 ― 理科大が新技術 非侵襲で高解像度
    日本経済新聞 (2015年6月29日) 転移がん高精度判定 東京理科大など 画像解析ソフト
    化学工業日報 (2015年6月22日) 東京理科大 植物細胞の染色体 動態変化を可視化 放射線に強い品種作出へ前進
    科学新聞 (2015年6月19日) 植物の放射線傷害応答反応を可視化
    原子力産業新聞 (2015年6月9日) 東京理科大、植物の放射線障害に対する応答反応を可視化
    日刊工業新聞 (2015年6月8日) 放射線傷害を受けた植物の細胞で染色体接近、DNA修復の可能性 ― 東京理科大が発見

杉本班

福田班

  • -2020年-
    原著論文
    *Nurani, A. M., Ozawa, Y., Furuya, T., Sakamoto, Y., Ebine, K., Matsunaga, S., Ueda, T., Fukuda, H., and *Kondo, Y. (2020) Deep imaging analysis in VISUAL reveals the role of YABBY genes in vascular stem cell fate determination. Plant Cell Physiol., 61, 255-264.
    https://doi.org/10.1093/pcp/pcaa002
  • -2019年-
    原著論文
    *Ohashi-Ito, K., Iwamoto, K., Nagashima, Y., Kojima, M., Sakakibara, H., and Fukuda, H. (2019) A positive feedback loop comprising LHW-TMO5 and local auxin biosynthesis regulates initial vascular development in Arabidopsis roots. Plant Cell Physiol., 60, 2684-2691.
    https://doi.org/10.1093/pcp/pcz156
    *Betsuyaku, S., Nomura, N., and Fukuda, H. (2019) A versatile method for mounting Arabidopsis leaves for intravital time-lapse imaging. J. Vis. Exp., 144, e59147 (7 pages).
    https://www.jove.com/video/59147
    *#Endo, S., #Iwai, Y., and *Fukuda, H. (2019) Cargo‐dependent and cell wall‐associated xylem transport in Arabidopsis. New Phytol., 222, 159-170.
    https://nph.onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/nph.15540
    #Sugiyama, Y., #Nagashima, Y., Wakazaki, M., Sato, M., Toyooka, K., Fukuda, H., and *Oda, Y. (2019) A Rho-actin signaling pathway shapes cell wall boundaries in Arabidopsis xylem vessels. Nature Commun., 10, 468 (10 pages).
    https://www.nature.com/articles/s41467-019-08396-7
    総説論文
    *Fukuda, H. and Ohashi-Ito, K. (2019) Vascular tissue development in plants. Curr. Top. Dev. Biol., 131, 141-160.
    https://doi.org/10.1016/bs.ctdb.2018.10.005
  • -2018年-
    原著論文
    *Betsuyaku, S., Katou, S., Takebayashi, Y., Sakakibara, H., Nomura, N., and Fukuda, H. (2018) Salicylic acid and jasmonic acid pathways are activated in spatially different domains around the infection site during effector-triggered immunity in Arabidopsis thaliana. Plant Cell Physiol., 59, 8-16.
    https://academic.oup.com/pcp/article/59/1/8/4644744
    *Saito, M., Kondo, Y.,, and *Fukuda, H. (2018) BES1 and BZR1 redundantly promote phloem and xylem differentiation. Plant Cell Physiol., 59, 590-600.
    https://academic.oup.com/pcp/article/59/3/590/4827626
    Yamazaki, K., *Kondo, Y.,, Kojima, M., Takebayashi, Y., Sakakibara, H., and *Fukuda, H. (2018) Suppression of DELLA signaling induces procambial cell formation in culture. Plant J., 94, 48-59.
    https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/tpj.13840
    *Ohashi-Ito, K., Iwamoto, K., and *Fukuda, H. (2018) LOB DOMAIN-CONTAINING PROTEIN 15 positively regulates expression of VND7, a master regulator of tracheary elements. Plant Cell Physiol., 59, 989-996.
    https://academic.oup.com/pcp/article/59/5/989/4850576
    Nagashima, Y., Tsugawa, S., Mochizuki, A., Sasaki, T., Fukuda, H., and *Oda, Y. (2018) A Rho-based reaction-diffusion system governs cell wall patterning in metaxylem vessels. Sci. Rep., 8, 11542 (17 pages). [プレスリリース]
    https://www.nature.com/articles/s41598-018-29543-y
    *Endo, S., Iwamoto, K., and *Fukuda, H. (2018) Overexpression and cosuppression of xylem-related genes in an early xylem differentiation stage-specific manner by the AtTED4 promoter. Plant Biotechnol. J., 16, 451-458.
    http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/pbi.12784/full
    Yoo, C.-M., Naramoto, S., Sparks, J. A., Khan, B. R., Nakashima, J., Fukuda, H., and *Blancaflor, E. B. (2018) Deletion analysis of AGD1 reveals domains crucial for its plasma membrane recruitment and function in root hair polarity. J. Cell Sci., 131, 1-13.
    http://jcs.biologists.org/content/131/2/jcs203828
    *Takahashi, F., Suzuki, T., Osakabe, Y., Betsuyaku, S., Kondo, Y., Dohmae, N., Fukuda, H., Yamaguchi-Shinozaki, K., and *Shinozaki, K. (2018) A small peptide modulates stomatal control via abscisic acid in long-distance signaling. Nature, 556, 235-238.
    https://www.nature.com/articles/s41586-018-0009-2
    総説論文
    Nurani, A. M., Kondo, Y., and Fukuda, H. (2018) Ectopic vascular induction in Arabidopsis cotyledons for sequential analysis of phloem differentiation. Methods Mol. Biol., 1830, 149-159.
    https://link.springer.com/protocol/10.1007%2F978-1-4939-8657-6_10
    プレスリリース
    植物の水の通り道を自在に制御する (2018年8月28日)
    http://www.s.u-tokyo.ac.jp/ja/press/2018/6016/
  • -2017年-
    原著論文
    Guo, X., Wang, J., Gardner, M., Fukuda, H., Kondo, Y., Etchells, J. P., Wang, X., and Mitchum, M. G. (2017) Identification of cyst nematode B-type CLE peptides and modulation of the vascular stem cell pathway for feeding cell formation. PLOS Pathog., 13, e1006142 (19 pages).
    http://journals.plos.org/plospathogens/article?id=10.1371/journal.ppat.1006142
    Sugiyama, Y., Wakazaki, M., Toyooka, K., Fukuda, H., and *Oda, Y. (2017) A novel plasma membrane-anchored protein regulates wood cell-wall deposition through microtubule-dependent lateral inhibition of Rho GTPase domains. Curr. Biol., 27, 2522-2528.
    https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0960982217307960
    Inoue, K., Araki, T., *Endo, M. (2017) Integration of input signals into the gene network in the plant circadian clock. Plant Cell Physiol., 58, 977-982.
    https://academic.oup.com/pcp/article/58/6/977/3811177/Integration-of-Input-Signals-into-the-Gene-Network
    英語著書
    Saito, M., Nurani, A. M., Kondo, Y., and Fukuda, H. (2017) Tissue culture of xylem differentiation with Arabidopsis leaves. In “Xylem-Methods and Protocols” edited by de Lucas, M. and Etchells, J. P. Humana press, 59-65.
  • -2016年-
    原著論文
    *Kondo, Y., Nurani, A. M., Saito, C., Ichihashi, Y., Saito, M., Yamazaki, K., Mitsuda, N., Ohme-Takagi, M., and *Fukuda, H. (2016) Vascular cell Induction culture System Using Arabidopsis Leaves (VISUAL) reveals the sequential differentiation of sieve element-like cells. Plant Cell, 28, 1250-1262. [プレスリリース]
    http://www.plantcell.org/content/28/6/1250
    *Doi, H., Chinen, A., Fukuda, H., and Usuda, Y. (2016) Vibrio algivorus sp. nov., an alginate and agarose assimilating bacterium isolated from the gut flora of a turban shell marine snail. Int. J. Syst. Evol. Micr., 66, 3164-3169.
    http://ijs.microbiologyresearch.org/content/journal/ijsem/10.1099/ijsem.0.001165
    Inada, N., Betsuyaku, S., Shimada, T. L., Ebine, K., Ito, E., Kutsuna, N., Hasezawa, S., Takano, Y., Fukuda, H., Nakano, A., and *Ueda, T. (2016) Modulation of plant RAB GTPase-mediated membrane trafficking pathway at the interface between plants and obligate biotrophic pathogens. Plant Cell Physiol., 57, 1854-1864. [Editor-in-chief's choice]
    https://academic.oup.com/pcp/article/57/9/1854/2223160
    Morita, J., Kato, K., Nakane, T., Kondo, Y., Fukuda, H., Nishimasu, H., *Ishitani R., and *Nureki, O. (2016) Crystal structure of the plant receptor-like kinase TDR in complex with the TDIF peptide. Nature Commun., 7, 12383 (9 pages). [プレスリリース]
    http://www.nature.com/ncomms/2016/160808/ncomms12383/full/ncomms12383.html
    *Naramoto, S., Dainobu, T., Tokunaga, H., Kyozuka, J., and Fukuda, H. (2016) Cellular and developmental function of ACAP type ARF-GAP proteins are diverged in plant cells. Plant Biotechnology, 33, 309-314.
    https://www.jstage.jst.go.jp/article/plantbiotechnology/33/4/33_16.0309a/_article
    Tazoe, Y., Sazuka, T., Yamaguchi, M., Saito, C., Ikeuchi, M., Kanno, K., Kojima, S., Hirano, K., Kitano, H., Kasuga, S., Endo, T., Fukuda, H., and *Makino, A. (2016) Growth properties and biomass production in the hybrid C4 crop sorghum bicolor. Plant Cell Physiol., 57, 944-952.
    https://academic.oup.com/pcp/article/57/5/944/2223176
    Zeng, J., Ding, Q., Fukuda, H., and *He, X.-Q. (2016) Fertilization Independent Endosperm genes repress NbGH3.6 and regulate the auxin level during shoot development in Nicotiana benthamiana. J. Exp. Bot., 67, 2207-2217.
    http://jxb.oxfordjournals.org/content/67/8/2207
    Endo, M., Shimizu, H., and Araki, T. (2016) Rapid and simple isolation of vascular, epidermal and mesophyll cells from plant leaf tissue. Nature Protocols, 11, 1388-1395.
    https://www.nature.com/articles/nprot.2016.083
    Shimizu, H., Torii, K., Araki, T., and *Endo, M. (2016) Importance of epidermal clocks for regulation of hypocotyl elongation through PIF4 and IAA29. Plant Signal. Behav., 11, e1143999 (3 pages).
    https://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/15592324.2016.1143999
    Higo, A., Niwa, M., Yamato, K. T., Yamada, L., Sawada, H., Sakamoto, T., Kurata, T., Shirakawa, M., Endo, M., Shigenobu, S., Yamaguchi, K., Ishizaki, K., Nishihama, R., Kohchi, T., and *Araki, T. (2016) Transcriptional framework of male gametogenesis in the liverwort Marchantia polymorpha L. Plant Cell Physiol., 57, 325-338.
    https://academic.oup.com/pcp/article/57/2/325/2461069
    Endo, M., Araki, T., and *Nagatani, A. (2016) Tissue-specific regulation of flowering by photoreceptors. Cell Mol. Life Sci., 73, 829-839.
    https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs00018-015-2095-8
    総説論文
    Fukuda, H. (2016) Signaling, transcriptional regulation, and asynchronous pattern formation governing plant xylem development. P. Jpn Acad. B-Phys., 92, 98-107.
    https://www.jstage.jst.go.jp/article/pjab/92/3/92_PJA9203B-02/_html/-char/en
    *Ohashi-Ito, K. and Fukuda, H. (2016) Functional mechanism of bHLH complexes during early vascular development. Curr. Opin. Plant Biol., 33, 42-47.
    http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1369526616300863
    *Endo, M. (2016) Tissue-specific circadian clocks in plants. Curr. Opin. Plant Biol., 29, 44-49.
    http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1369526615001727
    日本語著書・解説
    *福田裕穂、近藤侑貴、小澤靖子、岩本訓知、小田祥久 (2016) 木部細胞分化誘導、植物細胞壁実験法(石井忠他編)、弘前大学出版会、221-229.
    東京大学生命科学教科書編集委員会編 (2016) 演習で学ぶ生命科学-物理・化学・数理からみる生命科学入門、203.
    *福田裕穂 (2016) 学問ってスゴイ、維管束細胞の研究、My Vision、2016 (2) 6-7.
    *福田裕穂 (2016) 理学への招待 II-理学の楽しみ-、教養学部報、583、5-6.
    *福田裕穂 (2016) 理学部の魅力って何?-「無から問いをつくる力」、それは失敗の繰り返しから-、蛍雪時代8月号付録, 全国大学理学部・工学部系統の総合的研究、16-18.
    古藤 知子、清水 華子、遠藤求 (2016) 植物における非集中型の概日時計システム、化学と生物、54 (7) 461-463.
    遠藤求 (2016) 植物の体内時計はどこにある?、じっきょう理科資料、78、1.
    プレスリリース
    植物のホルモンTDIFとその受容体TDRの複合体の「かたち」を解明 (2016年8月8日)
    http://www.s.u-tokyo.ac.jp/ja/info/4979/
    維管束の細胞を作り出す方法“VISUAL”の開発 (2016年5月20日)
    http://www.s.u-tokyo.ac.jp/ja/press/2016/4689/
    新聞ネット記事・テレビ報道
    日経産業新聞(2016年5月24日)篩管細胞、葉で増殖。栄養運搬、仕組み解明に道。東大が技術
    科学新聞(2016年7月15日)ゴットフリード・ワグネル賞 -3部門で若手研究者3氏に-
  • -2015年-
    原著論文
    Katayama, H., Iwamoto, K., Kariya, Y., Asakawa, T., Kan, T., Fukuda, H., and Ohashi-Ito, K. (2015) A negative feedback loop controlling bHLH complexes is involved in vascular cell division and differentiation in the root apical meristem. Curr. Biol. 25, 3144-3150.
    https://www.cell.com/current-biology/fulltext/S0960-9822(15)01345-7
    Shinohara, N., Kakegawa, K., and Fukuda, H. (2015) Monoclonal antibody-based analysis of cell wall remodeling during xylogenesis. J. Plant Res. 128, 975-986.
    https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs10265-015-0758-z
    Kondo, Y., Fujita, T., Sugiyama, M., and Fukuda, H. (2015) A novel system for xylem cell differentiation in Arabidopsis thaliana. Mol. Plant, 8, 612-621.
    http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1674205214000264
    Kawamoto, N., Endo, M., and *Araki, T. (2015) Expression of a kinase-dead form of CPK33 involved in florigen complex formation causes delayed flowering. Plant Signal. Behav., 10, e1086856, (2 pages).
    https://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/15592324.2015.1086856
    Shimizu, H., Katayama, K., Koto, T., Torii, K., Araki, T., and Endo, M. (2015) Decentralized circadian clocks process thermal and photoperiodic cues in specific tissues. Nature Plants, 1, 15163.
    http://www.nature.com/articles/nplants2015163
    Shimizu, H., Araki, T., and *Endo, M. (2015) Photoperiod sensitivity of the Arabidopsis circadian clock is tissue-specific. Plant Signal. Behav., 10, e1010933 (3 pages).
    http://www.tandfonline.com/doi/abs/10.1080/15592324.2015.1010933#.Vd_rJdwVjoo
    Kawamoto, N., Sasabe, M., Endo, M., Machida, Y., and *Araki, T. (2015) Calcium-dependent protein kinases responsible for the phosphorylation of a bZIP transcription factor FD crucial for the florigen complex formation. Sci. Rep., 5, 8341 (9 pages).
    https://www.nature.com/articles/srep08341
    総説論文
    Kondo, Y. and Fukuda, H. (2015) The TDIF signaling network. Curr. Opin. Plant. Biol., 28, 106-10.
    http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1369526615001508
    新聞ネット記事・テレビ報道
    Nature Plants, News & Views. 2015年11月「Who knows where the time goes.」
    京都新聞 2015年11月3日「植物 組織ごとに体内時計、京大グループ解明 成長制御 技術に光」
    JST サイエンスポータル 2015年12月14日「存戦略を反映? 動物と違う植物の体内時 計 - 動物には指揮者が1 人、植物にはあちこちに ?」

篠崎班

  • -2019年-
    原著論文
    #Uehara, T. N., #Mizutani, Y., Kuwata, K., Hirota, T., Sato, A., Mizoi, J., Takao, S., Matsuo, H., Suzuki, T., Ito, S., Saito, A. N., Nishiwaki-Ohkawa, T., Yamaguchi-Shinozaki, K., Yoshimura, T., Kay, S. A., Itami, K., Kinoshita, T., *Yamaguchi, J., and *Nakamichi, N (2019) Casein kinase 1 family regulates PRR5 and TOC1 in the Arabidopsis circadian clock. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 116, 11528-11536.
    https://doi.org/10.1073/pnas.1903357116
    Sato, H., Suzuki, T., Takahashi, F., Shinozaki, K, and *Yamaguchi-Shinozaki, K. (2019) NF-YB2 and NF-YB3 have functionally diverged and differentially induce drought and heat stress-specific genes. Plant Physiol., 180, 1677-1690.
    https://doi.org/10.1104/pp.19.00391
    Morimoto, K., Cole, K. S., Kourelis, J., Witt, C. H., Brown, D., Krahn, D., Stegmann, M., Kaschani, F., Kaiser, M., Burton, J., Mohammed, S., Yamaguchi-Shinozaki, K., Weerapana, E., and *van der Hoorn, R. A. L. (2019) Triazine probes targeting ascorbate peroxidases in plants. Plant Physiol., 180, 1848-1859.
    https://doi.org/10.1104/pp.19.00481
    Yoshida, T., Obata, T., Feil, R., Lunn, J. E., Fujita, Y., Yamaguchi-Shinozaki, K., and *Fernie, A. R. (2019) The role of abscisic acid signaling in maintaining the metabolic balance required for Arabidopsis growth under non-stress conditions. Plant Cell, 31, 84-105.
    http://www.plantcell.org/content/31/1/84
    Mizoi, J., Kanazawa, N., Kidokoro, S., Takahashi, F., Qin, F., Morimoto, K., Shinozaki, K., and *Yamaguchi-Shinozaki, K. (2019) Heat-induced inhibition of phosphorylation of the stress-protective transcription factor DREB2A promotes thermotolerance of Arabidopsis thaliana. J. Biol. Chem., 294, 902-917.
    https://doi.org/10.1074/JBC.RA118.002662
    Kudo, M., Kidokoro, S., Yoshida, T., Mizoi, J., Kojima, M., Takebayashi, Y., Sakakibara, H., Fernie, A. R., and *Yamaguchi-Shinozaki, K. (2019) A gene-stacking approach to overcome the trade-off between drought stress tolerance and growth in Arabidopsis. Plant J., 97, 240-256. [プレスリリース][新聞ネット記事]
    https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/tpj.14110
    Tang, Z., Xu, M., Ito, H., Cai, J., Ma, X., *Qin, J., *Yu, D., and *Meng, Y. (2019) Deciphering the non-coding RNA-level response to arsenic stress in rice (Oryza sativa). Plant Signal. Behav., 14, 1629268 (11 pages).
    https://doi.org/10.1080/15592324.2019.1629268
    Yu, D., Lu, J., Shao, W., Ma, X., *Xie, T., Ito, H., *Wang, T., Xu, M., Wang, H., and *Meng, Y. (2019) MepmiRDB: a medicinal plant microRNA database. DATABASE, 2019, baz070 (6 pages).
    https://doi.org/10.1093/database/baz070
    Yu, D., Wan, Y.,Ito, H., Ma, X., Xie, T., Wang, T., Shao, C., and *Meng, Y. (2019) PmiRDiscVali: an integrated pipeline for plant microRNA discovery and validation. BMC Genomics, 20, 133 (7 pages).
    https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-019-5478-7
    総説論文
    Yoshida, T., Christmann, A., Yamaguchi-Shinozaki, K., Grill, E., and *Fernie, A. R. (2019) Revisiting the basal role of ABA ? Roles outside of stress. Trends Plant Sci., 24, 625-635.
    https://doi.org/10.1016/j.tplants.2019.04.008
    英語著書
    *Todaka, D., Takahashi, F., Yamaguchi-Shinozaki, K., and Shinozaki, K. (2019) Chapter Three - ABA-responsive gene expression in response to drought stress: cellular regulation and long-distance signaling. In "Advances in Botanical Research vol. 92" edited by Marion-Poll, A. and Seo, M. ELSEVIER, 83-113.
    https://doi.org/10.1016/bs.abr.2019.05.001
  • -2018年-
    原著論文
    *Sato, H., Takasaki, H., Takahashi, F., Suzuki, T., Iuchi, S., Mitsuda, N., Ohme-Takagi, M., Ikeda, M., Seo, M., Yamaguchi-Shinozaki, K., and *Shinozaki, K. (2018) Arabidopsis thaliana NGATHA1 transcription factor induces ABA biosynthesis by activating NCED3 gene during dehydration stress. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 115, E11178-E11187.
    http://www.pnas.org/content/115/47/E11178.full
    Kim, J. S., Yamaguchi-Shinozaki, K., and *Shinozaki, K. (2018) ER-anchored transcription factors bZIP17 and bZIP28 regulate root elongation. Plant Physiol., 176, 2221-2230.
    http://www.plantphysiol.org/content/176/3/2221.long
    *Takahashi, F., Suzuki, T., Osakabe, Y., Betsuyaku, S., Kondo, Y., Dohmae, N., Fukuda, H., Yamaguchi-Shinozaki, K., and *Shinozaki, K. (2018) A small peptide modulates stomatal control via abscisic acid in long-distance signaling. Nature, 556, 235-238.
    https://www.nature.com/articles/s41586-018-0009-2
    Yu, D., Xu, M., Ito, H., Shao, W., Ma, X., Wang, H., and *Meng, Y. (2018) Tracking microRNA processing signals by degradome sequencing data analysis. Front. Genet., 9, 546 (13 pages).
    https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fgene.2018.00546/full
    Masuta, Y., Kawabe, A., Nozawa, K., Naito, K., Kato, A., and *Ito, H. (2018) Characterization of a heat-activated retrotransposon in Vigna angularis. Breed. Sci., 68, 168-176.
    https://www.jstage.jst.go.jp/article/jsbbs/68/2/68_17085/_article
    プレスリリース
    バイオマス生産性を向上させた環境ストレス耐性植物の開発-干ばつや寒波による作物の減収の改善に期待-(2018年10月4日)
    http://www.a.u-tokyo.ac.jp/topics/2018/20181004-1.html
    新聞ネット記事・テレビ報道
    中日新聞(2018年10月4日)過酷環境、耐える遺伝子
    東京新聞(2018年10月1日)過酷環境、耐える遺伝子
  • -2017年-
    原著論文
    Yamada, K., Osakabe, Y., and *Yamaguchi-Shinozaki, K. (2017) A C-terminal motif contributes to the plasma membrane localization of Arabidopsis STP transporters. PLOS ONE, 12, e0186326 (13 pages).
    http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0186326
    #Morimoto, K., #Ohama, N., Kidokoro, S., Mizoi, J., Takahashi, F., Todaka, D., Mogami, J., Sato, H., Qin, F., Kim, J. S., Fukao, Y., Fujiwara, M., Shinozaki, K., and *Yamaguchi-Shinozaki, K. (2017) BPM-CUL3 E3 ligase modulates thermotolerance by facilitating negative regulatory domain-mediated degradation of DREB2A in Arabidopsis. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 114, E8528-E8536. [プレスリリース]
    http://www.pnas.org/content/114/40/E8528.full
    #Sakuraba, Y., #Kim, E. Y., Han, S. H., Piao, W., An, G., Todaka, D., Yamaguchi-Shinozaki, K., and *Paek, N. C. (2017) Rice Phytochrome-Interacting Factor-Like1 (OsPIL1) is involved in the promotion of chlorophyll biosynthesis through feed-forward regulatory loops. J. Exp. Bot., 68, 4103-4114.
    https://academic.oup.com/jxb/article/68/15/4103/3952689/Rice-PhytochromeInteracting-FactorLike1-OsPIL1-is
    Kidokoro, S., Yoneda, K., Takasaki, H., Takahashi, F., Shinozaki, K., and *Yamaguchi-Shinozaki, K. (2017) Different cold-signaling pathways function in the responses to rapid and gradual decreases in temperature. Plant Cell, 29, 760-774.[プレスリリース]
    http://www.plantcell.org/content/29/4/760
    Todaka, D., Zhao, Y., Yoshida, T., Kudo, M., Kidokoro, S., Mizoi, J., Kodaira, K. S., Takebayashi, Y., Kojima, M., Sakakibara, H., Toyooka, K., Sato, M., Fernie, A. R., Shinozaki, K., and *Yamaguchi-Shinozaki, K. (2017) Temporal and spatial changes in gene expression, metabolite accumulation and phytohormone content in rice seedlings grown under drought stress conditions. Plant J., 90, 61-78.
    http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/tpj.13468/full
    Urano, K., Maruyama, K., Jikumaru, Y., Kamiya, Y., Yamaguchi-Shinozaki, K., and *Shinozaki, K. (2017) Analysis of plant hormone profiles in response to moderate dehydration stress. Plant J., 90, 17-36.
    http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/tpj.13460/full
    #Soma, F., #Mogami, J., Yoshida, T., Abekura, M., Takahashi, F., Kidokoro, S., Mizoi, J., Shinozaki, K., and *Yamaguchi-Shinozaki, K. (2017) ABA-unresponsive SnRK2 protein kinases regulate mRNA decay under osmotic stress in plants, Nature Plants, 3, 16204 (8 pages). [プレスリリース]
    http://www.nature.com/articles/nplants2016204
    *Maruyama, K., Ogata, T., Kanamori, N., Yoshiwara, K., Goto, S., Yamamoto, Y. Y., Tokoro, Y., Noda, C., Takaki, Y., Urawa, H., Iuchi, S., Urano, K., Yoshida, T., Sakurai, T., Kojima, M., Sakakibara, H., Shinozaki, K., and Yamaguchi-Shinozaki, K. (2017) Design of an optimal promoter involved in the heat-induced transcriptional pathway in Arabidopsis, soybean, rice, and maize. Plant J., 89, 671-680. [プレスリリース]
    http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/tpj.13420/full
    Kudo, M., Kidokoro, S., Yoshida, T., Mizoi, J., Todaka, D., Fernie, A. R., Shinozaki, K., and *Yamaguchi-Shinozaki, K. (2017) Double overexpression of DREB and PIF transcription factors improves drought stress tolerance and cell elongation in transgenic plants. Plant Biotechnol. J., 15, 458-471.
    http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/pbi.12644/full
    Nozawa, K., Kawagishi, Y., Kawabe, A., Sato, M., Masuta, Y., Kato, A., and *Ito, H. (2017) Epigenetic regulation of a heat-activated retrotransposon in Cruciferous Vegetables. Epigenomes, 1, 7 (11 pages).
    https://www.mdpi.com/2075-4655/1/1/7/htm
    Masuta, Y., Nozawa, K., Takagi, H., Yaegashi, H., Tanaka, K., Ito, T., Saito, H., Kobayashi, H., Matsunaga, W., Masuda, S., Kato, A., and *Ito, H. (2017) Inducible transposition of a heat-activated retrotransposon in tissue culture. Plant cell physiol., 58, 375-384.
    https://academic.oup.com/pcp/article/58/2/375/2737549
    総説論文
    #Ohama, N., #Sato, H., Shinozaki, K., and *Yamaguchi-Shinozaki, K. (2017) Transcriptional regulatory network of plant heat stress response. Trends Plant Sci., 22, 53-65.
    http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1360138516301261
    日本語著書・解説
    *角谷徹仁、伊藤秀臣 (2017) トランスポゾン:ゲノム中を動く遺伝子─ゲノム進化の牽引者、生物の科学 遺伝、71 (4) 319-324.
    *伊藤秀臣 (2017) 環境ストレスと進化:ストレス活性型トランスポゾンと宿主の関係、エピジェネティクスの生態学:環境に応答して遺伝子を調節するしくみ(文一総合出版)第4章、101-116.
    プレスリリース
    植物に乾燥・高温耐性を付与する転写因子DREB2Aが活性化する仕組みを解明 - 干ばつや高温に強い作物の開発に期待 -(2017年9月19日)
    http://www.a.u-tokyo.ac.jp/topics/2017/20170919-1.html
    植物は2つの異なる応答機構によって低温ストレスに対する耐性を獲得している(2017年3月27日)
    http://www.a.u-tokyo.ac.jp/topics/2017/20170330-2.html
    植物の水分欠乏時の成長促進機構の発見 -作物の乾燥や塩ストレス時の成長や収穫を向上させる技術開発への貢献に期待-(2017年1月11日)
    https://www.a.u-tokyo.ac.jp/topics/2017/20170111.html
    新聞ネット記事・テレビ報道
    化学工業日報(2017年9月19日)植物転写因子DREB2A 東大など 活性化の仕組み解明 乾燥・高温耐性応用へ
    日経産業新聞(2017年1月12日)乾燥に強い植物解明 東大など
    日経バイオテク電子版(2017年1月12日)国立大学法人東京大学、植物の水分欠乏時の成長促進機構の発見
    https://bio.nikkeibp.co.jp/atcl/release/17/01/12/03330/
    日本工業新聞(2017年1月9日)東大、植物の水分欠乏時に成長促す仕組み発見
    日本経済新聞(2017年1月7日)東大と理研、植物の水分欠乏時の成長促進機構を発見
  • -2016年-
    原著論文
    Shimazaki, T., Endo, T., Kasuga, M., Yamaguchi-Shinozaki, K., Watanabe, K. N., and *Kikuchi, A. (2016) Evaluation of the yield of abiotic-stress-tolerant AtDREB1A transgenic potato under saline conditions in advance of field trials. Breed. Sci., 66, 703-710.
    https://www.jstage.jst.go.jp/article/jsbbs/66/5/66_16054/_html
    Honna, P. T., Fuganti-Pagliarini, R., Ferreira, L. C., Molinari, M. D. C., Marin, S. R. R., de Oliveira, M. C. N., Farias, J. R. B., Neumaier, N., Mertz-Henning, L. M., Kanamori, N., Nakashima, K., Takasaki, H., Urano, K., Shinozaki, K., Yamaguchi-Shinozaki, K., Desidério, J. A., and *Nepomuceno, A. L. (2016) Molecular, physiological, and agronomical characterization, in greenhouse and in field conditions, of soybean plants genetically modified with AtGolS2 gene for drought tolerance. Mol. Breed., 36, 157 (17 pages).
    http://link.springer.com/article/10.1007/s11032-016-0570-z
    Sato, H., Todaka, D., Kudo, M., Mizoi, J., Kidokoro, S., Zhao, Y., Shinozaki, K., and *Yamaguchi-Shinozaki, K. (2016) The Arabidopsis transcriptional regulator DPB3-1 enhances heat stress tolerance without growth retardation in rice. Plant Biotechnol. J., 14, 1756-1767. [プレスリリース]
    http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/pbi.12535/full
    Ohama, N., Kusakabe, K., Mizoi, J., Zhao, H., Kidokoro, S., Koizumi, S., Takahashi, F., Ishida, T., Yanagisawa, S., Shinozaki, K., and *Yamaguchi-Shinozaki, K. (2016) The transcriptional cascade in the heat stress response of Arabidopsis is strictly regulated at the level of transcription factor expression. Plant Cell, 28, 181-201.[プレスリリース]
    http://www.plantcell.org/content/28/1/181
    In Briefで紹介されました。
    *Ito, H., Kim, J. M., Matsunaga, W., Saze, H., Matsui, A., Endo, T. A., Harukawa, Y., Takagi, H., Yaegashi, H., Masuta, Y., Masuda, S., Ishida, J., Tanaka, M., Takahashi, S., Morosawa, T., Toyoda, T., Kakutani, T., Kato, A., and Seki, M. (2016) A stress-activated transposon in Arabidopsis induces transgenerational abscisic acid insensitivity. Sci. Rep., 6, 23181 (12 pages).
    http://www.nature.com/articles/srep23181
    Masuda, S., Nozawa, K., Matsunaga, W., Masuta, Y., Kawabe, A., Kato, A., and *Ito, H. (2016) Characterization of a heat-activated retrotransposon in natural accessions of Arabidopsis thaliana. Genes Genet. Syst., 91, 293-299.
    https://www.jstage.jst.go.jp/article/ggs/91/6/91_16-00045/_article
    プレスリリース
    高温で働く遺伝子スイッチがデザイン可能に - 目的の遺伝子発現を温度でコントロール -(2016年11月17日)
    https://www.jircas.go.jp/ja/release/2016/press08
    イネの高温ストレス耐性を向上する方法の開発 - 温暖化や熱波による農作物の収量低下を防ぐ技術応用に期待 -(2016年2月4日)
    http://www.a.u-tokyo.ac.jp/topics/2016/20160204-1.html
    植物の高温に対する初期応答のメカニズムを解明 - 作物の高温ストレス耐性を向上させる技術開発への貢献に期待 -(2016年1月5日)
    http://www.a.u-tokyo.ac.jp/topics/2016/20160105-1.html
    新聞ネット記事・テレビ報道
    TBSテレビ「未来の起源」出演(2016年4月17日)
    植物の高温ストレスに対する感知応答メカニズムについて研究成果を話しました。
    日経バイオテク(2016年2月18日)植物の高温ストレス耐性を高める新遺伝子戦略
  • -2015年-
    原著論文
    Takasaki, H., Maruyama, K., Takahashi, F., Fujita, M., Yoshida, T., Nakashima, K., Myouga, F., Toyooka, K., *Yamaguchi-Shinozaki, K., and *Shinozaki, K. (2015) SNAC-As, stress-responsive NAC transcription factors, mediate ABA-inducible leaf senescence. Plant J., 84, 1114-1123.[プレスリリース]
    http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/tpj.13067/full
    Kato, H., Komeda, Y., Saito, T., Ito, H., and *Kato, A. (2015) Role of the ACL2 locus in flower stalk elongation in Arabidopsis thaliana. Genes Genet. Syst., 90, 163-174.
    https://www.jstage.jst.go.jp/article/ggs/90/3/90_163/_html/-char/en
    Shida, T., Fukuda, A., Saito, T., Ito, H., and *Kato, A. (2015) AtRBP1, which encodes an RNA-binding protein containing RNA-recognition motifs, regulates root growth in Arabidopsis thaliana. Plant Physiol. Biochem., 92, 62-70.
    http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0981942815300103
    Matsunaga, W., Ohama, N., Tanabe, N., Masuta, Y., Masuda, S., Mitani-Umeno, N., *Yamaguchi-Shinozaki, K., Ma, J. F., Kato, A., and *Ito, H. (2015) A small RNA mediated regulation of a stress-activated retrotransposon and the tissue specific transposition during the reproductive period in Arabidopsis. Front. Plant Sci., 6, 48 (12 pages).
    https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpls.2015.00048/full
    総説論文
    Yoshida, T., Mogami, J., and *Yamaguchi-Shinozaki, K. (2015) Omics approaches toward defining the comprehensive abscisic acid signaling network in plants.
    Plant Cell Physiol., 56, 1043-1052.
    https://academic.oup.com/pcp/article/56/6/1043/1926357
    日本語著書・解説
    佐藤輝、篠崎和子 (2015) 植物の乾燥・高温応答の解明と再生作物の開発に向けて、
    Bio Industry、32 (12) 25-31.
    大濱直彦、篠崎和子 (2015) 高温環境を生き抜くための植物の転写制御機構、
    化学と生物、53 (10) 696-702.
    https://katosei.jsbba.or.jp/index.php?aid=459
    プレスリリース
    長期の乾燥による葉の黄化防止に関わる遺伝子を発見 - 作物の黄化制御技術の開発に応用 -(2015年11月27日)
    http://www.a.u-tokyo.ac.jp/topics/2015/20151127-1.html
    新聞ネット記事・テレビ報道
    日本農業新聞(2015年12月15日)干ばつ時でも植物の黄化抑制
    化学工業日報(2015年12月7日)乾燥による葉の黄化制御 理研が関与遺伝子発見
    日経電子版(2015年11月27日)理研と東大、長期の乾燥による葉の黄化防止に関わる遺伝子のメカニズムを解明 長期の乾燥による葉の黄化防止に関わる遺伝子を発見 -作物の黄化制御技術の開発に応用-

角谷班

  • -2019年-
    原著論文
    *Rymen, B., Kawamura, A., Lambolez, A., Inagaki, S., Takebayashi, A., Iwase, A., Sakamoto, Y., Sako, K., Favero, D. S., Ikeuchi, M., Suzuki, T., Seki, M., Kakutani, T., Roudier, F., and *Sugimoto, K. (2019) Histone acetylation orchestrates wound-induced transcriptional activation and cellular reprogramming in Arabidopsis. Commun. Biol., 2, 404 (15 pages).
    https://www.nature.com/articles/s42003-019-0646-5
    Ito, T., Nishio, H., Tarutani, Y., Emura, N., Honjo, M. N., Toyoda, A., Fujiyama, A., Kakutani, T., and *Kudoh, H. (2019) Seasonal stability and dynamics of DNA methylation in plants in a natural environment. Genes, 10, E544 (13 pages).
    https://www.mdpi.com/2073-4425/10/7/544
    #Ishihara, H., *#Sugimoto, K., Tarr, P. T., Temman, H., Kadokura, S., Inui, Y., Sakamoto, T., Sasaki, T., Aida, M., Suzuki, T., Inagaki, S., Morohashi, K., Seki, M., Kakutani, T., Meyerowitz, E. M., and *Matsunaga, S. (2019) Primed histone demethylation regulates shoot regenerative competency. Nature Commun., 10, 1786 (15 pages).
    https://www.nature.com/articles/s41467-019-09386-5
  • -2018年-
    原著論文
    *Yoshida, T., Tarutani, Y., Kakutani, T., and *Kawabe, A. (2018) DNA methylation diversification at the integrated organellar DNA-like sequence. Genes, 9, E602 (11 pages).
    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6316516/
  • -2017年-
    原著論文
    *#Hosaka, A., #Saito, R., Takashima, K., Sasaki, T., Fu, Y., Kawabe, A., Ito, T., Toyoda, A., Fujiyama, A., Tarutani, Y., and *Kakutani, T. (2017) Evolution of sequence-specific anti-silencing systems in Arabidopsis. Nature Commun., 8, 2161 (10 pages).
    https://www.nature.com/articles/s41467-017-02150-7
    *Inagaki, S., Takahashi, M., Hosaka, A., Ito, T., Toyoda, A., Fujiyama, A., Tarutani, Y., and *Kakutani, T. (2017) Gene-body chromatin modification dynamics mediate epigenome differentiation in Arabidopsis. EMBO J., 36, 970-980.
    http://emboj.embopress.org/content/36/8/970.full
  • -2016年-
    Original papers
    *Ito, H., Kim, J. M., Matsunaga, W., Saze, H., Matsui, A., Endo, T. A., Harukawa, Y., Takagi, H., Yaegashi, H., Masuta, Y., Masuda, S., Ishida, J., Tanaka, M., Takahashi, S., Morosawa, T., Toyoda, T., Kakutani, T., Kato, A., and Seki, M. (2016) A stress-activated transposon in Arabidopsis induces transgenerational abscisic acid insensitivity. Sci. Rep., 6, 23181 (12 pages).
    http://www.nature.com/articles/srep23181
  • -2015年-
    原著論文
    *#Ito, T., #Tarutani, Y., #To, T. K., Kassam, M., Duvernois-Berthet, E., Cortijo, S., Takashima, K., Saze, H., Toyoda, A., Fujiyama, A., Colot, V., and *Kakutani, T. (2015) Genome-wide negative feedback drives transgenerational DNA methylation dynamics in Arabidopsis. PLoS Genet., 11, e1005154 (26 pages).
    http://journals.plos.org/plosgenetics/article?id=10.1371/journal.pgen.1005154
    総説論文
    #To, T. K., #Saze, H., and *Kakutani, T. (2015) DNA methylation within transcribed regions. Plant Physiol., 168, 1219-1225.
    http://www.plantphysiol.org/content/168/4/1219

白須班

  • -2019年-
    原著論文
    #Motomura, K., #Arae, T., Uramoto, H. A., Suzuki, Y., Takeuchi, H., Suzuki, T., Ichihashi, Y., Shibata, A., Shirasu, K., Takeda, A., Higashiyama, T., and *Chiba, Y. (2019) AtNOT1 is a novel regulator of gene expression during pollen development. Plant Cell Physiol., in press.
    https://doi.org/10.1093/pcp/pcz235
    Yoshida, S., Kim, S., Wafula, E. K., Tanskanen, J., Kim, Y. M., Honaas, L., Yang, Z., Spallek, T., Conn, C. E., Ichihashi, Y., Cheong, K., Cui, S., Der, J. P., Gundlach, H., Jiao, Y., Hori, C., Ishida, J. K., Kasahara, H., Kiba, T., Kim, M. S., Koo, N., Laohavisit, A., Lee, Y. H., Lumba, S., McCourt, P., Mortimer, J. C., Mutuku, J. M., Nomura, T., Sekimoto, Y. S., Seto, Y., Wang, Y., Wakatake, T., Sakakibara, H., Demura, T., Yamaguchi, S., Yoneyama, K., Manabe, R., Nelson, D. C., Schulman, A. H., Timko, M. P., dePamphilis, C. W., Choi, D., and *Shirasu, K. (2019) Genome sequence of Striga asiatica provides insight into the evolution of plant parasitism. Curr. Biol., 29, 3041-3052. [プレスリリース]
    https://doi.org/10.1016/j.cub.2019.07.086
    プレスリリース
    病害寄生雑草ストライガの全ゲノム解読に成功 -アフリカを襲う農業被害の撲滅に光-(2019年9月13日)
    http://www.riken.jp/pr/press/2019/20190913_1/
  • -2018年-
    原著論文
    Kadota, Y., Liebrand, T. W. H., Goto, Y., Sklenar, J., Derbyshire, P., Menke, F. L. H., Torres, M. A., Molina, A., Zipfel, C., *Coaker, G., and *Shirasu, K. (2018) Quantitative phosphoproteomic analysis reveals common regulatory mechanisms between effector‐ and PAMP‐triggered immunity in plants. New Phytol., 221, 2160-2175.
    https://doi.org/10.1111/nph.15523
    Mutuku, J. M., Cui, S., Hori, C., Takeda, Y., Tobimatsu, Y., Nakabayashi, R., Mori, T., Saito, K., Demura, T., Umezawa, T., Yoshida, S., and *Shirasu, K. (2018) The structural integrity of lignin is crucial for resistance against Striga hermonthica parasitism in rice. Plant Physiol., 179, 1796-1809.
    https://doi.org/10.1104/pp.18.01133
    *Asai, S., Furzer, O. J., Cevik, V., Kim, D. S., Ishaque, N., Goritschnig, S., Staskawicz, B. J., Shirasu, K., and *Jones, J. D. G. (2018) A downy mildew effector evades recognition by polymorphism of expression and subcellular localization. Nature Commun., 9, 5192 (11 pages). [プレスリリース]
    https://www.nature.com/articles/s41467-018-07469-3
    *Noutoshi, Y. and *Shirasu, K. (2018) A high-throughput chemical screening method for inhibitors and potentiators of hypersensitive cell death using suspension cell culture of Arabidopsis thaliana. Methods Mol. Biol., 1795, 39-47.
    https://link.springer.com/protocol/10.1007%2F978-1-4939-7874-8_4
    Wakatake, T., Yoshida, S., and *Shirasu, K. (2018) Induced cell fate transitions at multiple cell layers configure haustorium development in parasitic plants. Development, 145, dev164848 (11 pages). [ハイライト] [インタビュー]
    http://dev.biologists.org/content/145/14/dev164848
    *Ichihashi, Y., Kusano, M., Kobayashi, M., Suetsugu, K., Yoshida, S., Wakatake, T., Kumaishi, K., Shibata, A., Saito, K., and *Shirasu, K. (2018) Transcriptomic and metabolomic reprogramming from roots to haustoria in the parasitic plant, Thesium chinense. Plant Cell Physiol., 59, 729-738.
    https://academic.oup.com/pcp/advance-article/doi/10.1093/pcp/pcx200/4769293
    Sato, K., Kadota, Y., Gan, P., Bino, T., Uehara, T., Yamaguchi, K., Ichihashi, I., Maki, N., Iwahori, H., Suzuki, T., *Shigenobu, S., and *Shirasu, K. (2018) High-quality genome sequence of the root-knot nematode Meloidogyne arenaria genotype A2-O. Genome Announc., 6, e00519-18 (2 pages).
    https://mra.asm.org/content/6/26/e00519-18
    Cui, S., Wada, S., Tobimatsu, Y., Takeda, Y., Saucet, S. B., Takano, T., Umezawa, T., Shirasu, K., and *Yoshida, S. (2018) Host lignin composition affects haustorium induction in the parasitic plants Phtheirospermum japonicum and Striga hermonthica. New Phytol., 218, 710-723.
    https://nph.onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/nph.15033
    Uemura, A., Yamaguchi, N, Xu, Y., Wee, W., Ichihashi, Y., Suzuki, T., Shibata, A., Shirasu, K., and *Ito, T. (2018) Regulation of floral meristem activity through the interaction of AGAMOUS, SUPERMAN, and CLAVATA3 in Arabidopsis. Plant Reprod., 31, 89-105.
    https://link.springer.com/article/10.1007/s00497-017-0315-0
    *Ichihashi, Y., Fukushima, A., Shibata, A., and Shirasu, K. (2018) High impact gene discovery: simple strand-specific mRNA library construction and differential regulatory analysis based on gene co-expression network. Methods Mol. Biol., 1830, 163-189.
    https://link.springer.com/protocol/10.1007/978-1-4939-8657-6_11
    総説論文
    *Spallek, T., Gan, P., Kadota, Y., and *Shirasu, K. (2018) Same tune, different song - Cytokinins as virulence factors in plant-pathogen interactions? Curr. Opin. Plant Biol., 44, 82-87.
    https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1369526617301966
    日本語著書・解説
    白須賢(2018)比較ゲノミクスをベースにしたイチゴ炭疽病Colletotrichum gloeosporioides種複合体の解析、植物防疫、72、18-21.
    吉田聡子、白須賢(2018)寄生植物の宿主認識と感染機構、日植病報、84、267-274.
    プレスリリース
    植物病原菌の巧妙な認識回避機構 -植物と病原菌の攻防における共進化の一端を解明-(2018年12月5日)
    http://www.riken.jp/pr/press/2018/20181205_1/
  • -2017年-
    原著論文
    Ishida, J. K., Yoshida, S., and *Shirasu, K. (2017) Quinone oxidoreductase 2 is involved in haustorium development of the parasitic plant Phtheirospermum japonicum. Plant Signal. Behav., 12, e1319029 (4 pages) .
    http://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/15592324.2017.1319029
    Xu, B., Cheval, C., Laohavisit, A.,Hocking, B., Chiasson, D., Olsson, T. S. G., *Shirasu, K., Faulkner, C., and Gilliham, M. (2017) A calmodulin-like protein regulates plasmodesmal closure during bacterial immune responses. New Phytol., 215, 77-84.
    http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/nph.14599/full
    Ishida, J. K., Yoshida, S., and *Shirasu, K. (2017) Haustorium induction assay of the parasitic plant Phtheirospermum japonicum. Bio-protocol, 7, e2260 (9 pages).
    http://www.bio-protocol.org/e2260
    Gan, P., Nakata, N., Suzuki, T., and *Shirasu, K. (2017) Markers to differentiate species of anthracnose fungi identify Colletotrichum fructicola as the predominant virulent species in strawberry plants in Chiba Prefecture of Japan. J. Gen. Plant Path., 83, 14-22.
    https://link.springer.com/article/10.1007/s10327-016-0689-0
    Gan, P., Narusaka, M., Tsushima, A., Narusaka, Y., Takano, Y., and *Shirasu, K. (2017) Draft genome assembly of Colletotrichum chlorophyti, a pathogen of herbaceous plants. Genome Announc., 5, e01733-16.
    https://mra.asm.org/content/5/10/e01733-16
    #Spallek, T., #Melnyk, C. W., Wakatake, T., Zhang, J., Sakamoto, Y., Kiba, T., Yoshida, S., Matsunaga, S., Sakakibara, H., and *Shirasu, K. (2017) Interspecies hormonal control of host root morphology by parasitic plants. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 114, 5283-5288. [プレスリリース]
    http://www.pnas.org/content/114/20/5283
    総説論文
    *López-Ráez, J. A., Shirasu, K., and Foo, E. (2017) Strigolactones in plant interactions with beneficial and detrimental organisms: the yin and yang. Trends in Plant Sci., 22, 527-537.
    http://www.cell.com/trends/plant-science/abstract/S1360-1385(17)30062-6
    プレスリリース
    寄生植物は植物ホルモンを使い宿主を太らせる - 植物間のサイトカイニン輸送を発見 - (2017年5月2日) http://www.a.u-tokyo.ac.jp/topics/2016/20160204-1.html
    新聞ネット記事・テレビ報道
    毎日新聞(2017年5月10日)自分の成長ホルモン注入 宿主を「育成」
    化学工業日報(2017年5月2日)ホルモンで宿主を操作 寄生植物の機序発見
  • -2016年-
    原著論文
    Yamada, K., Yamaguchi, K., Shirakawa, T., Nakagami, H., Mine, A., Ishikawa, K., Fujiwara, M., Narusaka, M., Narusaka, Y., Ichimura, K., Kobayashi, Y., Matsui, H., Nomura, Y., Nomoto, M., Tada, Y., Fukao, Y., Fukamizo, T., Tsuda, K., Shirasu, K., Shibuya, N., and *Kawasaki, T. (2016) The Arabidopsis CERK1-associated kinase PBL27 connects chitin perception to MAPK activation. EMBO J., 35, 2468-2483.
    http://emboj.embopress.org/content/35/22/2468
    Saucet, S. B. and *Shirasu, K. (2016) Molecular parasitic plant-host interactions. PLoS Pathog., 12, e1005978 (6 pages).
    http://journals.plos.org/plospathogens/article?id=10.1371/journal.ppat.1005978
    Ishida, J. K., Wakatake, T., Yoshida, S., Takebayashi, Y., Kasahara, H., Wafula, E., dePamphilis, C. W., Namba, S., and *Shirasu, K. (2016) Local auxin biosynthesis mediated by a YUCCA flavin monooxygenase regulates the haustorium development in the parasitic plant Phtheirospermum japonicum. Plant Cell, 28, 1795-1814.
    http://www.plantcell.org/content/28/8/1795
    Gan, P., Narusaka, M., Kumakura, N., Tsushima, A., Takano, Y., Narusaka, Y., and *Shirasu, K. (2016) Genus-wide comparative genome analyses of Colletotrichum species reveal specific gene family losses and gains during adaptation to specific infection lifestyles. Genome Biol. Evol., 8, 1467-1481.
    https://academic.oup.com/gbe/article/8/5/1467/2939589
    Cui, S., Wakatake, T., Hashimoto, K., Saucet, S. B., Toyooka, K., *Yoshida, S., and *Shirasu, K. (2016) Haustorial hairs are specialized root hairs that support parasitism in the facultative parasitic plant, Phtheirospermum japonicum. Plant Physiol., 170, 1492-1503.
    http://www.plantphysiol.org/content/170/3/1492.full
    総説論文
    Yoshida, S., Cui, S., Ichihashi, Y., and Shirasu, K. (2016) The haustorium, a specialized invasive organ in parasitic plants. Annu. Rev. Plant Biol., 67, 643-667.
    https://doi.org/10.1146/annurev-arplant-043015-111702
    日本語著書・解説
    若竹崇雅、吉田聡子、白須賢 (2016) 根寄生植物の寄生メカニズム ~ ゲノム解読とモデル実験系の確立で農業被害の撲滅に道、生物の科学、遺伝、70 (4) 289-293.
    新聞ネット記事・テレビ報道
    Plant Cell (2016年12月15日) Best of 2016: Top Topics in The Plant Cell journal
    http://blog.aspb.org/2016/12/15/best-of-2016-top-topics-in-the-plant-cell-journal/
    RIKEN RESEARCH (2016年10月14日) Pinning down parasitic plants - A key player in the infection mechanism of parasitic plants has been identified
    http://www.riken.jp/en/research/rikenresearch/highlights/8268/
    科学新聞 (2016年7月29日) 「オーキシンの局所的生合成が重要 ~ 寄生植物侵入器官発生解明へ一歩」
    日経産業新聞 (2016年7月12日)「雑草寄生の仕組み解明 ~ 理研、農作物被害抑制の光」
    理化学研究所 環境資源科学研究センター ニュース (2016年4月15日) 科学技術の「美」パネル展 優秀作品に選出
    http://www.csrs.riken.jp/jp/news/160419/index.html
    Plant Science Today (2016年1月7日) “Characterization of parasitic plant mutants”, accessible research for undergraduate readers
    http://blog.aspb.org/2016/01/07/characterization-of-parasitic-plant-mutants-accessible-research-for-undergraduate-readers/
  • -2015年-
    原著論文
    Adachi, H., Nakano, T., Miyagawa., N., Ishihama, N., Yoshioka, M., Katou, Y., Yaeno, T., Shirasu, K., and *Yoshioka, H. (2015) WRKY transcription factors phosphorylated by MAPK regulate a plant immune NADPH oxidase in Nicotiana benthamiana. Plant Cell, 27, 2645-2663.
    http://www.plantcell.org/content/27/9/2645
    Conn, C. E., Bythell-Douglas, R., Neumann, D., Yoshida, S., Whittington, B., Westwood, J. H., Shirasu, K., Bond, C. S., Dyer, K. A., and *Nelson, D. C. (2015) Convergent evolution of strigolactone perception enabled host detection in parasitic plants. Science, 349, 540-543.[プレスリリース]
    http://www.sciencemag.org/content/349/6247/540.full
    Mutuku, J. M., Yoshida, S., Shimizu, T., Ichihashi, Y., Wakatake., T., Takahashi., A., Seo, M., and *Shirasu, K. The WRKY45-dependent signaling pathway is required for resistance against Striga hermonthica parasitism. (2015) Plant Physiol., 168, 1152-1163.
    http://www.plantphysiol.org/content/168/3/1152
    総説論文
    *Asai, S. and *Shirasu, K. (2015) Plant cells under siege: plant immune system versus pathogen effectors. Curr. Opin. Plant Biol., 28, 1-8.
    http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1369526615001284
    Ichihashi, Y., Mutuku, J. M., Yoshida, S., and *Shirasu, K. (2015) Transcriptomics exposes the uniqueness of parasitic plants. Brief. Funct. Genomics, 14, 275-282.
    https://academic.oup.com/bfg/article/14/4/275/202385
    *Kadota, Y., Shirasu, K., and Zipfel, C. (2015) Regulation of the NADPH oxidase RBOHD during plant immunity. Plant Cell Physiol., 56, 1472-1480.
    https://academic.oup.com/pcp/article/56/8/1472/1845322
    英語著書
    Mutuku, J. M., Spallek, T., and Shirasu, K. Striga: physiology, effects, and genomics. (2015) YEARBOOK OF SCIENCE & TECHNOLOGY, 312-314.
    プレスリリース
    寄生植物の発芽誘導の仕組みを解明(2015年7月31日)
    http://www.riken.jp/pr/press/2015/20150731_1/
    新聞ネット記事・テレビ報道
    化学工業日報 (2015年8月6日) 寄生植物の発芽誘導受容体 理研 ― ジョージア大が発見